FuNGI

B0CYA5

Protein Details

Accession

B0CYA5

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
246-299	KSPNRRLSPPPSHKPSREKPKPRPIKKPQATTVDAPPKTTKKPNVPSTKKPHLP	Hydrophilic
816-838	DVVFVPQKPKPRPRPINKFSSSG	Hydrophilic
872-893	NGDVKSQRPKRPTAKKFPFDVD	Hydrophilic
967-987	SDASRMRKGRKIKKVESFMDI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
247-276	SPNRRLSPPPSHKPSREKPKPRPIKKPQAT
280-296	APPKTTKKPNVPSTKKP
794-805	SRGRRTRKGKAK
973-979	RKGRKIK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_323636 -
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MNERRGARKDLPVTTSRDLVSVPRDTTRFSVTCTTNWAQSPGLPYPGIPYVMESLESELQANAETLQTSTAVRLPKRHGLSMTAGVNGKAFMDLGGSQFEVGSSQTSLGTRKPMTTYTSRSKGKRSTRVVDSDSSSPDELDSLSQSDTHSPRKKPVQKFDEDVQAEPVGDEYATRAQKTSDAIKTLRFRKTGKTQPEASGSKAPPLKENEPRAVQDTGTFSKRSLASKATKPLLDYCETSRPLGDKSPNRRLSPPPSHKPSREKPKPRPIKKPQATTVDAPPKTTKKPNVPSTKKPHLPLPVKRATPPSEAEESRAMHSDSGIPSRTRLPEQFPFLSPTSQRTPRATPSSTMAAKFPLSPPKSRVEFPVPSPLASNDRGKKFASSAFLMPSPQSFDASSKGKGKALVVSAEDDEEDEDGNYGRKSQATRLEPFPMNTQMLRRTSSPSVQLSQAVKRNSDGIRSDGAAKKRRKDDEDDMLSSPPDDYAFEDGDDTLFISPFVDPKTLCPYCDTPLPASPTPLLRSLLAKVCKKSSPDPRPANPLGRKAPLATFISVCQRHRFESQILPEAEQKGWPKTIDWAKVGGRVEAMRDSLQALINDRDDNDGGEFFWATGGPRSKCVFWRDVVSEVKQKGSRAVAGVRGQFSNFEKTQPGYYGELGSVIIHQTLYNLFPPSELDPDLISPLTSNEFIQRVLVPEVAVKLIKEDQNLEGDMGTNEALQILRESSAYGVAMFPEDSGESAAVGPSRGSRGQRREDEMGAGDLIVMERARKRRKELEEEDEEEEEQDQRRIESRGRRTRKGKAKETIQEEDSGLDVVFVPQKPKPRPRPINKFSSSGNALANADVEDEVVVSEREAKTAKRKTSNATLMDNGDVKSQRPKRPTAKKFPFDVDSAADSTDTDSSSRPNPTPRYRSLSASETGNQSVRASPMSSPPLALKNRPQTRTRKGSSSEVNLYSTSGSEDDHSDASRMRKGRKIKKVESFMDIAVDSLEIKDDNDIQDDHYIKTPVANRQSTIEFIDDDTPKPARSPPSRVPPAVPAASESSTVKPLEWARLRRQGKQVKDLAREPLCKASLKPPWVRSMLDAPRGSDESFTSTQTPTPLVERDFGWLLNDSSQSSSGSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.54
3	0.44
4	0.38
5	0.33
6	0.31
7	0.31
8	0.29
9	0.29
10	0.31
11	0.31
12	0.33
13	0.36
14	0.39
15	0.34
16	0.33
17	0.39
18	0.35
19	0.36
20	0.41
21	0.4
22	0.38
23	0.39
24	0.37
25	0.3
26	0.3
27	0.35
28	0.29
29	0.31
30	0.25
31	0.24
32	0.25
33	0.27
34	0.26
35	0.2
36	0.19
37	0.19
38	0.19
39	0.2
40	0.16
41	0.18
42	0.18
43	0.18
44	0.17
45	0.14
46	0.14
47	0.13
48	0.13
49	0.09
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.1
57	0.14
58	0.2
59	0.22
60	0.29
61	0.34
62	0.42
63	0.47
64	0.5
65	0.48
66	0.46
67	0.48
68	0.49
69	0.44
70	0.39
71	0.35
72	0.3
73	0.29
74	0.24
75	0.19
76	0.12
77	0.11
78	0.07
79	0.08
80	0.08
81	0.09
82	0.11
83	0.1
84	0.1
85	0.1
86	0.1
87	0.08
88	0.08
89	0.09
90	0.08
91	0.08
92	0.1
93	0.12
94	0.14
95	0.16
96	0.22
97	0.22
98	0.24
99	0.26
100	0.28
101	0.32
102	0.38
103	0.43
104	0.46
105	0.54
106	0.59
107	0.6
108	0.66
109	0.7
110	0.73
111	0.75
112	0.74
113	0.73
114	0.73
115	0.77
116	0.72
117	0.67
118	0.61
119	0.54
120	0.48
121	0.43
122	0.36
123	0.28
124	0.24
125	0.2
126	0.16
127	0.14
128	0.13
129	0.11
130	0.11
131	0.11
132	0.12
133	0.19
134	0.23
135	0.32
136	0.38
137	0.4
138	0.48
139	0.59
140	0.68
141	0.71
142	0.77
143	0.76
144	0.75
145	0.77
146	0.73
147	0.73
148	0.65
149	0.56
150	0.48
151	0.39
152	0.33
153	0.26
154	0.22
155	0.12
156	0.1
157	0.09
158	0.08
159	0.15
160	0.17
161	0.17
162	0.18
163	0.18
164	0.21
165	0.25
166	0.3
167	0.27
168	0.3
169	0.31
170	0.38
171	0.46
172	0.51
173	0.54
174	0.51
175	0.49
176	0.53
177	0.62
178	0.64
179	0.65
180	0.64
181	0.62
182	0.62
183	0.68
184	0.61
185	0.55
186	0.55
187	0.46
188	0.46
189	0.44
190	0.4
191	0.38
192	0.43
193	0.46
194	0.46
195	0.52
196	0.52
197	0.53
198	0.54
199	0.52
200	0.46
201	0.39
202	0.33
203	0.32
204	0.3
205	0.28
206	0.27
207	0.23
208	0.27
209	0.3
210	0.3
211	0.28
212	0.31
213	0.35
214	0.41
215	0.49
216	0.48
217	0.46
218	0.45
219	0.46
220	0.44
221	0.4
222	0.35
223	0.32
224	0.36
225	0.36
226	0.35
227	0.31
228	0.28
229	0.28
230	0.32
231	0.36
232	0.37
233	0.45
234	0.56
235	0.61
236	0.62
237	0.65
238	0.66
239	0.67
240	0.69
241	0.7
242	0.69
243	0.7
244	0.75
245	0.78
246	0.8
247	0.8
248	0.81
249	0.82
250	0.82
251	0.85
252	0.88
253	0.91
254	0.91
255	0.92
256	0.91
257	0.92
258	0.9
259	0.88
260	0.84
261	0.81
262	0.76
263	0.69
264	0.67
265	0.66
266	0.57
267	0.51
268	0.49
269	0.46
270	0.48
271	0.52
272	0.51
273	0.51
274	0.61
275	0.68
276	0.73
277	0.76
278	0.8
279	0.82
280	0.84
281	0.8
282	0.72
283	0.69
284	0.68
285	0.69
286	0.67
287	0.67
288	0.65
289	0.61
290	0.61
291	0.61
292	0.55
293	0.5
294	0.45
295	0.4
296	0.39
297	0.37
298	0.37
299	0.35
300	0.32
301	0.29
302	0.28
303	0.24
304	0.17
305	0.17
306	0.18
307	0.16
308	0.18
309	0.19
310	0.17
311	0.19
312	0.23
313	0.26
314	0.26
315	0.27
316	0.3
317	0.33
318	0.39
319	0.4
320	0.37
321	0.38
322	0.36
323	0.36
324	0.31
325	0.3
326	0.31
327	0.34
328	0.37
329	0.37
330	0.4
331	0.44
332	0.49
333	0.46
334	0.41
335	0.39
336	0.42
337	0.39
338	0.35
339	0.29
340	0.24
341	0.23
342	0.22
343	0.22
344	0.25
345	0.25
346	0.28
347	0.31
348	0.36
349	0.39
350	0.38
351	0.4
352	0.38
353	0.39
354	0.38
355	0.45
356	0.38
357	0.36
358	0.36
359	0.32
360	0.28
361	0.28
362	0.33
363	0.3
364	0.32
365	0.34
366	0.33
367	0.33
368	0.31
369	0.31
370	0.27
371	0.23
372	0.22
373	0.22
374	0.22
375	0.21
376	0.19
377	0.16
378	0.16
379	0.14
380	0.14
381	0.12
382	0.13
383	0.17
384	0.19
385	0.22
386	0.23
387	0.25
388	0.25
389	0.25
390	0.25
391	0.24
392	0.23
393	0.21
394	0.17
395	0.17
396	0.16
397	0.15
398	0.14
399	0.1
400	0.09
401	0.07
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.07
410	0.09
411	0.11
412	0.16
413	0.24
414	0.28
415	0.32
416	0.34
417	0.39
418	0.38
419	0.38
420	0.36
421	0.31
422	0.28
423	0.25
424	0.24
425	0.24
426	0.24
427	0.25
428	0.23
429	0.25
430	0.26
431	0.27
432	0.29
433	0.27
434	0.26
435	0.25
436	0.29
437	0.26
438	0.29
439	0.32
440	0.29
441	0.27
442	0.25
443	0.29
444	0.25
445	0.27
446	0.23
447	0.2
448	0.2
449	0.2
450	0.24
451	0.24
452	0.3
453	0.35
454	0.38
455	0.42
456	0.48
457	0.53
458	0.52
459	0.56
460	0.56
461	0.57
462	0.58
463	0.54
464	0.48
465	0.43
466	0.39
467	0.31
468	0.24
469	0.14
470	0.09
471	0.06
472	0.06
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.07
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.06
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.1
491	0.19
492	0.19
493	0.19
494	0.21
495	0.22
496	0.23
497	0.26
498	0.26
499	0.19
500	0.22
501	0.27
502	0.24
503	0.24
504	0.23
505	0.21
506	0.21
507	0.21
508	0.18
509	0.14
510	0.15
511	0.16
512	0.2
513	0.24
514	0.26
515	0.25
516	0.27
517	0.29
518	0.31
519	0.37
520	0.42
521	0.44
522	0.51
523	0.56
524	0.56
525	0.61
526	0.61
527	0.62
528	0.55
529	0.53
530	0.47
531	0.42
532	0.4
533	0.33
534	0.31
535	0.26
536	0.24
537	0.18
538	0.15
539	0.15
540	0.21
541	0.22
542	0.23
543	0.23
544	0.22
545	0.24
546	0.25
547	0.27
548	0.23
549	0.25
550	0.27
551	0.29
552	0.28
553	0.27
554	0.28
555	0.27
556	0.24
557	0.22
558	0.2
559	0.15
560	0.16
561	0.15
562	0.14
563	0.18
564	0.24
565	0.24
566	0.23
567	0.25
568	0.24
569	0.29
570	0.29
571	0.22
572	0.18
573	0.15
574	0.15
575	0.12
576	0.13
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.09
581	0.1
582	0.1
583	0.11
584	0.11
585	0.12
586	0.12
587	0.11
588	0.11
589	0.1
590	0.1
591	0.09
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.06
596	0.05
597	0.05
598	0.04
599	0.04
600	0.08
601	0.13
602	0.13
603	0.17
604	0.19
605	0.2
606	0.24
607	0.28
608	0.27
609	0.23
610	0.27
611	0.25
612	0.28
613	0.29
614	0.28
615	0.29
616	0.27
617	0.3
618	0.27
619	0.26
620	0.24
621	0.23
622	0.21
623	0.18
624	0.18
625	0.19
626	0.21
627	0.23
628	0.21
629	0.2
630	0.19
631	0.19
632	0.2
633	0.21
634	0.18
635	0.17
636	0.17
637	0.18
638	0.19
639	0.19
640	0.2
641	0.16
642	0.16
643	0.15
644	0.13
645	0.13
646	0.12
647	0.1
648	0.07
649	0.06
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.06
656	0.08
657	0.09
658	0.08
659	0.08
660	0.1
661	0.11
662	0.13
663	0.12
664	0.11
665	0.11
666	0.11
667	0.12
668	0.1
669	0.08
670	0.06
671	0.07
672	0.08
673	0.08
674	0.08
675	0.09
676	0.1
677	0.1
678	0.11
679	0.11
680	0.11
681	0.12
682	0.12
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.1
687	0.1
688	0.08
689	0.08
690	0.12
691	0.13
692	0.13
693	0.14
694	0.15
695	0.17
696	0.17
697	0.16
698	0.12
699	0.11
700	0.1
701	0.09
702	0.08
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.05
707	0.04
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.05
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.06
717	0.06
718	0.05
719	0.06
720	0.06
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.05
728	0.05
729	0.06
730	0.05
731	0.05
732	0.05
733	0.06
734	0.09
735	0.12
736	0.16
737	0.24
738	0.31
739	0.39
740	0.44
741	0.49
742	0.49
743	0.47
744	0.45
745	0.38
746	0.31
747	0.23
748	0.18
749	0.12
750	0.08
751	0.07
752	0.06
753	0.05
754	0.06
755	0.1
756	0.19
757	0.27
758	0.31
759	0.38
760	0.47
761	0.55
762	0.64
763	0.67
764	0.67
765	0.66
766	0.66
767	0.62
768	0.53
769	0.45
770	0.35
771	0.28
772	0.21
773	0.15
774	0.13
775	0.11
776	0.11
777	0.14
778	0.16
779	0.21
780	0.29
781	0.39
782	0.48
783	0.55
784	0.64
785	0.67
786	0.75
787	0.79
788	0.8
789	0.78
790	0.76
791	0.78
792	0.76
793	0.77
794	0.72
795	0.63
796	0.55
797	0.45
798	0.37
799	0.28
800	0.21
801	0.14
802	0.09
803	0.07
804	0.07
805	0.1
806	0.1
807	0.13
808	0.15
809	0.24
810	0.32
811	0.43
812	0.52
813	0.6
814	0.7
815	0.78
816	0.87
817	0.85
818	0.88
819	0.81
820	0.73
821	0.64
822	0.6
823	0.51
824	0.42
825	0.36
826	0.27
827	0.24
828	0.21
829	0.2
830	0.13
831	0.11
832	0.08
833	0.07
834	0.05
835	0.05
836	0.05
837	0.05
838	0.05
839	0.04
840	0.1
841	0.1
842	0.12
843	0.13
844	0.16
845	0.26
846	0.34
847	0.42
848	0.45
849	0.49
850	0.53
851	0.62
852	0.67
853	0.62
854	0.57
855	0.52
856	0.45
857	0.43
858	0.39
859	0.29
860	0.26
861	0.22
862	0.2
863	0.27
864	0.34
865	0.4
866	0.43
867	0.52
868	0.58
869	0.69
870	0.78
871	0.79
872	0.81
873	0.8
874	0.8
875	0.76
876	0.69
877	0.6
878	0.52
879	0.43
880	0.35
881	0.29
882	0.24
883	0.18
884	0.15
885	0.14
886	0.13
887	0.11
888	0.09
889	0.09
890	0.11
891	0.16
892	0.2
893	0.22
894	0.29
895	0.37
896	0.46
897	0.53
898	0.57
899	0.61
900	0.6
901	0.61
902	0.58
903	0.53
904	0.46
905	0.42
906	0.39
907	0.33
908	0.33
909	0.29
910	0.25
911	0.22
912	0.21
913	0.19
914	0.17
915	0.16
916	0.15
917	0.2
918	0.24
919	0.23
920	0.23
921	0.24
922	0.31
923	0.33
924	0.36
925	0.39
926	0.45
927	0.54
928	0.58
929	0.63
930	0.64
931	0.71
932	0.76
933	0.72
934	0.69
935	0.65
936	0.69
937	0.68
938	0.66
939	0.63
940	0.55
941	0.52
942	0.44
943	0.4
944	0.31
945	0.25
946	0.18
947	0.12
948	0.11
949	0.1
950	0.12
951	0.13
952	0.14
953	0.15
954	0.14
955	0.17
956	0.2
957	0.25
958	0.29
959	0.32
960	0.38
961	0.48
962	0.57
963	0.65
964	0.72
965	0.75
966	0.8
967	0.83
968	0.8
969	0.74
970	0.67
971	0.56
972	0.48
973	0.39
974	0.28
975	0.19
976	0.15
977	0.11
978	0.08
979	0.09
980	0.06
981	0.07
982	0.08
983	0.1
984	0.11
985	0.14
986	0.14
987	0.15
988	0.21
989	0.23
990	0.22
991	0.24
992	0.24
993	0.21
994	0.26
995	0.3
996	0.33
997	0.4
998	0.41
999	0.38
1000	0.41
1001	0.44
1002	0.4
1003	0.37
1004	0.3
1005	0.22
1006	0.22
1007	0.27
1008	0.24
1009	0.23
1010	0.25
1011	0.24
1012	0.23
1013	0.24
1014	0.27
1015	0.31
1016	0.36
1017	0.44
1018	0.49
1019	0.59
1020	0.66
1021	0.66
1022	0.65
1023	0.61
1024	0.61
1025	0.54
1026	0.45
1027	0.37
1028	0.33
1029	0.32
1030	0.31
1031	0.27
1032	0.23
1033	0.24
1034	0.24
1035	0.21
1036	0.23
1037	0.24
1038	0.32
1039	0.39
1040	0.43
1041	0.48
1042	0.58
1043	0.62
1044	0.65
1045	0.72
1046	0.71
1047	0.71
1048	0.74
1049	0.74
1050	0.72
1051	0.75
1052	0.71
1053	0.7
1054	0.69
1055	0.65
1056	0.58
1057	0.57
1058	0.51
1059	0.46
1060	0.45
1061	0.45
1062	0.46
1063	0.51
1064	0.56
1065	0.54
1066	0.58
1067	0.6
1068	0.58
1069	0.53
1070	0.55
1071	0.54
1072	0.54
1073	0.51
1074	0.45
1075	0.47
1076	0.48
1077	0.43
1078	0.35
1079	0.29
1080	0.27
1081	0.27
1082	0.27
1083	0.25
1084	0.23
1085	0.25
1086	0.25
1087	0.25
1088	0.2
1089	0.23
1090	0.25
1091	0.25
1092	0.26
1093	0.25
1094	0.27
1095	0.27
1096	0.26
1097	0.24
1098	0.22
1099	0.21
1100	0.22
1101	0.23
1102	0.2
1103	0.2
1104	0.21

B0CYA5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer