Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q59QH0

Protein Details
Accession Q59QH0    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MGKTKSRGRRAEKKNKKNEPGFNEDVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-17TKSRGRRAEKKNKK
710-720EKKQKLRGRRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
KEGG cal:CAALFM_C104040CA  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
Amino Acid Sequences MGKTKSRGRRAEKKNKKNEPGFNEDVSNLDSDVTITNQEPLSSSMSSTSGIPNTFFGLVDNNELDYFKQAESTLNINAFETDEERQGFINSVLEEAQGKELKLVTNQICSKLMERLILFANHNQLKKIFKQFQNHFVSLAFHKYASHVLETLLVRSAALIEKELTQTDEEKLEEAEEEEAEEEEAEEDSLNNDVPMEDLFISMLNEFKPHLTTMIDHSYASHVLRLLILILAGKELPSSVTSNSTLRSKKSKIARKMIEIKDNEDFDRAFQTPQSFKNELREYCQTIIVGLDTKSARELSIHKIGSPVLQLLIQVEGLVDRERSFWHLIFAKDSEGKDSVEESFVEYLLSESVGSHFLESIIKNDGARPKYIERLYKLYMKDRVLKLAKRSTTGVYIIQALLFKLKPVEVEYILDQIIPELAELISIAENQNLDLANKLIDASISRGNYRRDEIINQLFIKFAPNYDIENPSDNTSTEFIENILQLTGSTLGNTRDDWPTAEERKRALFLEKLMEYDYKFVICTWFNFMALPIERFVQMCFHGVFCHVVEKALIVEPEEPKPIQILRKRLLNIFQGQIVGLACNSYGSHIVDSLWNFTVLLPMYKDRIASELLGDSNKVKESTYGRLVWKNWGMELFVRKKYDWKALIKQQEQEYYGETEDSTEKRAKKPIELKMERLAEEKRRQEEMAERAQSGYTKRKLEEATGTASEKKQKLRGRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.94
3 0.94
4 0.93
5 0.92
6 0.88
7 0.86
8 0.81
9 0.72
10 0.63
11 0.53
12 0.45
13 0.36
14 0.29
15 0.2
16 0.15
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.11
23 0.14
24 0.14
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.19
29 0.17
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.17
35 0.19
36 0.18
37 0.18
38 0.19
39 0.18
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.19
47 0.18
48 0.17
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.17
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.16
58 0.18
59 0.21
60 0.21
61 0.21
62 0.22
63 0.2
64 0.2
65 0.18
66 0.17
67 0.16
68 0.14
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.17
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.26
91 0.23
92 0.3
93 0.32
94 0.33
95 0.34
96 0.34
97 0.34
98 0.32
99 0.31
100 0.27
101 0.25
102 0.24
103 0.25
104 0.26
105 0.26
106 0.24
107 0.31
108 0.32
109 0.33
110 0.32
111 0.32
112 0.34
113 0.39
114 0.47
115 0.47
116 0.49
117 0.59
118 0.62
119 0.7
120 0.73
121 0.67
122 0.57
123 0.48
124 0.45
125 0.36
126 0.36
127 0.26
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.22
132 0.2
133 0.2
134 0.15
135 0.15
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.17
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.15
201 0.2
202 0.2
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.2
207 0.19
208 0.15
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.08
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.08
226 0.08
227 0.11
228 0.13
229 0.14
230 0.16
231 0.22
232 0.22
233 0.25
234 0.31
235 0.31
236 0.37
237 0.45
238 0.53
239 0.56
240 0.64
241 0.65
242 0.66
243 0.74
244 0.72
245 0.7
246 0.62
247 0.56
248 0.5
249 0.47
250 0.39
251 0.3
252 0.25
253 0.18
254 0.21
255 0.18
256 0.14
257 0.14
258 0.17
259 0.19
260 0.22
261 0.29
262 0.27
263 0.28
264 0.36
265 0.4
266 0.37
267 0.39
268 0.4
269 0.36
270 0.35
271 0.35
272 0.26
273 0.2
274 0.2
275 0.15
276 0.12
277 0.09
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.13
286 0.15
287 0.23
288 0.23
289 0.22
290 0.23
291 0.23
292 0.22
293 0.2
294 0.15
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.1
311 0.12
312 0.11
313 0.14
314 0.17
315 0.17
316 0.19
317 0.19
318 0.18
319 0.19
320 0.19
321 0.17
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.14
326 0.12
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.03
339 0.04
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.12
352 0.18
353 0.17
354 0.18
355 0.2
356 0.19
357 0.26
358 0.29
359 0.31
360 0.28
361 0.32
362 0.34
363 0.36
364 0.36
365 0.35
366 0.37
367 0.36
368 0.4
369 0.36
370 0.41
371 0.4
372 0.41
373 0.42
374 0.44
375 0.42
376 0.37
377 0.38
378 0.32
379 0.29
380 0.28
381 0.22
382 0.16
383 0.15
384 0.13
385 0.12
386 0.11
387 0.08
388 0.09
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.09
395 0.12
396 0.1
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.1
403 0.07
404 0.07
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.07
430 0.11
431 0.12
432 0.14
433 0.18
434 0.21
435 0.23
436 0.24
437 0.25
438 0.23
439 0.25
440 0.3
441 0.3
442 0.32
443 0.3
444 0.28
445 0.25
446 0.23
447 0.23
448 0.16
449 0.12
450 0.11
451 0.12
452 0.14
453 0.17
454 0.2
455 0.18
456 0.21
457 0.22
458 0.21
459 0.21
460 0.18
461 0.18
462 0.16
463 0.16
464 0.13
465 0.12
466 0.1
467 0.11
468 0.11
469 0.09
470 0.08
471 0.07
472 0.06
473 0.07
474 0.08
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.09
479 0.1
480 0.11
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.15
485 0.17
486 0.22
487 0.29
488 0.32
489 0.32
490 0.33
491 0.34
492 0.35
493 0.33
494 0.3
495 0.26
496 0.23
497 0.28
498 0.26
499 0.24
500 0.24
501 0.24
502 0.21
503 0.2
504 0.18
505 0.12
506 0.12
507 0.11
508 0.13
509 0.12
510 0.13
511 0.18
512 0.18
513 0.18
514 0.18
515 0.18
516 0.2
517 0.2
518 0.2
519 0.14
520 0.14
521 0.15
522 0.15
523 0.15
524 0.12
525 0.12
526 0.13
527 0.13
528 0.12
529 0.12
530 0.13
531 0.14
532 0.12
533 0.15
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.1
542 0.13
543 0.15
544 0.17
545 0.2
546 0.19
547 0.17
548 0.19
549 0.22
550 0.26
551 0.3
552 0.37
553 0.39
554 0.46
555 0.48
556 0.49
557 0.51
558 0.49
559 0.47
560 0.4
561 0.37
562 0.3
563 0.28
564 0.25
565 0.2
566 0.14
567 0.09
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.08
574 0.09
575 0.1
576 0.1
577 0.11
578 0.14
579 0.15
580 0.17
581 0.16
582 0.14
583 0.14
584 0.13
585 0.16
586 0.14
587 0.15
588 0.14
589 0.15
590 0.18
591 0.18
592 0.19
593 0.16
594 0.18
595 0.17
596 0.16
597 0.15
598 0.15
599 0.16
600 0.16
601 0.16
602 0.15
603 0.16
604 0.17
605 0.16
606 0.14
607 0.18
608 0.21
609 0.27
610 0.32
611 0.35
612 0.38
613 0.44
614 0.45
615 0.48
616 0.49
617 0.43
618 0.39
619 0.34
620 0.32
621 0.3
622 0.38
623 0.37
624 0.37
625 0.4
626 0.39
627 0.45
628 0.48
629 0.53
630 0.52
631 0.53
632 0.57
633 0.63
634 0.73
635 0.71
636 0.72
637 0.68
638 0.66
639 0.6
640 0.52
641 0.45
642 0.37
643 0.33
644 0.27
645 0.21
646 0.17
647 0.2
648 0.19
649 0.21
650 0.25
651 0.28
652 0.33
653 0.42
654 0.43
655 0.49
656 0.57
657 0.62
658 0.67
659 0.68
660 0.68
661 0.69
662 0.7
663 0.61
664 0.56
665 0.54
666 0.52
667 0.56
668 0.59
669 0.55
670 0.54
671 0.53
672 0.54
673 0.55
674 0.53
675 0.53
676 0.49
677 0.44
678 0.41
679 0.42
680 0.4
681 0.38
682 0.4
683 0.37
684 0.4
685 0.4
686 0.46
687 0.47
688 0.49
689 0.52
690 0.45
691 0.45
692 0.43
693 0.45
694 0.42
695 0.44
696 0.47
697 0.44
698 0.47
699 0.5
700 0.55