FuNGI

B0CYA9

Protein Details

Accession

B0CYA9

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-32	SLSMLFHPKKGPKQEKSSTPKPVPS	Hydrophilic
157-176	KGVANGKKRFQKKTRQVFYV	Hydrophilic
557-582	VASPNSVPPPKPKKRKGQPPGTVPVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
149-169	KGKDKDKGKGVANGKKRFQKK
565-573	PPKPKKRKG

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_311792 -

Amino Acid Sequences

MAPKAQPSLSMLFHPKKGPKQEKSSTPKPVPSNSRPKSFPEEDEDELKLPDGPFQDFRLLSSALNGWKYDVMKFDSRKPVEISKWTAPIKLNRKDLRRDEGVTNGAPEAVGPMLGPDGKPVVGADGKMVMVDVDGRPINNRDDSLGIGKGKDKDKGKGVANGKKRFQKKTRQVFYVPEEVRQLRREERYPWVMEDSSSMHNELWIGQMEDASKSETHAFFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKRLKHDLPTDTAKVESLYTLSQKRDPQAWLASRNGGKGPSAATAAMFKAEANPVVAGEGQSLGPGGRKLKAVDSGMNGLFDDEDDGAQSRREKELGEEGDLDEQVYEEDFADDEEKMDLDENDEEAKELEERLKREYKAANKQRDTGVDDSDEKEEPTKSKQAKAMQKMIRNREGNEAYESDEDENPYASSEEEEEEEEELPVPTGPAIQQQQADSRPNTPKLHPNRPNAISKPGSRATSPSNSPGLGGHTMVAKRATSPKVPKPRPVGSASGGNSPLGSRANSPVAGSRATSPARLDSINGNQKKRKADDSLNSTVASPNSVPPPKPKKRKGQPPGTVPVPVSPAELEMMLVEWLKNTPNATTRDCIQHFTPYLTDGDKKTGFSAMVRKVAQLKGGVLALRTIVT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.51
3	0.56
4	0.65
5	0.7
6	0.7
7	0.75
8	0.8
9	0.83
10	0.85
11	0.85
12	0.84
13	0.81
14	0.8
15	0.76
16	0.76
17	0.75
18	0.76
19	0.78
20	0.74
21	0.75
22	0.7
23	0.7
24	0.7
25	0.65
26	0.6
27	0.57
28	0.56
29	0.51
30	0.52
31	0.48
32	0.4
33	0.35
34	0.31
35	0.26
36	0.2
37	0.2
38	0.19
39	0.21
40	0.22
41	0.24
42	0.3
43	0.27
44	0.28
45	0.28
46	0.26
47	0.22
48	0.22
49	0.24
50	0.21
51	0.23
52	0.22
53	0.2
54	0.22
55	0.24
56	0.23
57	0.23
58	0.25
59	0.31
60	0.34
61	0.42
62	0.48
63	0.49
64	0.51
65	0.52
66	0.54
67	0.52
68	0.56
69	0.55
70	0.5
71	0.56
72	0.53
73	0.53
74	0.5
75	0.54
76	0.57
77	0.58
78	0.62
79	0.62
80	0.68
81	0.73
82	0.75
83	0.73
84	0.69
85	0.65
86	0.58
87	0.56
88	0.53
89	0.44
90	0.38
91	0.3
92	0.24
93	0.19
94	0.16
95	0.11
96	0.07
97	0.06
98	0.05
99	0.05
100	0.06
101	0.07
102	0.07
103	0.07
104	0.09
105	0.08
106	0.09
107	0.08
108	0.11
109	0.11
110	0.12
111	0.11
112	0.11
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.07
117	0.06
118	0.08
119	0.07
120	0.1
121	0.1
122	0.11
123	0.13
124	0.16
125	0.19
126	0.19
127	0.2
128	0.17
129	0.18
130	0.2
131	0.2
132	0.21
133	0.19
134	0.18
135	0.22
136	0.26
137	0.27
138	0.32
139	0.33
140	0.34
141	0.4
142	0.46
143	0.45
144	0.48
145	0.54
146	0.55
147	0.62
148	0.64
149	0.64
150	0.66
151	0.7
152	0.72
153	0.72
154	0.74
155	0.75
156	0.79
157	0.81
158	0.78
159	0.75
160	0.71
161	0.68
162	0.67
163	0.56
164	0.47
165	0.44
166	0.4
167	0.4
168	0.37
169	0.36
170	0.32
171	0.37
172	0.38
173	0.37
174	0.42
175	0.45
176	0.44
177	0.42
178	0.39
179	0.34
180	0.31
181	0.28
182	0.24
183	0.2
184	0.19
185	0.18
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.12
190	0.11
191	0.09
192	0.09
193	0.08
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.1
201	0.13
202	0.13
203	0.14
204	0.14
205	0.15
206	0.14
207	0.15
208	0.14
209	0.12
210	0.13
211	0.12
212	0.1
213	0.11
214	0.11
215	0.1
216	0.11
217	0.1
218	0.18
219	0.21
220	0.27
221	0.27
222	0.34
223	0.38
224	0.48
225	0.58
226	0.57
227	0.62
228	0.64
229	0.73
230	0.72
231	0.76
232	0.7
233	0.64
234	0.62
235	0.58
236	0.51
237	0.41
238	0.35
239	0.27
240	0.22
241	0.17
242	0.12
243	0.08
244	0.08
245	0.11
246	0.14
247	0.16
248	0.2
249	0.22
250	0.24
251	0.27
252	0.27
253	0.27
254	0.3
255	0.32
256	0.31
257	0.3
258	0.33
259	0.3
260	0.3
261	0.27
262	0.21
263	0.17
264	0.15
265	0.14
266	0.11
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.07
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.04
287	0.04
288	0.05
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.08
294	0.1
295	0.11
296	0.12
297	0.16
298	0.17
299	0.17
300	0.18
301	0.19
302	0.18
303	0.17
304	0.16
305	0.11
306	0.1
307	0.08
308	0.07
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.08
316	0.09
317	0.1
318	0.11
319	0.11
320	0.12
321	0.19
322	0.19
323	0.19
324	0.18
325	0.17
326	0.18
327	0.17
328	0.15
329	0.08
330	0.06
331	0.05
332	0.04
333	0.04
334	0.03
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.11
357	0.13
358	0.15
359	0.2
360	0.25
361	0.25
362	0.29
363	0.35
364	0.39
365	0.47
366	0.55
367	0.59
368	0.56
369	0.59
370	0.57
371	0.54
372	0.49
373	0.4
374	0.33
375	0.25
376	0.24
377	0.23
378	0.22
379	0.2
380	0.15
381	0.15
382	0.15
383	0.14
384	0.17
385	0.24
386	0.24
387	0.29
388	0.34
389	0.41
390	0.49
391	0.54
392	0.59
393	0.57
394	0.62
395	0.65
396	0.66
397	0.66
398	0.59
399	0.54
400	0.53
401	0.49
402	0.44
403	0.39
404	0.33
405	0.27
406	0.25
407	0.24
408	0.18
409	0.16
410	0.15
411	0.13
412	0.12
413	0.1
414	0.1
415	0.09
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.09
426	0.09
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.1
435	0.12
436	0.14
437	0.16
438	0.17
439	0.22
440	0.25
441	0.3
442	0.26
443	0.31
444	0.34
445	0.39
446	0.41
447	0.41
448	0.47
449	0.51
450	0.61
451	0.63
452	0.64
453	0.67
454	0.68
455	0.72
456	0.65
457	0.64
458	0.58
459	0.52
460	0.51
461	0.47
462	0.44
463	0.36
464	0.37
465	0.35
466	0.37
467	0.36
468	0.34
469	0.32
470	0.3
471	0.29
472	0.27
473	0.25
474	0.19
475	0.17
476	0.14
477	0.15
478	0.16
479	0.17
480	0.17
481	0.14
482	0.15
483	0.22
484	0.25
485	0.29
486	0.37
487	0.45
488	0.55
489	0.6
490	0.66
491	0.67
492	0.69
493	0.67
494	0.63
495	0.58
496	0.5
497	0.52
498	0.46
499	0.42
500	0.37
501	0.31
502	0.27
503	0.22
504	0.21
505	0.16
506	0.15
507	0.12
508	0.15
509	0.19
510	0.19
511	0.19
512	0.21
513	0.22
514	0.22
515	0.21
516	0.19
517	0.22
518	0.23
519	0.24
520	0.21
521	0.22
522	0.23
523	0.23
524	0.22
525	0.21
526	0.3
527	0.38
528	0.43
529	0.48
530	0.51
531	0.56
532	0.62
533	0.62
534	0.59
535	0.56
536	0.6
537	0.62
538	0.65
539	0.66
540	0.6
541	0.56
542	0.49
543	0.44
544	0.35
545	0.28
546	0.21
547	0.18
548	0.24
549	0.28
550	0.3
551	0.38
552	0.49
553	0.57
554	0.67
555	0.73
556	0.75
557	0.82
558	0.91
559	0.92
560	0.92
561	0.91
562	0.88
563	0.87
564	0.79
565	0.71
566	0.61
567	0.52
568	0.44
569	0.35
570	0.28
571	0.2
572	0.18
573	0.15
574	0.14
575	0.11
576	0.09
577	0.09
578	0.08
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.08
583	0.1
584	0.12
585	0.12
586	0.15
587	0.21
588	0.27
589	0.3
590	0.33
591	0.35
592	0.43
593	0.44
594	0.44
595	0.4
596	0.43
597	0.4
598	0.4
599	0.37
600	0.3
601	0.3
602	0.3
603	0.32
604	0.26
605	0.31
606	0.3
607	0.3
608	0.29
609	0.3
610	0.27
611	0.27
612	0.34
613	0.33
614	0.39
615	0.38
616	0.4
617	0.43
618	0.44
619	0.43
620	0.37
621	0.32
622	0.27
623	0.29
624	0.27
625	0.21
626	0.2

B0CYA9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer