Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4TSA0

Protein Details
Accession N4TSA0    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-58KGAADAFKKQREKKGWKATATHydrophilic
79-103GDDSSKSSKSSKKKSSKKDSSSSASHydrophilic
283-308SDSDAKETKKDKKIKKEKEVKDSSDSBasic
377-404LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-94SSKKKSS
184-189KAKKQK
291-300KKDKKIKKEK
383-396KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MGKKSTKAAAPKNDATSAPPPGQLMDLVENFLSDHSFKGAADAFKKQREKKGWKATATTDEEGNPSLVSVYQTWEATKGDDSSKSSKSSKKKSSKKDSSSSASSDSSSDSSDAKEEDVDMKDAESSSDSDSSSDSDSDDEAAKPKASNTLKRKAPVDESSSDSSSDSDSDSSSSDSESDSDKPKAKKQKRAASSSSSSDSSSSSSESSDSSDSSDSSDSDSSSDSDDESAKSDSGSSSSDSSSDSSSDSDSSDSDDEAAAKVPLPDSDSSSSDSDSASSDSDSDSDAKETKKDKKIKKEKEVKDSSDSSVTLDKTSPDFQSNSAYPPLPPDPVVNGNGRKKQNEPFSRIPKNIKVDAKFASNEYVSIAYSQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHDKKGIYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.54
3 0.5
4 0.46
5 0.39
6 0.34
7 0.3
8 0.28
9 0.28
10 0.23
11 0.21
12 0.2
13 0.18
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.16
18 0.15
19 0.14
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.14
26 0.19
27 0.21
28 0.24
29 0.32
30 0.37
31 0.45
32 0.54
33 0.57
34 0.63
35 0.69
36 0.75
37 0.77
38 0.82
39 0.82
40 0.78
41 0.77
42 0.72
43 0.71
44 0.68
45 0.59
46 0.49
47 0.41
48 0.38
49 0.34
50 0.28
51 0.19
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.11
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.17
65 0.16
66 0.17
67 0.2
68 0.24
69 0.27
70 0.3
71 0.33
72 0.37
73 0.42
74 0.49
75 0.57
76 0.63
77 0.68
78 0.75
79 0.81
80 0.87
81 0.9
82 0.89
83 0.87
84 0.83
85 0.79
86 0.74
87 0.66
88 0.58
89 0.48
90 0.4
91 0.32
92 0.27
93 0.21
94 0.17
95 0.15
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.13
104 0.14
105 0.14
106 0.13
107 0.12
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.2
133 0.23
134 0.32
135 0.37
136 0.45
137 0.49
138 0.52
139 0.54
140 0.49
141 0.5
142 0.45
143 0.44
144 0.37
145 0.37
146 0.37
147 0.35
148 0.32
149 0.26
150 0.21
151 0.17
152 0.15
153 0.11
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.11
166 0.14
167 0.17
168 0.23
169 0.25
170 0.33
171 0.43
172 0.49
173 0.57
174 0.63
175 0.69
176 0.7
177 0.75
178 0.72
179 0.68
180 0.63
181 0.56
182 0.48
183 0.4
184 0.33
185 0.26
186 0.22
187 0.17
188 0.14
189 0.12
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.12
254 0.15
255 0.16
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.17
260 0.16
261 0.13
262 0.11
263 0.11
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.1
273 0.12
274 0.13
275 0.18
276 0.24
277 0.32
278 0.41
279 0.5
280 0.57
281 0.65
282 0.76
283 0.81
284 0.86
285 0.88
286 0.87
287 0.88
288 0.88
289 0.81
290 0.77
291 0.69
292 0.61
293 0.53
294 0.44
295 0.35
296 0.31
297 0.27
298 0.22
299 0.19
300 0.18
301 0.18
302 0.21
303 0.21
304 0.2
305 0.21
306 0.2
307 0.26
308 0.26
309 0.26
310 0.26
311 0.24
312 0.21
313 0.26
314 0.27
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.22
319 0.26
320 0.29
321 0.3
322 0.35
323 0.41
324 0.48
325 0.51
326 0.5
327 0.51
328 0.56
329 0.6
330 0.61
331 0.62
332 0.64
333 0.69
334 0.74
335 0.76
336 0.75
337 0.72
338 0.7
339 0.7
340 0.68
341 0.61
342 0.58
343 0.54
344 0.52
345 0.45
346 0.4
347 0.36
348 0.28
349 0.26
350 0.22
351 0.2
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.16
359 0.16
360 0.16
361 0.15
362 0.17
363 0.18
364 0.23
365 0.28
366 0.25
367 0.26
368 0.3
369 0.32
370 0.36
371 0.39
372 0.42
373 0.48
374 0.59
375 0.67
376 0.74
377 0.82
378 0.83
379 0.9
380 0.91
381 0.9
382 0.9
383 0.88
384 0.86
385 0.84
386 0.78
387 0.68
388 0.6
389 0.6
390 0.53
391 0.47
392 0.4
393 0.32
394 0.28