Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CYU2

Protein Details
Accession B0CYU2    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-133VAKPSDQKDKEKKEKKSKRRPGRRGSKAVPGEBasic
155-178TDEVAKPKKKKKAARKPKSKVEGEBasic
193-217TPEAPKKVPRPRKARAPRPARPAGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-128KDKEKKEKKSKRRPGRRGSK
160-174KPKKKKKAARKPKSK
197-214PKKVPRPRKARAPRPARP
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 12.833, nucl 10, mito_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_292975  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAQAAPAPENGVPPVAQDISQESLGFKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFAPVQSDILSAQVILRGTRSAGYGFVALATAEAAQKAVEALDKKELDGRQVIVEVAKPSDQKDKEKKEKKSKRRPGRRGSKAVPGEVSEAEANGEAAHKADAAATNETDEVAKPKKKKKAARKPKSKVEGEVSDVNPAAAYEGEATPEAPKKVPRPRKARAPRPARPAGEDPVGEPSKTMLFVANLGFAVDDAALAALFADAGINVVSARIVQRRWGQPRRSKGYGFVDVGSEAEQQKAIAALEGKEIGGRTIAVKIAVNAPYDDDAAAKQDGAETSTAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.16
4 0.15
5 0.15
6 0.14
7 0.17
8 0.19
9 0.2
10 0.19
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.13
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.13
25 0.14
26 0.13
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.11
37 0.11
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.07
73 0.09
74 0.11
75 0.17
76 0.18
77 0.18
78 0.23
79 0.24
80 0.23
81 0.24
82 0.23
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.13
87 0.14
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.14
93 0.23
94 0.25
95 0.32
96 0.42
97 0.51
98 0.6
99 0.69
100 0.77
101 0.8
102 0.87
103 0.89
104 0.91
105 0.92
106 0.92
107 0.94
108 0.94
109 0.94
110 0.94
111 0.92
112 0.9
113 0.83
114 0.81
115 0.72
116 0.63
117 0.53
118 0.43
119 0.35
120 0.26
121 0.24
122 0.14
123 0.11
124 0.1
125 0.08
126 0.07
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.07
144 0.09
145 0.13
146 0.17
147 0.23
148 0.31
149 0.39
150 0.47
151 0.56
152 0.64
153 0.71
154 0.78
155 0.83
156 0.87
157 0.87
158 0.89
159 0.88
160 0.79
161 0.71
162 0.66
163 0.57
164 0.49
165 0.46
166 0.37
167 0.29
168 0.27
169 0.22
170 0.16
171 0.13
172 0.1
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.08
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.15
185 0.22
186 0.32
187 0.42
188 0.5
189 0.56
190 0.62
191 0.72
192 0.79
193 0.82
194 0.82
195 0.82
196 0.8
197 0.8
198 0.81
199 0.72
200 0.66
201 0.6
202 0.53
203 0.47
204 0.39
205 0.31
206 0.3
207 0.3
208 0.24
209 0.2
210 0.17
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.07
244 0.1
245 0.11
246 0.17
247 0.25
248 0.34
249 0.45
250 0.54
251 0.61
252 0.66
253 0.76
254 0.79
255 0.77
256 0.7
257 0.67
258 0.66
259 0.63
260 0.56
261 0.46
262 0.39
263 0.33
264 0.32
265 0.26
266 0.2
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.09
275 0.11
276 0.11
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.18
292 0.2
293 0.21
294 0.19
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.19
299 0.14
300 0.12
301 0.14
302 0.14
303 0.12
304 0.1
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.14