FuNGI

A0A1D8PKH4

Protein Details

Accession

A0A1D8PKH4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MRRAKCKEREKSREEKKNHNIRILH	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025574 Nucleoporin_FG_rpt IPR037665 Nucleoporin_S59-like IPR007230 Nup98_auto-Pept-S59_dom IPR036903 Nup98_auto-Pept-S59_dom_sf
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0044613 C:nuclear pore central transport channel GO:0044614 C:nuclear pore cytoplasmic filaments GO:0008139 F:nuclear localization sequence binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0000973 P:post-transcriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery GO:0006606 P:protein import into nucleus GO:0006405 P:RNA export from nucleus GO:0034398 P:telomere tethering at nuclear periphery
KEGG	cal:CAALFM_C306440WA -
Pfam	View protein in Pfam PF04096 Nucleoporin2 PF13634 Nucleoporin_FG
PROSITE	View protein in PROSITE PS51434 NUP_C

Amino Acid Sequences

MRRAKCKEREKSREEKKNHNIRILHFNTNQLSLHSQSQLNIEMFGGGASSGFGGFGSSTTTNNSPFGGGAGAGAATTNTGASPFGSTNTNTTGGGIFGSNANSSTGFGSSNAFGASSNTNTTPAFGGNTGGGLFGSTANGTGSSPFGQQQQQQQQPQQTTSAFGSSNNSGSVFGSSATGGGLFGSKPATSTFGGFGSTTANASSPFGASTTNAFGGGASVDPNVNNGTAAKQFTPFTEKDSANMTNVFQNICCMPEYKNFSFEELRLKDYEQGRRFPPAGATANAGFGGAAGTNATGGGFGFSGAATGASPFGSGTAGAANPSGSAFGSAFGSTFGNKPAGTSPFGAASTTGAFGGTNQNQSPFGSNTAGTFGSGASNTFGGGANSTFGKPATGFGSSGGAFGGNTNTGGAGGGLFGSSGNAFGGQSSSGFGAANNSSPFGQAQSNNAFGGANNNSPFGQSNTQQQSGGLFGSGTGNAFGSNTGGSTFGSNNTGFGAGGNAFGQQGNTGFGANKPVTTGFGSSTSGGLFGQQSQQQQPGATGGLFGQNQQQQQNAGGGLFGAKPAGGSVFGQSNTNASGGGLFGGQQNTPTTGGGLFGSKPAASGGLFGGQQSGQAQQGGGLFGQQNQQNTSGGGLFGNKPTGPTTTNGGGLFGNKPATGGGLFGGQQQQTQQQQQPQPSQLGGGLFGAKPGTTASSGGGLFGGQQQTSNVGGGLFGGGAASTGGLFGAKTNANATSNSTSTGGLFGGATTVQQQPQQAQQALASINSQNPYGNNPLFQSITGTSSQQQQQQQQQQQTNNLPQFSLVKSAAPIKKAVTLGSTSQKVTPLFKVSSLPTKTSTELVKEDTVKNKKTDDLFSAATDQAIISSDIFRPKESFKSLVLDKSKASNALLTESSSGPTKQVTFVLDKSESKELSASTPEPLDKDEKSKLELQGEQQKQQQGQDQDSDVDSEGYWMSPSLQELKKKSLLELKSIPKFKIGRKHYGELEFLEPVDLTSIVNLDDIAGNLVTFSNKTCVVYPDDNKPKPGEGLNLPARITLEGCYPINKADKLPILDPKSEIVKRHIENLKTIPEMKFISYDPTNGHWTFEVQEMD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.86
3	0.85
4	0.86
5	0.85
6	0.83
7	0.77
8	0.72
9	0.76
10	0.7
11	0.68
12	0.59
13	0.59
14	0.52
15	0.5
16	0.46
17	0.37
18	0.36
19	0.3
20	0.32
21	0.29
22	0.28
23	0.26
24	0.29
25	0.32
26	0.28
27	0.25
28	0.21
29	0.17
30	0.16
31	0.14
32	0.11
33	0.05
34	0.05
35	0.04
36	0.04
37	0.04
38	0.04
39	0.04
40	0.05
41	0.05
42	0.05
43	0.1
44	0.11
45	0.11
46	0.16
47	0.19
48	0.2
49	0.21
50	0.21
51	0.17
52	0.16
53	0.16
54	0.13
55	0.1
56	0.08
57	0.08
58	0.07
59	0.06
60	0.06
61	0.05
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.05
67	0.05
68	0.06
69	0.09
70	0.09
71	0.11
72	0.14
73	0.15
74	0.18
75	0.21
76	0.22
77	0.19
78	0.19
79	0.18
80	0.15
81	0.15
82	0.12
83	0.09
84	0.09
85	0.11
86	0.1
87	0.1
88	0.11
89	0.11
90	0.12
91	0.12
92	0.12
93	0.11
94	0.11
95	0.13
96	0.12
97	0.13
98	0.12
99	0.11
100	0.1
101	0.12
102	0.14
103	0.14
104	0.16
105	0.16
106	0.18
107	0.18
108	0.19
109	0.18
110	0.16
111	0.16
112	0.13
113	0.13
114	0.11
115	0.12
116	0.11
117	0.1
118	0.08
119	0.07
120	0.07
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.09
130	0.1
131	0.12
132	0.13
133	0.17
134	0.21
135	0.25
136	0.34
137	0.42
138	0.49
139	0.54
140	0.59
141	0.62
142	0.61
143	0.59
144	0.53
145	0.44
146	0.39
147	0.33
148	0.3
149	0.23
150	0.2
151	0.23
152	0.2
153	0.21
154	0.18
155	0.18
156	0.15
157	0.15
158	0.16
159	0.12
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.05
168	0.06
169	0.05
170	0.06
171	0.07
172	0.07
173	0.08
174	0.09
175	0.12
176	0.12
177	0.14
178	0.15
179	0.14
180	0.15
181	0.14
182	0.14
183	0.12
184	0.12
185	0.11
186	0.1
187	0.1
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.09
192	0.09
193	0.08
194	0.09
195	0.09
196	0.11
197	0.12
198	0.12
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.1
204	0.08
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.09
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.1
215	0.12
216	0.15
217	0.15
218	0.16
219	0.17
220	0.18
221	0.24
222	0.22
223	0.24
224	0.29
225	0.28
226	0.27
227	0.32
228	0.31
229	0.27
230	0.28
231	0.24
232	0.2
233	0.21
234	0.21
235	0.15
236	0.16
237	0.14
238	0.14
239	0.14
240	0.12
241	0.13
242	0.2
243	0.29
244	0.28
245	0.32
246	0.32
247	0.35
248	0.36
249	0.34
250	0.37
251	0.3
252	0.32
253	0.28
254	0.29
255	0.32
256	0.36
257	0.44
258	0.38
259	0.41
260	0.4
261	0.45
262	0.44
263	0.39
264	0.35
265	0.32
266	0.31
267	0.27
268	0.28
269	0.23
270	0.22
271	0.21
272	0.19
273	0.12
274	0.08
275	0.08
276	0.05
277	0.04
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.03
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.05
312	0.06
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.11
326	0.14
327	0.16
328	0.17
329	0.18
330	0.17
331	0.17
332	0.18
333	0.17
334	0.13
335	0.11
336	0.1
337	0.09
338	0.08
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.13
343	0.14
344	0.16
345	0.16
346	0.18
347	0.18
348	0.19
349	0.21
350	0.16
351	0.16
352	0.15
353	0.15
354	0.14
355	0.15
356	0.15
357	0.12
358	0.11
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.07
378	0.08
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.12
384	0.12
385	0.11
386	0.1
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.04
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.08
420	0.08
421	0.1
422	0.09
423	0.1
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.12
429	0.11
430	0.15
431	0.16
432	0.17
433	0.17
434	0.17
435	0.15
436	0.12
437	0.16
438	0.13
439	0.14
440	0.13
441	0.14
442	0.14
443	0.14
444	0.15
445	0.14
446	0.15
447	0.14
448	0.22
449	0.25
450	0.27
451	0.26
452	0.25
453	0.22
454	0.2
455	0.19
456	0.1
457	0.06
458	0.05
459	0.06
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.04
464	0.04
465	0.05
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.05
472	0.05
473	0.06
474	0.06
475	0.07
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.08
482	0.07
483	0.08
484	0.05
485	0.06
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.11
499	0.1
500	0.1
501	0.09
502	0.09
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.08
507	0.09
508	0.1
509	0.1
510	0.1
511	0.09
512	0.08
513	0.07
514	0.07
515	0.06
516	0.06
517	0.08
518	0.1
519	0.12
520	0.13
521	0.15
522	0.15
523	0.14
524	0.14
525	0.12
526	0.1
527	0.08
528	0.07
529	0.06
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.11
534	0.14
535	0.16
536	0.16
537	0.16
538	0.14
539	0.15
540	0.15
541	0.11
542	0.08
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.05
548	0.04
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.04
553	0.03
554	0.04
555	0.05
556	0.07
557	0.07
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.09
562	0.08
563	0.07
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.05
571	0.06
572	0.06
573	0.07
574	0.07
575	0.08
576	0.09
577	0.08
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.06
584	0.06
585	0.07
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.05
591	0.06
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.06
598	0.07
599	0.07
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.12
612	0.12
613	0.13
614	0.14
615	0.15
616	0.14
617	0.14
618	0.14
619	0.1
620	0.09
621	0.08
622	0.08
623	0.08
624	0.08
625	0.09
626	0.09
627	0.09
628	0.1
629	0.12
630	0.12
631	0.12
632	0.15
633	0.15
634	0.18
635	0.17
636	0.17
637	0.15
638	0.15
639	0.15
640	0.12
641	0.11
642	0.09
643	0.09
644	0.08
645	0.08
646	0.07
647	0.06
648	0.05
649	0.06
650	0.06
651	0.07
652	0.1
653	0.09
654	0.09
655	0.1
656	0.15
657	0.17
658	0.21
659	0.24
660	0.28
661	0.33
662	0.38
663	0.41
664	0.39
665	0.37
666	0.32
667	0.29
668	0.23
669	0.19
670	0.14
671	0.1
672	0.1
673	0.08
674	0.08
675	0.08
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.07
680	0.06
681	0.07
682	0.07
683	0.09
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.07
688	0.07
689	0.09
690	0.1
691	0.07
692	0.07
693	0.08
694	0.09
695	0.1
696	0.1
697	0.07
698	0.06
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.04
703	0.03
704	0.03
705	0.02
706	0.02
707	0.02
708	0.02
709	0.02
710	0.02
711	0.02
712	0.02
713	0.03
714	0.03
715	0.06
716	0.06
717	0.07
718	0.08
719	0.1
720	0.11
721	0.12
722	0.16
723	0.16
724	0.16
725	0.17
726	0.17
727	0.16
728	0.15
729	0.15
730	0.11
731	0.08
732	0.07
733	0.06
734	0.05
735	0.05
736	0.05
737	0.07
738	0.08
739	0.09
740	0.11
741	0.12
742	0.13
743	0.18
744	0.24
745	0.22
746	0.21
747	0.2
748	0.21
749	0.2
750	0.19
751	0.16
752	0.11
753	0.13
754	0.13
755	0.13
756	0.11
757	0.12
758	0.15
759	0.2
760	0.19
761	0.18
762	0.18
763	0.2
764	0.2
765	0.19
766	0.19
767	0.14
768	0.15
769	0.15
770	0.16
771	0.15
772	0.2
773	0.23
774	0.26
775	0.3
776	0.34
777	0.42
778	0.5
779	0.56
780	0.58
781	0.61
782	0.59
783	0.61
784	0.6
785	0.59
786	0.53
787	0.47
788	0.39
789	0.34
790	0.33
791	0.27
792	0.26
793	0.18
794	0.15
795	0.16
796	0.25
797	0.26
798	0.25
799	0.25
800	0.22
801	0.26
802	0.26
803	0.25
804	0.19
805	0.19
806	0.21
807	0.26
808	0.27
809	0.23
810	0.24
811	0.27
812	0.27
813	0.27
814	0.27
815	0.26
816	0.25
817	0.25
818	0.27
819	0.26
820	0.33
821	0.33
822	0.32
823	0.3
824	0.32
825	0.32
826	0.32
827	0.32
828	0.26
829	0.26
830	0.27
831	0.28
832	0.29
833	0.32
834	0.38
835	0.43
836	0.44
837	0.44
838	0.43
839	0.44
840	0.44
841	0.44
842	0.38
843	0.36
844	0.33
845	0.31
846	0.33
847	0.27
848	0.23
849	0.19
850	0.15
851	0.1
852	0.1
853	0.09
854	0.07
855	0.08
856	0.11
857	0.17
858	0.18
859	0.19
860	0.2
861	0.23
862	0.29
863	0.31
864	0.32
865	0.28
866	0.34
867	0.35
868	0.41
869	0.42
870	0.38
871	0.35
872	0.36
873	0.36
874	0.32
875	0.29
876	0.24
877	0.2
878	0.22
879	0.21
880	0.18
881	0.18
882	0.17
883	0.17
884	0.17
885	0.16
886	0.13
887	0.15
888	0.15
889	0.14
890	0.16
891	0.18
892	0.2
893	0.21
894	0.26
895	0.28
896	0.28
897	0.3
898	0.34
899	0.3
900	0.27
901	0.27
902	0.22
903	0.22
904	0.25
905	0.22
906	0.18
907	0.21
908	0.21
909	0.2
910	0.22
911	0.24
912	0.21
913	0.26
914	0.3
915	0.3
916	0.33
917	0.38
918	0.39
919	0.4
920	0.42
921	0.43
922	0.47
923	0.5
924	0.5
925	0.49
926	0.5
927	0.47
928	0.47
929	0.47
930	0.41
931	0.41
932	0.4
933	0.36
934	0.33
935	0.31
936	0.3
937	0.23
938	0.19
939	0.15
940	0.12
941	0.11
942	0.09
943	0.09
944	0.08
945	0.08
946	0.09
947	0.11
948	0.18
949	0.23
950	0.29
951	0.33
952	0.4
953	0.45
954	0.45
955	0.48
956	0.48
957	0.46
958	0.46
959	0.51
960	0.53
961	0.56
962	0.59
963	0.55
964	0.54
965	0.57
966	0.57
967	0.59
968	0.56
969	0.58
970	0.61
971	0.67
972	0.66
973	0.65
974	0.61
975	0.54
976	0.5
977	0.4
978	0.33
979	0.27
980	0.2
981	0.16
982	0.14
983	0.11
984	0.08
985	0.07
986	0.08
987	0.07
988	0.07
989	0.07
990	0.06
991	0.07
992	0.07
993	0.08
994	0.07
995	0.07
996	0.07
997	0.08
998	0.08
999	0.08
1000	0.1
1001	0.11
1002	0.13
1003	0.15
1004	0.17
1005	0.19
1006	0.26
1007	0.34
1008	0.36
1009	0.44
1010	0.53
1011	0.54
1012	0.56
1013	0.55
1014	0.51
1015	0.46
1016	0.45
1017	0.41
1018	0.34
1019	0.41
1020	0.45
1021	0.45
1022	0.42
1023	0.4
1024	0.38
1025	0.32
1026	0.28
1027	0.2
1028	0.17
1029	0.18
1030	0.19
1031	0.2
1032	0.2
1033	0.24
1034	0.3
1035	0.3
1036	0.28
1037	0.31
1038	0.36
1039	0.38
1040	0.42
1041	0.46
1042	0.45
1043	0.46
1044	0.45
1045	0.42
1046	0.44
1047	0.44
1048	0.43
1049	0.4
1050	0.44
1051	0.43
1052	0.52
1053	0.55
1054	0.49
1055	0.52
1056	0.55
1057	0.55
1058	0.5
1059	0.53
1060	0.44
1061	0.42
1062	0.42
1063	0.36
1064	0.33
1065	0.28
1066	0.31
1067	0.28
1068	0.29
1069	0.27
1070	0.29
1071	0.34
1072	0.32
1073	0.33
1074	0.27
1075	0.27
1076	0.27

A0A1D8PKH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer