Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4U9H5

Protein Details
Accession N4U9H5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MGSSNKKKREKQKDFQKPKFKVGKDKPKASNFTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-28KKKREKQKDFQKPKFKVGKDKPK
Subcellular Location(s) nucl 9mito 9mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSSNKKKREKQKDFQKPKFKVGKDKPKASNFTDTSFKSKAIVMGHQSLSTVAPDVVQQFKHNLSLASSSKSDKQRREALAYLTSQLSAEPPVNPVGTHAVLAKLLPLISDSSTPVRSQLLKLFRELPAEEVRHSVEQAIMFIRAGMTHLSADISNDSLGVMEWILDVAENDLIVCPGGWVKTLNSFCAMMGWALTNSKAGWSSGSRSGLRAKDASTYARQIATLSRFVGAGLRPEAEIPEDESEIWDNLYRIPQDSNAFEYLNLYGTRRDEEGEMYSSRDARQRVFERRFLEAVLKGTDQAKKEGGATGRAAAGLDKVLQDGMGEYESSTAMDTQDLLSLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.95
3 0.95
4 0.89
5 0.88
6 0.88
7 0.82
8 0.82
9 0.82
10 0.83
11 0.82
12 0.86
13 0.85
14 0.84
15 0.84
16 0.78
17 0.77
18 0.68
19 0.62
20 0.6
21 0.53
22 0.5
23 0.46
24 0.41
25 0.32
26 0.31
27 0.31
28 0.27
29 0.3
30 0.28
31 0.32
32 0.33
33 0.31
34 0.3
35 0.27
36 0.24
37 0.19
38 0.15
39 0.09
40 0.08
41 0.1
42 0.12
43 0.15
44 0.15
45 0.17
46 0.18
47 0.2
48 0.22
49 0.22
50 0.19
51 0.18
52 0.23
53 0.24
54 0.24
55 0.24
56 0.24
57 0.31
58 0.4
59 0.46
60 0.46
61 0.51
62 0.56
63 0.59
64 0.63
65 0.59
66 0.54
67 0.5
68 0.45
69 0.4
70 0.31
71 0.27
72 0.2
73 0.17
74 0.13
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.1
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.1
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.17
106 0.22
107 0.26
108 0.26
109 0.28
110 0.3
111 0.29
112 0.31
113 0.29
114 0.26
115 0.24
116 0.24
117 0.23
118 0.21
119 0.22
120 0.19
121 0.19
122 0.15
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.05
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.02
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.15
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.08
189 0.09
190 0.12
191 0.16
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.27
196 0.26
197 0.27
198 0.25
199 0.21
200 0.21
201 0.22
202 0.24
203 0.21
204 0.22
205 0.21
206 0.2
207 0.2
208 0.17
209 0.19
210 0.19
211 0.18
212 0.16
213 0.15
214 0.14
215 0.14
216 0.16
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.09
236 0.1
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.14
241 0.17
242 0.19
243 0.2
244 0.22
245 0.21
246 0.21
247 0.19
248 0.19
249 0.16
250 0.16
251 0.15
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.16
256 0.16
257 0.17
258 0.15
259 0.17
260 0.19
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.2
265 0.2
266 0.21
267 0.24
268 0.23
269 0.22
270 0.31
271 0.37
272 0.46
273 0.51
274 0.55
275 0.53
276 0.56
277 0.55
278 0.46
279 0.43
280 0.36
281 0.33
282 0.29
283 0.26
284 0.23
285 0.26
286 0.29
287 0.26
288 0.27
289 0.26
290 0.23
291 0.24
292 0.28
293 0.26
294 0.25
295 0.25
296 0.23
297 0.22
298 0.21
299 0.2
300 0.15
301 0.14
302 0.11
303 0.11
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09