Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4UHD6

Protein Details
Accession N4UHD6    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-31DHAAAKAEKKAKKEKKRAREEDVAADTBasic
47-74PEASSDLKAEKKKKKSKKDKHAEDAVAQHydrophilic
78-104KAPAVEDKSEKKHKKKKHHDAEVAVTEBasic
110-131VAADSEKKKKSKKNHKETEAIEHydrophilic
409-432AETAKMRKGKKGGQRVQRRRIPEFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-41KAEKKAKKEKKRAREEDVAADTERKHKKSKSV
53-68LKAEKKKKKSKKDKHA
84-95DKSEKKHKKKKH
116-141KKKKSKKNHKETEAIEIAERPKKSKK
413-428KMRKGKKGGQRVQRRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.166, mito_nucl 9.666, cyto 8, cyto_mito 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAPIDHAAAKAEKKAKKEKKRAREEDVAADTERKHKKSKSVAAVEAPEASSDLKAEKKKKKSKKDKHAEDAVAQAETKAPAVEDKSEKKHKKKKHHDAEVAVTEEVDTPVAADSEKKKKSKKNHKETEAIEIAERPKKSKKDETAAEPEENASPADPDAMEIDMPPPAKPSKSNSNIYQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLFPIGWAQPVTNCQQQHLSHLRNKYVPSLRGVLLDYKNVAFGENPGRKGAATDDESPATVMAKGESAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGNGDKVKGKIRFRIRNFDVGTSGETSYLSLEGTMLDKAGEKAVVAEEAETAKMRKGKKGGQRVQRRRIPEFSMTRFAVEGEEQTEDNEAEKREVLALPEDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.63
3 0.69
4 0.79
5 0.82
6 0.84
7 0.92
8 0.93
9 0.9
10 0.89
11 0.83
12 0.81
13 0.75
14 0.66
15 0.56
16 0.5
17 0.43
18 0.43
19 0.46
20 0.41
21 0.44
22 0.47
23 0.55
24 0.62
25 0.71
26 0.72
27 0.72
28 0.73
29 0.71
30 0.69
31 0.6
32 0.51
33 0.41
34 0.3
35 0.23
36 0.19
37 0.13
38 0.11
39 0.12
40 0.17
41 0.25
42 0.35
43 0.44
44 0.54
45 0.65
46 0.75
47 0.83
48 0.88
49 0.91
50 0.93
51 0.95
52 0.95
53 0.93
54 0.92
55 0.85
56 0.76
57 0.69
58 0.59
59 0.49
60 0.38
61 0.28
62 0.2
63 0.17
64 0.15
65 0.09
66 0.08
67 0.1
68 0.12
69 0.18
70 0.23
71 0.3
72 0.38
73 0.49
74 0.58
75 0.66
76 0.74
77 0.78
78 0.82
79 0.87
80 0.9
81 0.9
82 0.92
83 0.9
84 0.86
85 0.84
86 0.78
87 0.68
88 0.57
89 0.45
90 0.35
91 0.27
92 0.21
93 0.13
94 0.07
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.09
100 0.15
101 0.25
102 0.32
103 0.38
104 0.46
105 0.54
106 0.65
107 0.73
108 0.78
109 0.8
110 0.84
111 0.85
112 0.85
113 0.78
114 0.76
115 0.68
116 0.57
117 0.46
118 0.38
119 0.35
120 0.32
121 0.31
122 0.25
123 0.3
124 0.35
125 0.42
126 0.49
127 0.53
128 0.57
129 0.62
130 0.66
131 0.68
132 0.65
133 0.58
134 0.49
135 0.42
136 0.33
137 0.28
138 0.21
139 0.11
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.15
157 0.2
158 0.28
159 0.35
160 0.4
161 0.41
162 0.49
163 0.54
164 0.54
165 0.53
166 0.43
167 0.38
168 0.35
169 0.32
170 0.26
171 0.24
172 0.26
173 0.22
174 0.23
175 0.22
176 0.19
177 0.22
178 0.19
179 0.17
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.12
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.11
198 0.14
199 0.18
200 0.17
201 0.16
202 0.21
203 0.21
204 0.28
205 0.32
206 0.34
207 0.34
208 0.37
209 0.39
210 0.36
211 0.37
212 0.37
213 0.35
214 0.31
215 0.29
216 0.29
217 0.27
218 0.25
219 0.25
220 0.23
221 0.19
222 0.18
223 0.16
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.07
229 0.08
230 0.17
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.19
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.17
245 0.16
246 0.12
247 0.09
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.05
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.07
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.13
298 0.14
299 0.16
300 0.19
301 0.23
302 0.23
303 0.26
304 0.26
305 0.23
306 0.23
307 0.32
308 0.33
309 0.35
310 0.38
311 0.41
312 0.42
313 0.44
314 0.47
315 0.39
316 0.38
317 0.33
318 0.31
319 0.26
320 0.23
321 0.19
322 0.14
323 0.13
324 0.09
325 0.08
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.12
346 0.1
347 0.11
348 0.13
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.17
354 0.24
355 0.3
356 0.32
357 0.38
358 0.47
359 0.56
360 0.61
361 0.7
362 0.67
363 0.69
364 0.67
365 0.6
366 0.52
367 0.43
368 0.4
369 0.31
370 0.27
371 0.18
372 0.16
373 0.14
374 0.12
375 0.11
376 0.09
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.15
400 0.2
401 0.22
402 0.28
403 0.35
404 0.43
405 0.51
406 0.62
407 0.67
408 0.73
409 0.81
410 0.85
411 0.88
412 0.87
413 0.84
414 0.8
415 0.77
416 0.73
417 0.71
418 0.69
419 0.65
420 0.66
421 0.59
422 0.53
423 0.47
424 0.41
425 0.33
426 0.26
427 0.21
428 0.15
429 0.17
430 0.15
431 0.16
432 0.17
433 0.15
434 0.15
435 0.17
436 0.17
437 0.17
438 0.18
439 0.18
440 0.19
441 0.2
442 0.21