Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4TDH2

Protein Details
Accession N4TDH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-134ESDSNLRKRKRDEPQPADPKLREBasic
175-195EYEQIPTRREKQRRIEAPENPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
714-727RRREDKAKKAAGQR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10, mito 5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034482  Mrd1_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12565  RRM1_MRD1  
cd12568  RRM3_MRD1  
cd12320  RRM6_RBM19_RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MASSRIFIKGLPPSISEADFRKHFSAQGREITDVKLIPQRRIGYVGYKTPEDASKAVKYFNRSYIRMSKIAVETARPISDPALTKGQSAWHSKAASTPSTTIKGNEQPAERESDSNLRKRKRDEPQPADPKLREFLHVMKEGREGALDDGVRGGIGDGVAAVAATAVPEEESDDEYEQIPTRREKQRRIEAPENPLVSQSLPSQLKEARVVSDIQAETPAGDEPVEPQEAAAKSNLEQQEVVAEDDDWLRSRTNRLLDLVDPDDLERTLAQGPSTTETDHAEGGEAMELTSVDPPATADVAMNETTMEASGGEPAKDDSLEAIRRTSRLFVRNLPYSATQEDLRETFERFGTIEEVHLPVSNSGTSKGFALVLFTDPSGAVEAFQAMDGATFQGRILHIIPASAKRDTGLDEFAISKLPLKKQNMIRKKQEAAATTFNWNALYMSQDAVNASVADRLGVSKSELLDPTSADAAIKQAIAETSVIQETKAYFTANGVDLEAFKSKKRAILVKNFPSGTTIDELRKLFEESGPVLRVLMPPSGTIAIVQFSQPNYAKSAFGKLAYRRIGDSVLFLEKAPSDIFRGGDQLDQAVSLKDRPAPTVQNLSVDDLLSRGDKPEEDLETTSLFVRNLNFSTSTSRLAEAFQSLDGFVSARVKTKMDPKKPGQTLSMGFGFVEFRTRSQAQAALKVMDGHVLDDHALAVKASHKGHDAAEERRREDKAKKAAGQRTKIIIKNLPFQATKKDIRSLFGTYGQLRSVRLPKKADYTPRGFAFADFVTPREAENALNALRDTHLLGRKLVLDFAEAEAVDAEEEIAKMQKKVGGQVNKVALQQLTGKGRSRVNIGNENDEMDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.34
4 0.31
5 0.32
6 0.33
7 0.36
8 0.34
9 0.33
10 0.36
11 0.41
12 0.46
13 0.45
14 0.51
15 0.49
16 0.49
17 0.49
18 0.46
19 0.41
20 0.32
21 0.3
22 0.29
23 0.29
24 0.3
25 0.36
26 0.38
27 0.36
28 0.4
29 0.39
30 0.39
31 0.42
32 0.45
33 0.42
34 0.4
35 0.39
36 0.38
37 0.38
38 0.34
39 0.31
40 0.29
41 0.32
42 0.33
43 0.37
44 0.38
45 0.42
46 0.44
47 0.51
48 0.53
49 0.47
50 0.53
51 0.57
52 0.59
53 0.55
54 0.51
55 0.48
56 0.42
57 0.46
58 0.4
59 0.33
60 0.32
61 0.33
62 0.32
63 0.26
64 0.25
65 0.2
66 0.24
67 0.25
68 0.24
69 0.29
70 0.28
71 0.28
72 0.29
73 0.33
74 0.34
75 0.38
76 0.37
77 0.36
78 0.36
79 0.36
80 0.39
81 0.38
82 0.35
83 0.32
84 0.32
85 0.3
86 0.32
87 0.33
88 0.3
89 0.32
90 0.36
91 0.38
92 0.4
93 0.38
94 0.39
95 0.39
96 0.45
97 0.4
98 0.34
99 0.32
100 0.36
101 0.4
102 0.45
103 0.52
104 0.53
105 0.58
106 0.63
107 0.69
108 0.7
109 0.75
110 0.78
111 0.77
112 0.81
113 0.84
114 0.83
115 0.81
116 0.72
117 0.65
118 0.59
119 0.52
120 0.44
121 0.37
122 0.37
123 0.36
124 0.42
125 0.39
126 0.35
127 0.37
128 0.35
129 0.32
130 0.26
131 0.2
132 0.15
133 0.18
134 0.16
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.03
155 0.03
156 0.05
157 0.06
158 0.08
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.14
164 0.15
165 0.17
166 0.19
167 0.21
168 0.29
169 0.39
170 0.46
171 0.54
172 0.62
173 0.7
174 0.76
175 0.81
176 0.81
177 0.78
178 0.77
179 0.74
180 0.66
181 0.55
182 0.47
183 0.38
184 0.3
185 0.25
186 0.18
187 0.2
188 0.2
189 0.2
190 0.23
191 0.24
192 0.26
193 0.28
194 0.28
195 0.22
196 0.22
197 0.22
198 0.2
199 0.24
200 0.22
201 0.18
202 0.18
203 0.16
204 0.14
205 0.14
206 0.13
207 0.06
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.13
220 0.13
221 0.21
222 0.22
223 0.17
224 0.17
225 0.16
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.15
239 0.19
240 0.22
241 0.23
242 0.24
243 0.26
244 0.26
245 0.29
246 0.27
247 0.22
248 0.19
249 0.17
250 0.16
251 0.13
252 0.12
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.14
261 0.15
262 0.14
263 0.13
264 0.14
265 0.15
266 0.14
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.04
296 0.04
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.06
306 0.1
307 0.13
308 0.13
309 0.15
310 0.16
311 0.17
312 0.18
313 0.21
314 0.22
315 0.24
316 0.27
317 0.31
318 0.36
319 0.39
320 0.39
321 0.37
322 0.33
323 0.31
324 0.28
325 0.24
326 0.19
327 0.16
328 0.16
329 0.15
330 0.16
331 0.14
332 0.15
333 0.14
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.09
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.05
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.1
388 0.12
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.14
395 0.14
396 0.12
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.08
403 0.11
404 0.13
405 0.16
406 0.22
407 0.25
408 0.31
409 0.39
410 0.49
411 0.55
412 0.6
413 0.63
414 0.62
415 0.62
416 0.59
417 0.55
418 0.47
419 0.42
420 0.39
421 0.33
422 0.29
423 0.27
424 0.23
425 0.19
426 0.16
427 0.12
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.09
456 0.08
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.05
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.08
477 0.07
478 0.08
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.08
484 0.08
485 0.1
486 0.12
487 0.11
488 0.1
489 0.14
490 0.14
491 0.17
492 0.2
493 0.27
494 0.3
495 0.4
496 0.49
497 0.53
498 0.57
499 0.54
500 0.51
501 0.44
502 0.38
503 0.29
504 0.22
505 0.17
506 0.13
507 0.17
508 0.18
509 0.17
510 0.18
511 0.17
512 0.16
513 0.14
514 0.15
515 0.13
516 0.16
517 0.16
518 0.15
519 0.14
520 0.14
521 0.14
522 0.13
523 0.13
524 0.1
525 0.09
526 0.1
527 0.11
528 0.1
529 0.09
530 0.08
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.13
537 0.14
538 0.14
539 0.17
540 0.17
541 0.18
542 0.18
543 0.22
544 0.18
545 0.19
546 0.24
547 0.23
548 0.3
549 0.31
550 0.31
551 0.27
552 0.28
553 0.27
554 0.22
555 0.21
556 0.15
557 0.14
558 0.14
559 0.13
560 0.12
561 0.11
562 0.12
563 0.11
564 0.09
565 0.1
566 0.11
567 0.12
568 0.12
569 0.13
570 0.13
571 0.13
572 0.12
573 0.11
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.09
581 0.13
582 0.14
583 0.16
584 0.19
585 0.22
586 0.25
587 0.31
588 0.3
589 0.3
590 0.31
591 0.31
592 0.27
593 0.24
594 0.2
595 0.13
596 0.13
597 0.1
598 0.09
599 0.08
600 0.09
601 0.09
602 0.12
603 0.15
604 0.17
605 0.18
606 0.19
607 0.19
608 0.18
609 0.19
610 0.17
611 0.15
612 0.12
613 0.12
614 0.12
615 0.14
616 0.14
617 0.15
618 0.16
619 0.16
620 0.21
621 0.22
622 0.24
623 0.22
624 0.22
625 0.2
626 0.2
627 0.2
628 0.15
629 0.14
630 0.11
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.09
635 0.08
636 0.07
637 0.1
638 0.1
639 0.14
640 0.15
641 0.16
642 0.2
643 0.3
644 0.39
645 0.44
646 0.53
647 0.56
648 0.65
649 0.68
650 0.68
651 0.61
652 0.56
653 0.49
654 0.44
655 0.38
656 0.28
657 0.23
658 0.21
659 0.19
660 0.13
661 0.17
662 0.13
663 0.13
664 0.2
665 0.21
666 0.21
667 0.22
668 0.28
669 0.24
670 0.3
671 0.31
672 0.26
673 0.25
674 0.25
675 0.23
676 0.21
677 0.18
678 0.13
679 0.11
680 0.1
681 0.1
682 0.09
683 0.09
684 0.07
685 0.07
686 0.06
687 0.07
688 0.1
689 0.14
690 0.15
691 0.17
692 0.18
693 0.19
694 0.2
695 0.28
696 0.29
697 0.33
698 0.4
699 0.44
700 0.45
701 0.48
702 0.5
703 0.48
704 0.51
705 0.52
706 0.54
707 0.58
708 0.62
709 0.66
710 0.73
711 0.76
712 0.75
713 0.71
714 0.68
715 0.67
716 0.64
717 0.6
718 0.57
719 0.52
720 0.55
721 0.54
722 0.52
723 0.47
724 0.44
725 0.47
726 0.48
727 0.5
728 0.46
729 0.49
730 0.45
731 0.46
732 0.48
733 0.44
734 0.4
735 0.38
736 0.39
737 0.33
738 0.34
739 0.33
740 0.3
741 0.27
742 0.3
743 0.35
744 0.36
745 0.41
746 0.44
747 0.46
748 0.52
749 0.59
750 0.62
751 0.62
752 0.62
753 0.63
754 0.6
755 0.59
756 0.52
757 0.44
758 0.38
759 0.3
760 0.29
761 0.22
762 0.21
763 0.2
764 0.2
765 0.2
766 0.18
767 0.19
768 0.13
769 0.15
770 0.19
771 0.17
772 0.18
773 0.18
774 0.16
775 0.16
776 0.17
777 0.17
778 0.2
779 0.25
780 0.26
781 0.27
782 0.28
783 0.31
784 0.31
785 0.3
786 0.23
787 0.18
788 0.18
789 0.18
790 0.18
791 0.14
792 0.14
793 0.12
794 0.12
795 0.1
796 0.08
797 0.07
798 0.06
799 0.06
800 0.07
801 0.11
802 0.13
803 0.13
804 0.16
805 0.19
806 0.2
807 0.27
808 0.36
809 0.41
810 0.43
811 0.5
812 0.54
813 0.54
814 0.53
815 0.48
816 0.39
817 0.32
818 0.33
819 0.33
820 0.33
821 0.35
822 0.38
823 0.4
824 0.44
825 0.45
826 0.46
827 0.46
828 0.47
829 0.51
830 0.51
831 0.52
832 0.49