Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4U2P3

Protein Details
Accession N4U2P3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-261DRDERRSQSRGRSRSRSRSRSRSRSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-152RKLRRRG
241-261RSQSRGRSRSRSRSRSRSRSP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSRNKDTVHADARRFLDERGSNVSVAPNGLNPATIMEKAVKDRIVDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVNFIGGTYGVTQKPSPFLCLAFKLLELSPSDAVLMEYLKYGGEAFKYLRALACFYFRLTRQAKDVYEMLEPFLEDRRKLRRRGRAGVVLTFMDEFVDELLTKERVCGTSLWKMPKREVLEDLEILEPRVSPLGDLEDLLEEEDEAEKENGTREESGEISDRDDMEVDRDERRSQSRGRSRSRSRSRSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.39
3 0.39
4 0.35
5 0.36
6 0.37
7 0.36
8 0.32
9 0.31
10 0.33
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.2
29 0.22
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.29
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.26
39 0.25
40 0.27
41 0.26
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.16
73 0.17
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.14
113 0.21
114 0.21
115 0.22
116 0.23
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.15
132 0.25
133 0.31
134 0.4
135 0.47
136 0.53
137 0.59
138 0.66
139 0.69
140 0.66
141 0.63
142 0.57
143 0.5
144 0.4
145 0.32
146 0.25
147 0.18
148 0.1
149 0.08
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.15
164 0.22
165 0.27
166 0.35
167 0.39
168 0.41
169 0.42
170 0.48
171 0.48
172 0.43
173 0.42
174 0.38
175 0.36
176 0.34
177 0.33
178 0.28
179 0.23
180 0.21
181 0.17
182 0.12
183 0.09
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.14
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.2
216 0.19
217 0.17
218 0.18
219 0.16
220 0.15
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.29
227 0.33
228 0.36
229 0.37
230 0.47
231 0.53
232 0.6
233 0.68
234 0.74
235 0.79
236 0.85
237 0.9
238 0.89
239 0.9
240 0.91
241 0.92