Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DP27

Protein Details
Accession B0DP27    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-192LREASGIGRKRKRKGRTTGPVLSQQHydrophilic
686-705PFRGMFPRSHRKKQKVETEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-183GRKRKRKGR
Subcellular Location(s) mito_nucl 9.666, nucl 9.5, mito 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039340  Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_306967  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTFCYSSSTARALSLLIFISSNTTPWTLCYPCLYAIEYPGRNLDSGEILIQMITVRGCVRSLQMLSRTDDEMDVDEDFVEGVTDEDNDGSASNSEEDAEGEDDEENEDDAPNPEETYAEKEIEGDFDRLVQNIRLRDTSSNNGASGSGLTKDWDFSIEEKEAEFRDDLREASGIGRKRKRKGRTTGPVLSQQVRSLIGDGNQAYVDSNLPEAIRMMQEVIRIEPRAASAWSVLAQCYEDMEQGQKALQLRIMAAHLRHDADEWDRLARQSREHGYNQQALYCYRKVYSLDPTNVDALWDRASLAKEIGDFRTARNAFTSILKRFPHDLTVLRELHTILVELSELPTCADLLQAAFDHYQRIYPTPSQTIFTKLDLLLLADLYNALGEHEKAAQTIRRGTRWLQGRAEQRYWDLCEDDREYDMDGWPARSVIGEGGGIQAGRYELDANARHRLAVARIKMGEIEEGKLHANAVLAQDILDYAVLFAEIADAYFEREMYAEAKPIYELLGADPATSSIYILLQTAACMKMLEELREAAEVYEHIRQADPTHNDAKMKLAEIYEILGEPRRALELVYEVIDSRKKRAKAPATQSEDDPTTASLFAEERIARTKANAIRLQNRLTHLQLRELETAKEKEVMQGYRKIRELWAGMMGGDEECEREWMVEAEKLVDMFRETRNLFLTSRNNPFRGMFPRSHRKKQKVETEADEDRMASRLQLDLERDSMSRKATKGDAQIGKVDVFRGISFDDWLKLFMQYCFLLTRRGQYDVADEILRHIMVSNAYQARERQDSIRLAIITCGLAAGQHTAVVEQARKLITVHQFNNEPLRILMACLSSGLRPTDSFITSTLQKHLFREMKLADTAVKSPEVLKWNPLNKRYAPTAQSGKAEDGAEEDGDDGVPDQGGDQESGATATAGSLNVPEIPTKHNPVIVAIYGQICIAAKSYQSAIFYLLHAYDYCPDDPMICLCLAIASIGRAMQRQSDNRHHLVTQAMAFLTQYRSLRGSGMQSVREVEYNFARTFHQLGLYSYAVKHYENVLELAEKNNDDLFAKEAAYNLSLIFVFTGATHLANALYRRWLSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.11
4 0.11
5 0.1
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.16
13 0.22
14 0.2
15 0.22
16 0.25
17 0.25
18 0.27
19 0.29
20 0.29
21 0.24
22 0.29
23 0.36
24 0.33
25 0.31
26 0.33
27 0.32
28 0.29
29 0.29
30 0.24
31 0.17
32 0.17
33 0.16
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.13
47 0.18
48 0.21
49 0.26
50 0.31
51 0.34
52 0.37
53 0.39
54 0.38
55 0.33
56 0.31
57 0.26
58 0.22
59 0.19
60 0.16
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.08
66 0.07
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.13
103 0.18
104 0.19
105 0.18
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.21
110 0.22
111 0.17
112 0.14
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.18
117 0.19
118 0.21
119 0.24
120 0.27
121 0.26
122 0.29
123 0.32
124 0.36
125 0.38
126 0.39
127 0.38
128 0.35
129 0.33
130 0.31
131 0.26
132 0.22
133 0.17
134 0.12
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.18
147 0.2
148 0.19
149 0.2
150 0.19
151 0.14
152 0.17
153 0.18
154 0.18
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.18
159 0.23
160 0.25
161 0.33
162 0.42
163 0.48
164 0.57
165 0.66
166 0.72
167 0.76
168 0.81
169 0.82
170 0.84
171 0.86
172 0.84
173 0.8
174 0.78
175 0.73
176 0.67
177 0.57
178 0.47
179 0.4
180 0.33
181 0.28
182 0.21
183 0.19
184 0.16
185 0.19
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.13
205 0.14
206 0.16
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.14
215 0.11
216 0.12
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.16
239 0.16
240 0.14
241 0.17
242 0.18
243 0.18
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.2
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.19
253 0.25
254 0.25
255 0.25
256 0.29
257 0.34
258 0.38
259 0.41
260 0.46
261 0.46
262 0.5
263 0.47
264 0.42
265 0.38
266 0.34
267 0.35
268 0.3
269 0.25
270 0.2
271 0.22
272 0.22
273 0.23
274 0.31
275 0.33
276 0.35
277 0.36
278 0.37
279 0.36
280 0.33
281 0.31
282 0.22
283 0.15
284 0.13
285 0.11
286 0.09
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.15
297 0.15
298 0.25
299 0.24
300 0.23
301 0.23
302 0.23
303 0.21
304 0.27
305 0.32
306 0.25
307 0.31
308 0.31
309 0.32
310 0.34
311 0.34
312 0.31
313 0.28
314 0.29
315 0.28
316 0.34
317 0.33
318 0.3
319 0.3
320 0.27
321 0.24
322 0.2
323 0.15
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.16
349 0.18
350 0.21
351 0.24
352 0.25
353 0.25
354 0.25
355 0.29
356 0.27
357 0.25
358 0.24
359 0.19
360 0.19
361 0.17
362 0.16
363 0.11
364 0.09
365 0.08
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.09
379 0.11
380 0.13
381 0.2
382 0.22
383 0.23
384 0.25
385 0.27
386 0.32
387 0.37
388 0.41
389 0.37
390 0.4
391 0.46
392 0.5
393 0.5
394 0.44
395 0.38
396 0.36
397 0.34
398 0.29
399 0.23
400 0.18
401 0.2
402 0.21
403 0.19
404 0.17
405 0.16
406 0.16
407 0.15
408 0.15
409 0.13
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.05
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.1
432 0.14
433 0.16
434 0.2
435 0.2
436 0.19
437 0.19
438 0.2
439 0.19
440 0.22
441 0.21
442 0.2
443 0.2
444 0.21
445 0.2
446 0.2
447 0.18
448 0.12
449 0.12
450 0.09
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.04
466 0.03
467 0.02
468 0.02
469 0.02
470 0.02
471 0.02
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.06
493 0.05
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.05
514 0.09
515 0.1
516 0.11
517 0.1
518 0.11
519 0.11
520 0.11
521 0.11
522 0.06
523 0.06
524 0.05
525 0.07
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.11
532 0.17
533 0.18
534 0.19
535 0.21
536 0.22
537 0.23
538 0.23
539 0.24
540 0.18
541 0.16
542 0.14
543 0.11
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.08
564 0.12
565 0.12
566 0.16
567 0.21
568 0.22
569 0.26
570 0.36
571 0.43
572 0.48
573 0.56
574 0.61
575 0.63
576 0.62
577 0.59
578 0.52
579 0.44
580 0.35
581 0.27
582 0.17
583 0.1
584 0.09
585 0.09
586 0.07
587 0.06
588 0.06
589 0.09
590 0.09
591 0.09
592 0.12
593 0.13
594 0.13
595 0.13
596 0.19
597 0.2
598 0.27
599 0.3
600 0.3
601 0.36
602 0.4
603 0.42
604 0.39
605 0.38
606 0.34
607 0.32
608 0.34
609 0.27
610 0.29
611 0.29
612 0.3
613 0.3
614 0.29
615 0.28
616 0.26
617 0.27
618 0.22
619 0.22
620 0.18
621 0.18
622 0.21
623 0.23
624 0.22
625 0.29
626 0.3
627 0.32
628 0.33
629 0.31
630 0.28
631 0.28
632 0.26
633 0.19
634 0.19
635 0.15
636 0.13
637 0.12
638 0.12
639 0.08
640 0.07
641 0.06
642 0.04
643 0.04
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.06
648 0.06
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.08
657 0.08
658 0.09
659 0.1
660 0.14
661 0.14
662 0.16
663 0.18
664 0.2
665 0.2
666 0.24
667 0.29
668 0.29
669 0.38
670 0.4
671 0.39
672 0.38
673 0.38
674 0.37
675 0.38
676 0.37
677 0.33
678 0.38
679 0.48
680 0.55
681 0.64
682 0.69
683 0.71
684 0.76
685 0.79
686 0.81
687 0.78
688 0.75
689 0.7
690 0.68
691 0.61
692 0.53
693 0.45
694 0.34
695 0.27
696 0.23
697 0.18
698 0.1
699 0.09
700 0.08
701 0.09
702 0.11
703 0.13
704 0.13
705 0.14
706 0.15
707 0.15
708 0.16
709 0.17
710 0.17
711 0.19
712 0.18
713 0.19
714 0.21
715 0.26
716 0.28
717 0.35
718 0.36
719 0.34
720 0.36
721 0.34
722 0.32
723 0.28
724 0.23
725 0.15
726 0.12
727 0.11
728 0.1
729 0.09
730 0.09
731 0.1
732 0.1
733 0.11
734 0.1
735 0.11
736 0.11
737 0.11
738 0.12
739 0.11
740 0.13
741 0.12
742 0.13
743 0.14
744 0.14
745 0.18
746 0.17
747 0.23
748 0.22
749 0.26
750 0.25
751 0.23
752 0.26
753 0.22
754 0.24
755 0.18
756 0.16
757 0.14
758 0.14
759 0.13
760 0.1
761 0.09
762 0.08
763 0.08
764 0.09
765 0.14
766 0.15
767 0.16
768 0.18
769 0.19
770 0.22
771 0.25
772 0.26
773 0.22
774 0.26
775 0.28
776 0.28
777 0.31
778 0.26
779 0.23
780 0.22
781 0.21
782 0.14
783 0.12
784 0.1
785 0.05
786 0.05
787 0.05
788 0.06
789 0.05
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.08
794 0.09
795 0.1
796 0.09
797 0.12
798 0.12
799 0.12
800 0.13
801 0.18
802 0.24
803 0.3
804 0.32
805 0.34
806 0.36
807 0.37
808 0.44
809 0.38
810 0.31
811 0.23
812 0.24
813 0.19
814 0.18
815 0.18
816 0.12
817 0.11
818 0.11
819 0.12
820 0.09
821 0.12
822 0.12
823 0.11
824 0.11
825 0.14
826 0.17
827 0.17
828 0.17
829 0.16
830 0.19
831 0.21
832 0.23
833 0.25
834 0.27
835 0.28
836 0.29
837 0.37
838 0.39
839 0.36
840 0.41
841 0.37
842 0.35
843 0.34
844 0.33
845 0.26
846 0.24
847 0.24
848 0.2
849 0.18
850 0.15
851 0.16
852 0.2
853 0.23
854 0.22
855 0.27
856 0.33
857 0.41
858 0.48
859 0.51
860 0.52
861 0.5
862 0.54
863 0.53
864 0.52
865 0.47
866 0.47
867 0.5
868 0.47
869 0.47
870 0.44
871 0.4
872 0.36
873 0.33
874 0.26
875 0.21
876 0.18
877 0.15
878 0.13
879 0.12
880 0.08
881 0.08
882 0.08
883 0.06
884 0.05
885 0.05
886 0.05
887 0.04
888 0.07
889 0.08
890 0.08
891 0.08
892 0.08
893 0.08
894 0.08
895 0.08
896 0.06
897 0.05
898 0.05
899 0.06
900 0.06
901 0.06
902 0.06
903 0.06
904 0.08
905 0.08
906 0.1
907 0.1
908 0.16
909 0.21
910 0.27
911 0.28
912 0.29
913 0.28
914 0.29
915 0.31
916 0.26
917 0.22
918 0.18
919 0.16
920 0.15
921 0.14
922 0.12
923 0.09
924 0.09
925 0.09
926 0.08
927 0.08
928 0.1
929 0.12
930 0.14
931 0.15
932 0.16
933 0.16
934 0.16
935 0.17
936 0.17
937 0.15
938 0.13
939 0.13
940 0.13
941 0.15
942 0.17
943 0.17
944 0.17
945 0.17
946 0.16
947 0.17
948 0.18
949 0.16
950 0.12
951 0.12
952 0.1
953 0.1
954 0.09
955 0.09
956 0.08
957 0.06
958 0.07
959 0.09
960 0.1
961 0.11
962 0.12
963 0.18
964 0.25
965 0.31
966 0.39
967 0.48
968 0.55
969 0.57
970 0.59
971 0.53
972 0.48
973 0.44
974 0.39
975 0.3
976 0.25
977 0.21
978 0.18
979 0.17
980 0.17
981 0.17
982 0.19
983 0.18
984 0.19
985 0.2
986 0.21
987 0.23
988 0.24
989 0.25
990 0.29
991 0.33
992 0.32
993 0.31
994 0.33
995 0.33
996 0.33
997 0.29
998 0.25
999 0.26
1000 0.29
1001 0.28
1002 0.26
1003 0.26
1004 0.26
1005 0.28
1006 0.26
1007 0.25
1008 0.22
1009 0.23
1010 0.27
1011 0.27
1012 0.26
1013 0.24
1014 0.26
1015 0.22
1016 0.21
1017 0.21
1018 0.19
1019 0.21
1020 0.21
1021 0.22
1022 0.19
1023 0.21
1024 0.21
1025 0.23
1026 0.23
1027 0.2
1028 0.2
1029 0.2
1030 0.2
1031 0.18
1032 0.18
1033 0.17
1034 0.15
1035 0.16
1036 0.15
1037 0.15
1038 0.16
1039 0.16
1040 0.15
1041 0.12
1042 0.13
1043 0.11
1044 0.11
1045 0.1
1046 0.08
1047 0.07
1048 0.07
1049 0.09
1050 0.08
1051 0.09
1052 0.08
1053 0.09
1054 0.1
1055 0.13
1056 0.15
1057 0.15
1058 0.2