Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DAH6

Protein Details
Accession B0DAH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-210SLSLKARKHFRQEKKVEQSKRKADDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-31ARGKRSGKHA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_190409  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MQGFNKYYPPDYDPSQGSLNKARGKRSGKHALGDRARKIDQGILITRFELPFNIWCDTCHNHIGMGVRYNAEKKKIGAYYSTPIFSFRCKCHLCDGWFEIQTDPKNTRYVVVSGARQKDEDWNPEENGGFAIHGKSIDDMRADAPVDPLVALEKKAVATKNMNEVQIPRLESLQSVSEQYNADPYSLSLKARKHFRQEKKVEQSKRKADDLIKDRYGLPTSLSLLEDDDEMVQEAKEKWMKGKEEIQRNQNLRSLRPRRLAMDRLSIPSSSSRRIAPQSKEQTLASLKARILDNTARKSYPFGGGQSIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.41
3 0.38
4 0.38
5 0.41
6 0.45
7 0.47
8 0.48
9 0.5
10 0.53
11 0.59
12 0.61
13 0.64
14 0.67
15 0.63
16 0.67
17 0.69
18 0.7
19 0.72
20 0.73
21 0.68
22 0.64
23 0.61
24 0.54
25 0.48
26 0.42
27 0.36
28 0.33
29 0.33
30 0.29
31 0.29
32 0.28
33 0.28
34 0.25
35 0.22
36 0.17
37 0.14
38 0.16
39 0.19
40 0.21
41 0.19
42 0.2
43 0.24
44 0.27
45 0.29
46 0.27
47 0.23
48 0.21
49 0.23
50 0.26
51 0.23
52 0.23
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.26
57 0.27
58 0.27
59 0.27
60 0.25
61 0.31
62 0.33
63 0.32
64 0.31
65 0.32
66 0.33
67 0.34
68 0.33
69 0.26
70 0.25
71 0.25
72 0.26
73 0.27
74 0.24
75 0.3
76 0.31
77 0.33
78 0.39
79 0.45
80 0.41
81 0.43
82 0.44
83 0.41
84 0.41
85 0.39
86 0.33
87 0.31
88 0.3
89 0.28
90 0.26
91 0.23
92 0.23
93 0.22
94 0.23
95 0.2
96 0.19
97 0.2
98 0.21
99 0.24
100 0.28
101 0.31
102 0.3
103 0.28
104 0.28
105 0.31
106 0.32
107 0.32
108 0.3
109 0.29
110 0.29
111 0.3
112 0.29
113 0.21
114 0.18
115 0.13
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.09
143 0.09
144 0.11
145 0.13
146 0.15
147 0.22
148 0.24
149 0.24
150 0.22
151 0.23
152 0.22
153 0.22
154 0.22
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.11
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.19
177 0.25
178 0.33
179 0.38
180 0.44
181 0.53
182 0.62
183 0.69
184 0.73
185 0.78
186 0.8
187 0.85
188 0.84
189 0.83
190 0.83
191 0.81
192 0.78
193 0.69
194 0.64
195 0.58
196 0.59
197 0.55
198 0.54
199 0.46
200 0.42
201 0.4
202 0.38
203 0.36
204 0.26
205 0.21
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.08
221 0.09
222 0.14
223 0.17
224 0.17
225 0.22
226 0.29
227 0.32
228 0.35
229 0.43
230 0.46
231 0.53
232 0.59
233 0.61
234 0.64
235 0.64
236 0.62
237 0.58
238 0.53
239 0.48
240 0.52
241 0.53
242 0.52
243 0.56
244 0.56
245 0.57
246 0.62
247 0.64
248 0.57
249 0.59
250 0.53
251 0.51
252 0.49
253 0.43
254 0.37
255 0.38
256 0.37
257 0.31
258 0.31
259 0.28
260 0.32
261 0.41
262 0.48
263 0.46
264 0.53
265 0.59
266 0.6
267 0.61
268 0.55
269 0.53
270 0.48
271 0.47
272 0.4
273 0.35
274 0.32
275 0.33
276 0.35
277 0.3
278 0.32
279 0.35
280 0.41
281 0.43
282 0.48
283 0.44
284 0.43
285 0.47
286 0.44
287 0.43
288 0.38
289 0.32