Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4U2V6

Protein Details
Accession N4U2V6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-29LDPPSFSQQIRSNKRKRPETTDDDFHydrophilic
96-117DEAARPKSKKSTSRKRGGHFDVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-111RPKSKKSTSRKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MDSLLDPPSFSQQIRSNKRKRPETTDDDFPSSLPQSSINPLSHSPGVVAQFAIAGLSETEENPSRRIRDFPHRGISSNEAFSIEAESDEDPETEGDEAARPKSKKSTSRKRGGHFDVLLQSIHYFLDRGEIAKASRAYGLILQLRPSGLPIDIRHHDLWAIGAEILMREGEETLQQDESSHENQPKSTKRWGRAANMNKVKAYFDTLIQQHPYDYKTPKVVSALDFWIALFSCEIYNTHTEHILALDRLESEIDEDPRRESFGNDESIASDETDSVETGKLHKKYELRVQALSIMKDITKRMDVLMQDMPYSRNQHYLRLRAMASFYIADLILPISPVSQFQAEEGQKARLMEQESARNHLERIITYGGELDKAAWNALNPSGDVEEDTSIPLYSSLPIRGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.62
3 0.66
4 0.72
5 0.82
6 0.85
7 0.85
8 0.84
9 0.83
10 0.81
11 0.78
12 0.79
13 0.74
14 0.69
15 0.61
16 0.52
17 0.46
18 0.39
19 0.33
20 0.24
21 0.2
22 0.18
23 0.23
24 0.29
25 0.26
26 0.27
27 0.27
28 0.32
29 0.31
30 0.28
31 0.24
32 0.22
33 0.23
34 0.2
35 0.18
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.06
41 0.05
42 0.04
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.1
47 0.15
48 0.17
49 0.19
50 0.24
51 0.26
52 0.28
53 0.32
54 0.36
55 0.42
56 0.5
57 0.54
58 0.6
59 0.59
60 0.58
61 0.57
62 0.56
63 0.49
64 0.41
65 0.34
66 0.25
67 0.23
68 0.22
69 0.2
70 0.14
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.09
84 0.11
85 0.13
86 0.2
87 0.2
88 0.23
89 0.31
90 0.39
91 0.45
92 0.55
93 0.64
94 0.67
95 0.77
96 0.83
97 0.8
98 0.82
99 0.79
100 0.76
101 0.66
102 0.59
103 0.52
104 0.45
105 0.39
106 0.29
107 0.23
108 0.15
109 0.14
110 0.1
111 0.06
112 0.05
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.16
120 0.17
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.17
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.12
135 0.08
136 0.11
137 0.11
138 0.17
139 0.18
140 0.23
141 0.22
142 0.21
143 0.21
144 0.18
145 0.17
146 0.12
147 0.11
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.12
166 0.13
167 0.16
168 0.18
169 0.18
170 0.2
171 0.27
172 0.31
173 0.32
174 0.39
175 0.42
176 0.42
177 0.5
178 0.54
179 0.53
180 0.57
181 0.61
182 0.62
183 0.62
184 0.59
185 0.51
186 0.46
187 0.41
188 0.32
189 0.28
190 0.19
191 0.13
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.19
196 0.18
197 0.15
198 0.15
199 0.17
200 0.17
201 0.17
202 0.18
203 0.21
204 0.21
205 0.22
206 0.22
207 0.22
208 0.19
209 0.2
210 0.19
211 0.15
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.09
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.07
239 0.09
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.17
246 0.15
247 0.13
248 0.15
249 0.17
250 0.19
251 0.19
252 0.18
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.14
257 0.11
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.12
266 0.19
267 0.21
268 0.22
269 0.27
270 0.3
271 0.34
272 0.44
273 0.48
274 0.45
275 0.43
276 0.43
277 0.45
278 0.44
279 0.39
280 0.3
281 0.22
282 0.19
283 0.2
284 0.21
285 0.17
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.19
290 0.18
291 0.2
292 0.23
293 0.21
294 0.2
295 0.21
296 0.21
297 0.22
298 0.26
299 0.23
300 0.28
301 0.28
302 0.36
303 0.42
304 0.47
305 0.46
306 0.46
307 0.46
308 0.38
309 0.39
310 0.31
311 0.25
312 0.19
313 0.16
314 0.12
315 0.12
316 0.1
317 0.08
318 0.08
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.07
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.2
330 0.2
331 0.23
332 0.25
333 0.25
334 0.25
335 0.26
336 0.26
337 0.22
338 0.24
339 0.26
340 0.29
341 0.35
342 0.35
343 0.4
344 0.41
345 0.38
346 0.35
347 0.33
348 0.31
349 0.23
350 0.26
351 0.23
352 0.21
353 0.2
354 0.23
355 0.19
356 0.17
357 0.17
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.14
363 0.14
364 0.16
365 0.19
366 0.18
367 0.14
368 0.16
369 0.16
370 0.16
371 0.16
372 0.16
373 0.14
374 0.13
375 0.14
376 0.13
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.11
382 0.14