Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0MM66

Protein Details
Accession R0MM66    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-52SMLFQRLKFYQRRRSRSYMRKKTNTRRKDRHVLRTHTWYSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-42RRRSRSYMRKKTNTRRKDR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences LIEAAINNTRKKSMLFQRLKFYQRRRSRSYMRKKTNTRRKDRHVLRTHTWYSKRFKMIKIFNCHLPFTRNMKSSKYIYKSLKRGFVFDQTYKQTKLFKKNDTHFLTRYAKECSLIKKQINNEEIEVGVIGEYLIISYIKEVIDENIFDGLEFVSNIECSFLLINVPDNFNLKPEGLDLFYLKNEQKGGVIFVSKQKAMDTWKWLIKQSIMPVSITELERITLEEGTMNYPFDCVQSEYFKEYEKTVNKDIIEKYERTPKGKRVEIDIKDFFLFSDDKNLKYFYFEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.54
3 0.57
4 0.65
5 0.72
6 0.77
7 0.77
8 0.76
9 0.76
10 0.76
11 0.8
12 0.78
13 0.8
14 0.83
15 0.85
16 0.87
17 0.87
18 0.88
19 0.9
20 0.92
21 0.94
22 0.94
23 0.94
24 0.93
25 0.93
26 0.91
27 0.92
28 0.91
29 0.9
30 0.9
31 0.87
32 0.82
33 0.81
34 0.78
35 0.76
36 0.72
37 0.69
38 0.66
39 0.66
40 0.68
41 0.64
42 0.63
43 0.64
44 0.68
45 0.7
46 0.71
47 0.67
48 0.66
49 0.64
50 0.6
51 0.52
52 0.46
53 0.43
54 0.41
55 0.44
56 0.41
57 0.41
58 0.43
59 0.46
60 0.48
61 0.5
62 0.48
63 0.49
64 0.53
65 0.59
66 0.64
67 0.64
68 0.67
69 0.59
70 0.57
71 0.52
72 0.51
73 0.48
74 0.42
75 0.42
76 0.39
77 0.42
78 0.4
79 0.4
80 0.4
81 0.41
82 0.49
83 0.5
84 0.53
85 0.59
86 0.63
87 0.71
88 0.69
89 0.67
90 0.57
91 0.57
92 0.55
93 0.48
94 0.45
95 0.39
96 0.33
97 0.3
98 0.32
99 0.3
100 0.33
101 0.37
102 0.38
103 0.39
104 0.42
105 0.48
106 0.48
107 0.44
108 0.36
109 0.3
110 0.27
111 0.21
112 0.17
113 0.09
114 0.06
115 0.04
116 0.03
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.02
122 0.02
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.16
179 0.19
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.18
184 0.23
185 0.26
186 0.26
187 0.29
188 0.34
189 0.35
190 0.37
191 0.36
192 0.33
193 0.32
194 0.31
195 0.31
196 0.27
197 0.26
198 0.24
199 0.25
200 0.26
201 0.23
202 0.19
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.12
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.14
222 0.18
223 0.2
224 0.23
225 0.23
226 0.25
227 0.24
228 0.25
229 0.3
230 0.32
231 0.36
232 0.37
233 0.41
234 0.39
235 0.44
236 0.44
237 0.44
238 0.43
239 0.39
240 0.39
241 0.45
242 0.48
243 0.48
244 0.53
245 0.53
246 0.57
247 0.62
248 0.6
249 0.59
250 0.65
251 0.65
252 0.66
253 0.61
254 0.54
255 0.48
256 0.45
257 0.36
258 0.28
259 0.24
260 0.16
261 0.24
262 0.23
263 0.24
264 0.27
265 0.29
266 0.26