FuNGI

R0MMY4

Protein Details

Accession

R0MMY4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
99-118	VERLKRKQANNYIQKVKKRY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013194 HDAC_interact_dom IPR003822 PAH IPR036600 PAH_sf IPR039774 Sin3-like IPR031693 Sin3_C
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003714 F:transcription corepressor activity
Pfam	View protein in Pfam PF08295 Sin3_corepress PF16879 Sin3a_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51477 PAH

Amino Acid Sequences

MHHQQPPQFRRNVYNSNQKMMHGGHIPHPMMHKIGPPPPHIHQPHLPGSIPPGMVPNFPPQQNLKPQHMQSPIRHPPQGPQKPQFNYQAHPPNPQHDEVERLKRKQANNYIQKVKKRYANHPSVYKTFVELLQNYQTTADFEKIHASIKGLLWENPDLIIEFEKDFASPSAVKSDVDMSFYKKISEVLVDKDTLNDFFRCLNYYNQHLISQKDFLLMVEPLLKSTELINQFKKYIKYNESPDELESKNQEKCKKIGSYKILNQEIVNEYQDPIAREVINTSCVNCPTFESEDANFVFIKRNHYEDSLFKVEEERYDASLIIERIDFLIMSLEIVYSSLTESELNIRDLGMSPGIIKEVFRSIYDESASEVLEGILTNAKTAIPIVIKRLYSVNRQFREKLRIKNKIWNDSVERVYFKALDTFGGTFRSNDKMIVSPKNLGMEFETGIQVDISDVECMKDLVILFNAYIKTNQNDNKKANIPGLFEAVDLIFEIITKQDSEFTTNFDVFCVFRLLTHMYERLKEMKDLKLPPLESSKLAVELNLTEEFKYENRYEELKNFIRDFLEKNIDSPTFEEKIRIMSNCKGYKLFGIRKIFSKIEKMIIGVVEDRDALKSLEKQTVDFEISEGCILKFKEGIFEVSNSEPVPSDIDTSKVFLSKNIKQESFCGAMINDLKFGTKEGSEEIKPLENSELFYLSVDSTILKKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.67
3	0.68
4	0.66
5	0.58
6	0.54
7	0.46
8	0.43
9	0.38
10	0.37
11	0.35
12	0.42
13	0.42
14	0.39
15	0.41
16	0.38
17	0.34
18	0.34
19	0.33
20	0.31
21	0.36
22	0.4
23	0.41
24	0.45
25	0.47
26	0.55
27	0.53
28	0.53
29	0.54
30	0.55
31	0.58
32	0.56
33	0.52
34	0.43
35	0.44
36	0.42
37	0.36
38	0.28
39	0.26
40	0.23
41	0.24
42	0.26
43	0.29
44	0.3
45	0.31
46	0.35
47	0.35
48	0.42
49	0.51
50	0.54
51	0.54
52	0.57
53	0.59
54	0.63
55	0.66
56	0.65
57	0.61
58	0.66
59	0.67
60	0.65
61	0.67
62	0.6
63	0.6
64	0.64
65	0.68
66	0.66
67	0.65
68	0.67
69	0.68
70	0.74
71	0.75
72	0.67
73	0.6
74	0.6
75	0.63
76	0.56
77	0.61
78	0.57
79	0.55
80	0.55
81	0.55
82	0.49
83	0.4
84	0.45
85	0.43
86	0.51
87	0.52
88	0.5
89	0.56
90	0.58
91	0.62
92	0.65
93	0.68
94	0.68
95	0.7
96	0.77
97	0.79
98	0.8
99	0.82
100	0.79
101	0.75
102	0.71
103	0.68
104	0.69
105	0.7
106	0.73
107	0.72
108	0.73
109	0.72
110	0.68
111	0.64
112	0.55
113	0.46
114	0.38
115	0.34
116	0.31
117	0.26
118	0.26
119	0.29
120	0.28
121	0.26
122	0.25
123	0.22
124	0.19
125	0.2
126	0.19
127	0.14
128	0.14
129	0.18
130	0.18
131	0.19
132	0.18
133	0.18
134	0.18
135	0.18
136	0.23
137	0.21
138	0.22
139	0.23
140	0.24
141	0.22
142	0.19
143	0.18
144	0.13
145	0.13
146	0.12
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.11
153	0.1
154	0.12
155	0.12
156	0.12
157	0.15
158	0.16
159	0.16
160	0.16
161	0.2
162	0.17
163	0.19
164	0.19
165	0.2
166	0.23
167	0.24
168	0.23
169	0.19
170	0.2
171	0.17
172	0.21
173	0.19
174	0.19
175	0.21
176	0.22
177	0.21
178	0.22
179	0.22
180	0.19
181	0.19
182	0.15
183	0.13
184	0.14
185	0.15
186	0.16
187	0.17
188	0.21
189	0.22
190	0.27
191	0.3
192	0.3
193	0.32
194	0.32
195	0.32
196	0.29
197	0.28
198	0.23
199	0.19
200	0.18
201	0.14
202	0.15
203	0.12
204	0.11
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.12
209	0.12
210	0.1
211	0.11
212	0.16
213	0.19
214	0.23
215	0.26
216	0.28
217	0.3
218	0.34
219	0.36
220	0.35
221	0.36
222	0.38
223	0.4
224	0.45
225	0.48
226	0.48
227	0.46
228	0.42
229	0.4
230	0.34
231	0.3
232	0.27
233	0.26
234	0.27
235	0.32
236	0.36
237	0.34
238	0.36
239	0.41
240	0.44
241	0.45
242	0.49
243	0.51
244	0.54
245	0.57
246	0.64
247	0.59
248	0.52
249	0.47
250	0.42
251	0.36
252	0.29
253	0.24
254	0.16
255	0.14
256	0.14
257	0.16
258	0.14
259	0.13
260	0.14
261	0.12
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.15
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.15
270	0.16
271	0.14
272	0.15
273	0.15
274	0.17
275	0.17
276	0.18
277	0.17
278	0.2
279	0.2
280	0.19
281	0.15
282	0.13
283	0.18
284	0.16
285	0.22
286	0.2
287	0.23
288	0.24
289	0.25
290	0.27
291	0.24
292	0.28
293	0.26
294	0.24
295	0.21
296	0.22
297	0.2
298	0.19
299	0.2
300	0.15
301	0.13
302	0.13
303	0.13
304	0.12
305	0.14
306	0.13
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.04
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.03
319	0.03
320	0.04
321	0.04
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.08
329	0.09
330	0.1
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.1
335	0.1
336	0.07
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.1
348	0.1
349	0.12
350	0.12
351	0.11
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.07
356	0.07
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.11
372	0.14
373	0.14
374	0.15
375	0.19
376	0.2
377	0.26
378	0.34
379	0.4
380	0.4
381	0.44
382	0.47
383	0.48
384	0.55
385	0.54
386	0.55
387	0.56
388	0.62
389	0.62
390	0.67
391	0.69
392	0.67
393	0.62
394	0.57
395	0.52
396	0.47
397	0.46
398	0.39
399	0.34
400	0.26
401	0.25
402	0.21
403	0.16
404	0.14
405	0.12
406	0.1
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.13
411	0.13
412	0.11
413	0.13
414	0.16
415	0.15
416	0.14
417	0.15
418	0.16
419	0.2
420	0.25
421	0.25
422	0.24
423	0.24
424	0.27
425	0.26
426	0.22
427	0.19
428	0.16
429	0.14
430	0.13
431	0.12
432	0.09
433	0.1
434	0.09
435	0.07
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.1
452	0.11
453	0.1
454	0.11
455	0.12
456	0.14
457	0.2
458	0.26
459	0.32
460	0.39
461	0.41
462	0.45
463	0.47
464	0.47
465	0.46
466	0.42
467	0.37
468	0.31
469	0.3
470	0.24
471	0.2
472	0.19
473	0.14
474	0.11
475	0.08
476	0.07
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.09
485	0.1
486	0.14
487	0.15
488	0.18
489	0.21
490	0.21
491	0.21
492	0.18
493	0.18
494	0.14
495	0.15
496	0.13
497	0.1
498	0.09
499	0.12
500	0.15
501	0.16
502	0.18
503	0.22
504	0.21
505	0.22
506	0.25
507	0.28
508	0.27
509	0.29
510	0.3
511	0.32
512	0.38
513	0.39
514	0.41
515	0.41
516	0.41
517	0.39
518	0.41
519	0.37
520	0.31
521	0.3
522	0.26
523	0.22
524	0.22
525	0.19
526	0.14
527	0.13
528	0.15
529	0.15
530	0.14
531	0.12
532	0.12
533	0.14
534	0.14
535	0.18
536	0.16
537	0.17
538	0.2
539	0.23
540	0.26
541	0.28
542	0.35
543	0.35
544	0.39
545	0.37
546	0.35
547	0.34
548	0.33
549	0.33
550	0.31
551	0.34
552	0.29
553	0.29
554	0.32
555	0.31
556	0.3
557	0.29
558	0.28
559	0.23
560	0.23
561	0.23
562	0.19
563	0.24
564	0.27
565	0.27
566	0.26
567	0.29
568	0.39
569	0.41
570	0.43
571	0.39
572	0.36
573	0.41
574	0.46
575	0.47
576	0.46
577	0.5
578	0.5
579	0.53
580	0.58
581	0.55
582	0.48
583	0.48
584	0.42
585	0.4
586	0.38
587	0.34
588	0.3
589	0.27
590	0.25
591	0.2
592	0.18
593	0.13
594	0.13
595	0.13
596	0.11
597	0.12
598	0.11
599	0.13
600	0.18
601	0.21
602	0.27
603	0.27
604	0.27
605	0.29
606	0.32
607	0.31
608	0.25
609	0.22
610	0.17
611	0.17
612	0.17
613	0.15
614	0.11
615	0.14
616	0.14
617	0.15
618	0.16
619	0.16
620	0.2
621	0.2
622	0.25
623	0.22
624	0.23
625	0.26
626	0.25
627	0.27
628	0.21
629	0.2
630	0.16
631	0.15
632	0.17
633	0.14
634	0.16
635	0.15
636	0.17
637	0.18
638	0.19
639	0.2
640	0.2
641	0.2
642	0.22
643	0.3
644	0.33
645	0.42
646	0.48
647	0.49
648	0.47
649	0.5
650	0.51
651	0.47
652	0.4
653	0.33
654	0.25
655	0.28
656	0.31
657	0.29
658	0.24
659	0.2
660	0.21
661	0.19
662	0.21
663	0.18
664	0.14
665	0.15
666	0.18
667	0.24
668	0.23
669	0.26
670	0.27
671	0.31
672	0.3
673	0.31
674	0.32
675	0.27
676	0.28
677	0.28
678	0.27
679	0.2
680	0.21
681	0.2
682	0.15
683	0.14
684	0.12
685	0.11

R0MMY4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer