Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0KU54

Protein Details
Accession R0KU54    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-118SPPLKFVKGRRFKKKSVKYQDLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-110VKGRRFKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
Amino Acid Sequences MEHHFILRFSKDFLDPINLHESKIERIDNDKLKLIYKDKIYPGISIQLPCVVESQKTLDSKQFYKICDVSTLIVIYPNENYDFEDEKRKLSISGLSPPLKFVKGRRFKKKSVKYQDLEEIESKVQEILERDKKANKIEIIKEENSDEISNLIVEIEEGVSKGDAKGEDKDRGDAKDKDNEDIKENETILNIKNQIKEQEKRVEDALNPILKQRFQNVLNDLKKKLEEYQEKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.28
4 0.36
5 0.32
6 0.31
7 0.33
8 0.32
9 0.28
10 0.32
11 0.31
12 0.23
13 0.27
14 0.36
15 0.4
16 0.41
17 0.42
18 0.38
19 0.4
20 0.44
21 0.43
22 0.4
23 0.39
24 0.42
25 0.41
26 0.47
27 0.44
28 0.4
29 0.38
30 0.38
31 0.35
32 0.29
33 0.27
34 0.23
35 0.22
36 0.21
37 0.21
38 0.16
39 0.14
40 0.15
41 0.18
42 0.19
43 0.2
44 0.21
45 0.24
46 0.28
47 0.29
48 0.36
49 0.36
50 0.32
51 0.36
52 0.37
53 0.33
54 0.3
55 0.3
56 0.22
57 0.2
58 0.19
59 0.13
60 0.14
61 0.13
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.15
70 0.16
71 0.24
72 0.23
73 0.23
74 0.24
75 0.24
76 0.2
77 0.19
78 0.22
79 0.16
80 0.22
81 0.27
82 0.28
83 0.28
84 0.29
85 0.29
86 0.26
87 0.25
88 0.24
89 0.29
90 0.36
91 0.46
92 0.55
93 0.6
94 0.67
95 0.77
96 0.81
97 0.82
98 0.82
99 0.82
100 0.73
101 0.7
102 0.68
103 0.59
104 0.51
105 0.41
106 0.32
107 0.23
108 0.21
109 0.17
110 0.1
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.14
115 0.21
116 0.23
117 0.24
118 0.28
119 0.31
120 0.33
121 0.36
122 0.32
123 0.32
124 0.34
125 0.39
126 0.4
127 0.38
128 0.36
129 0.32
130 0.29
131 0.25
132 0.21
133 0.14
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.15
153 0.19
154 0.25
155 0.26
156 0.3
157 0.31
158 0.33
159 0.38
160 0.37
161 0.36
162 0.39
163 0.39
164 0.4
165 0.43
166 0.41
167 0.38
168 0.36
169 0.34
170 0.29
171 0.28
172 0.24
173 0.2
174 0.2
175 0.18
176 0.2
177 0.23
178 0.24
179 0.26
180 0.29
181 0.35
182 0.41
183 0.45
184 0.47
185 0.52
186 0.5
187 0.5
188 0.49
189 0.45
190 0.38
191 0.4
192 0.4
193 0.34
194 0.33
195 0.35
196 0.36
197 0.36
198 0.37
199 0.35
200 0.36
201 0.34
202 0.41
203 0.41
204 0.48
205 0.54
206 0.56
207 0.53
208 0.49
209 0.49
210 0.45
211 0.47
212 0.47