Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0MIV1

Protein Details
Accession R0MIV1    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-58LFTEKPYEYKFKKYKVRKVPHETMNYEHydrophilic
90-110GLKNYLKKKQAEKEIKSNFSKHydrophilic
195-220FEKVEEKKQSRLKKRQKEQFSGDKPLHydrophilic
694-718SNVIKQYLKARKKTKVDEKKTVLKCHydrophilic
728-762KTNKLCPNFNTTKKPTKKKIESERKKAKNTFHNILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-209RLKKR
740-755KKPTKKKIESERKKAK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001487  Bromodomain  
IPR036427  Bromodomain-like_sf  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00439  Bromodomain  
PF12157  DUF3591  
PF15288  zf-CCHC_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50014  BROMODOMAIN_2  
Amino Acid Sequences MEDNTGNKHQEHSSRGAGGNLNRQDLNFLKFLFTEKPYEYKFKKYKVRKVPHETMNYEIDDQTRFRNTTMFARNDNAVLQSLYGSSKNAGLKNYLKKKQAEKEIKSNFSKVLDKKEVNKVLAEVKYPFDVVDWENNIVYDLDKVQTSNDNETITEEFVNTILEQDWEKYIVYDPEIQKANKNYMTIYLEDPNLIFEKVEEKKQSRLKKRQKEQFSGDKPLKNKYNISNDKYYNQEQKTKSSLGTFGVQHSLPALKLDPRFYKTNHTREELRNFHRPSFKLPHRIQIEFKKPLLAESNSSNIIKKTSELTLKDTSEFAIFEYSEEYPLFIVNTGMVSLLNTYYRKSNQRDDYASDQNNLTVLDLDDPSPFYGFGDVKPGFTLKAITNNLFCAPIFKHATNDWLCVMSTDSNGNYIILPRKIDNLYCVGQEYPAEEVYAPHSRKLNIFCKNRLKVAAYRLFSLKDRGFKEFRMSQLDEMFPYFSEGSKRKWLKEYADCVKRGKENVWVLKQTSSLLLEEDLRKLVTPENICQYESMLAGERRLEDYGYKCLDDSEEEGEDEKVYSVPWQLSRNFINAANGKGLLELNGPADPTGIGEGFSFRKIKLTKGNEAENRKIISEHQANYKEEIEKIWTKQLNSLSSTSEIPFDDSYFENTKEEKPFDNIITPDESNILIIKRTYGFGDDQRVEIEKITDSNVIKQYLKARKKTKVDEKKTVLKCGSCGEIGHTKTNKLCPNFNTTKKPTKKKIESERKKAKNTFHNILMPLMNEFFVMPYSVAFHRPVSVKKFPDYPTIVSTPMDLSTIKTKIRHNKYTTFSEFFKDVKQIHENCVKYNGPEHSLSKVAENFIKLAQETERVNKSKIEEAENIFCEYLLDESNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.44
3 0.44
4 0.44
5 0.42
6 0.46
7 0.43
8 0.42
9 0.38
10 0.37
11 0.38
12 0.36
13 0.35
14 0.29
15 0.26
16 0.24
17 0.24
18 0.27
19 0.27
20 0.27
21 0.28
22 0.28
23 0.34
24 0.37
25 0.47
26 0.47
27 0.52
28 0.58
29 0.62
30 0.7
31 0.74
32 0.8
33 0.81
34 0.89
35 0.89
36 0.9
37 0.9
38 0.89
39 0.88
40 0.8
41 0.73
42 0.67
43 0.58
44 0.5
45 0.41
46 0.34
47 0.27
48 0.25
49 0.26
50 0.27
51 0.26
52 0.25
53 0.27
54 0.28
55 0.35
56 0.43
57 0.43
58 0.4
59 0.42
60 0.43
61 0.4
62 0.38
63 0.3
64 0.23
65 0.19
66 0.16
67 0.13
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.12
73 0.17
74 0.21
75 0.24
76 0.24
77 0.28
78 0.36
79 0.45
80 0.55
81 0.57
82 0.59
83 0.64
84 0.71
85 0.74
86 0.77
87 0.78
88 0.75
89 0.78
90 0.8
91 0.81
92 0.76
93 0.69
94 0.61
95 0.55
96 0.56
97 0.5
98 0.51
99 0.52
100 0.52
101 0.56
102 0.63
103 0.65
104 0.58
105 0.55
106 0.48
107 0.46
108 0.43
109 0.39
110 0.31
111 0.26
112 0.26
113 0.25
114 0.22
115 0.15
116 0.16
117 0.15
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.21
122 0.21
123 0.21
124 0.19
125 0.17
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.18
133 0.21
134 0.24
135 0.25
136 0.25
137 0.25
138 0.27
139 0.27
140 0.21
141 0.19
142 0.14
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.13
157 0.13
158 0.15
159 0.22
160 0.22
161 0.27
162 0.32
163 0.31
164 0.34
165 0.37
166 0.42
167 0.37
168 0.37
169 0.31
170 0.32
171 0.34
172 0.3
173 0.29
174 0.25
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.18
179 0.16
180 0.15
181 0.11
182 0.08
183 0.16
184 0.18
185 0.24
186 0.29
187 0.3
188 0.39
189 0.47
190 0.57
191 0.61
192 0.69
193 0.74
194 0.78
195 0.86
196 0.88
197 0.9
198 0.88
199 0.86
200 0.85
201 0.81
202 0.79
203 0.75
204 0.7
205 0.62
206 0.62
207 0.6
208 0.54
209 0.53
210 0.51
211 0.56
212 0.6
213 0.64
214 0.64
215 0.6
216 0.59
217 0.58
218 0.56
219 0.54
220 0.5
221 0.52
222 0.46
223 0.49
224 0.51
225 0.47
226 0.42
227 0.35
228 0.33
229 0.27
230 0.29
231 0.25
232 0.21
233 0.22
234 0.2
235 0.18
236 0.17
237 0.16
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.22
244 0.25
245 0.28
246 0.32
247 0.32
248 0.42
249 0.46
250 0.53
251 0.52
252 0.52
253 0.54
254 0.58
255 0.66
256 0.63
257 0.59
258 0.6
259 0.58
260 0.59
261 0.6
262 0.54
263 0.52
264 0.54
265 0.55
266 0.56
267 0.55
268 0.59
269 0.56
270 0.58
271 0.57
272 0.56
273 0.58
274 0.52
275 0.51
276 0.46
277 0.41
278 0.4
279 0.4
280 0.32
281 0.25
282 0.23
283 0.26
284 0.24
285 0.24
286 0.23
287 0.18
288 0.18
289 0.16
290 0.14
291 0.14
292 0.16
293 0.21
294 0.22
295 0.27
296 0.3
297 0.31
298 0.31
299 0.28
300 0.25
301 0.2
302 0.18
303 0.13
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.1
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.06
316 0.06
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.12
329 0.16
330 0.24
331 0.28
332 0.36
333 0.4
334 0.46
335 0.48
336 0.49
337 0.51
338 0.51
339 0.48
340 0.41
341 0.34
342 0.28
343 0.26
344 0.21
345 0.15
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.13
366 0.13
367 0.15
368 0.08
369 0.16
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.19
374 0.2
375 0.18
376 0.17
377 0.12
378 0.11
379 0.15
380 0.18
381 0.17
382 0.19
383 0.19
384 0.25
385 0.24
386 0.24
387 0.19
388 0.16
389 0.16
390 0.14
391 0.15
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.07
400 0.09
401 0.12
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.15
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.16
410 0.16
411 0.15
412 0.15
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.1
423 0.17
424 0.16
425 0.17
426 0.18
427 0.19
428 0.22
429 0.29
430 0.33
431 0.35
432 0.4
433 0.46
434 0.53
435 0.54
436 0.53
437 0.49
438 0.44
439 0.39
440 0.43
441 0.42
442 0.34
443 0.33
444 0.32
445 0.31
446 0.29
447 0.3
448 0.24
449 0.24
450 0.25
451 0.28
452 0.29
453 0.28
454 0.33
455 0.31
456 0.31
457 0.32
458 0.31
459 0.27
460 0.28
461 0.28
462 0.22
463 0.2
464 0.17
465 0.1
466 0.11
467 0.1
468 0.08
469 0.13
470 0.14
471 0.17
472 0.27
473 0.29
474 0.3
475 0.35
476 0.38
477 0.4
478 0.46
479 0.51
480 0.5
481 0.54
482 0.53
483 0.5
484 0.49
485 0.45
486 0.39
487 0.32
488 0.31
489 0.32
490 0.37
491 0.4
492 0.39
493 0.37
494 0.36
495 0.35
496 0.28
497 0.22
498 0.16
499 0.12
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.11
504 0.12
505 0.11
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.12
510 0.14
511 0.15
512 0.17
513 0.23
514 0.24
515 0.24
516 0.23
517 0.22
518 0.18
519 0.16
520 0.14
521 0.12
522 0.11
523 0.11
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.11
530 0.13
531 0.18
532 0.18
533 0.17
534 0.16
535 0.16
536 0.16
537 0.15
538 0.15
539 0.12
540 0.11
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.12
545 0.11
546 0.09
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.08
551 0.09
552 0.13
553 0.16
554 0.17
555 0.21
556 0.22
557 0.23
558 0.24
559 0.22
560 0.25
561 0.23
562 0.24
563 0.2
564 0.19
565 0.17
566 0.16
567 0.15
568 0.1
569 0.09
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.07
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.07
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.08
583 0.09
584 0.11
585 0.12
586 0.11
587 0.18
588 0.18
589 0.23
590 0.31
591 0.36
592 0.42
593 0.46
594 0.54
595 0.55
596 0.6
597 0.59
598 0.54
599 0.49
600 0.41
601 0.37
602 0.3
603 0.32
604 0.31
605 0.3
606 0.34
607 0.38
608 0.39
609 0.41
610 0.43
611 0.35
612 0.3
613 0.28
614 0.25
615 0.24
616 0.25
617 0.3
618 0.3
619 0.29
620 0.34
621 0.38
622 0.36
623 0.34
624 0.34
625 0.28
626 0.27
627 0.28
628 0.23
629 0.2
630 0.17
631 0.16
632 0.15
633 0.14
634 0.14
635 0.13
636 0.17
637 0.18
638 0.19
639 0.19
640 0.2
641 0.24
642 0.27
643 0.29
644 0.26
645 0.27
646 0.3
647 0.3
648 0.32
649 0.28
650 0.26
651 0.28
652 0.26
653 0.22
654 0.19
655 0.18
656 0.13
657 0.14
658 0.13
659 0.09
660 0.09
661 0.11
662 0.11
663 0.12
664 0.12
665 0.13
666 0.16
667 0.19
668 0.26
669 0.25
670 0.25
671 0.25
672 0.27
673 0.25
674 0.22
675 0.2
676 0.13
677 0.13
678 0.15
679 0.18
680 0.17
681 0.22
682 0.26
683 0.28
684 0.27
685 0.3
686 0.37
687 0.43
688 0.5
689 0.53
690 0.57
691 0.63
692 0.72
693 0.79
694 0.81
695 0.82
696 0.83
697 0.84
698 0.84
699 0.84
700 0.8
701 0.77
702 0.7
703 0.6
704 0.53
705 0.46
706 0.41
707 0.32
708 0.28
709 0.25
710 0.28
711 0.3
712 0.36
713 0.35
714 0.35
715 0.38
716 0.45
717 0.48
718 0.44
719 0.48
720 0.43
721 0.51
722 0.57
723 0.6
724 0.63
725 0.63
726 0.7
727 0.73
728 0.8
729 0.81
730 0.83
731 0.85
732 0.86
733 0.9
734 0.9
735 0.91
736 0.92
737 0.93
738 0.91
739 0.91
740 0.87
741 0.85
742 0.84
743 0.82
744 0.77
745 0.73
746 0.69
747 0.61
748 0.57
749 0.49
750 0.39
751 0.32
752 0.26
753 0.19
754 0.13
755 0.12
756 0.1
757 0.09
758 0.09
759 0.07
760 0.07
761 0.1
762 0.11
763 0.14
764 0.15
765 0.16
766 0.19
767 0.24
768 0.3
769 0.35
770 0.42
771 0.43
772 0.45
773 0.52
774 0.5
775 0.55
776 0.53
777 0.49
778 0.46
779 0.45
780 0.42
781 0.35
782 0.34
783 0.26
784 0.22
785 0.19
786 0.14
787 0.14
788 0.19
789 0.23
790 0.26
791 0.29
792 0.37
793 0.47
794 0.56
795 0.64
796 0.64
797 0.69
798 0.71
799 0.76
800 0.74
801 0.68
802 0.6
803 0.55
804 0.51
805 0.43
806 0.41
807 0.38
808 0.32
809 0.34
810 0.41
811 0.4
812 0.45
813 0.52
814 0.5
815 0.46
816 0.51
817 0.46
818 0.39
819 0.43
820 0.4
821 0.36
822 0.39
823 0.39
824 0.36
825 0.39
826 0.37
827 0.36
828 0.34
829 0.33
830 0.32
831 0.31
832 0.29
833 0.26
834 0.28
835 0.23
836 0.23
837 0.21
838 0.23
839 0.25
840 0.31
841 0.38
842 0.39
843 0.4
844 0.42
845 0.44
846 0.46
847 0.47
848 0.46
849 0.44
850 0.46
851 0.52
852 0.5
853 0.48
854 0.4
855 0.36
856 0.29
857 0.23
858 0.19