FuNGI

R0KT30

Protein Details

Accession

R0KT30

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-52	YSQVITELKKIQKKNKKYFTPIKSQFTKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto_nucl 9, nucl 8, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007231 Nucleoporin_int_Nup93/Nic96 IPR031468 SMP_LBD
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0005643 C:nuclear pore GO:0008289 F:lipid binding GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0006869 P:lipid transport GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04097 Nic96
PROSITE	View protein in PROSITE PS51847 SMP

Amino Acid Sequences

MRINISQNFIKIPFILRNTKINNYSQVITELKKIQKKNKKYFTPIKSQFTKVLKERISDFDIHQIVDGFVHQKLKEIQFSQEKQIEKSFFKDLRVCLENIKKENELLSLTTNKIIGNVKEFETWFKEGPNDLLFNNIMLFDLFTFLSNTKPTEDFDQEIAYLGIEYYKFIERYLKENHSKNNFNIHNLEDKISLFVRLKFNREELHLDVFEDQYIFAEIYVYLRCGFTAPVYKIFDKYRAFFQSVDLDFKNHFTSWLVSKTKPPVYSTSDNEDQFKKFLISLMQGNVPDNSSIISSVEDFLWTNLMCLEQSSINNLISKFEGYNSPKGLLLVYILTKQYYKAMVYLLKMDINVYPTYYLMRELAKKSGNNGNNGGCSGKVDAMNVSKLDNININALLSPKKPFVDFVFLIASKMSDTQNKSLLISSLADVVDDYHEIVPQMIVKTKQYDLLGEMYLDSRINSNVVNLLMKSNDRKQLLHVHHVIEDQNLLMGILVDVLVEGILTNTNVDEYLEISEKMKVKTKDNKLEVLKMFYLFTKTPDLVTLKRTSLFSLNFKLIEVKFVVEKILRMACEIIKKANDHEMAKKLFKIVGDLELSDGCIKQKEIGKPSLNLSLEQKNLISKSLLACTDLNWLNVLISRFWLELSESQAQAYRLKSYMSKWFEMANLNIIKNIEIVDVDIDREAPMVESIRVVTPEEVEEMGLKRDGNDTNGDEKIDCEKKDCDLKNDNMTLKNNINHNSSNYLNQTSSNDPTTLGPLI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.38
3	0.38
4	0.46
5	0.5
6	0.57
7	0.57
8	0.55
9	0.56
10	0.52
11	0.5
12	0.43
13	0.42
14	0.38
15	0.34
16	0.36
17	0.37
18	0.41
19	0.47
20	0.53
21	0.59
22	0.66
23	0.76
24	0.81
25	0.84
26	0.85
27	0.88
28	0.91
29	0.88
30	0.89
31	0.87
32	0.85
33	0.81
34	0.75
35	0.73
36	0.68
37	0.69
38	0.64
39	0.64
40	0.58
41	0.55
42	0.55
43	0.53
44	0.51
45	0.45
46	0.41
47	0.4
48	0.38
49	0.34
50	0.31
51	0.25
52	0.21
53	0.19
54	0.19
55	0.12
56	0.13
57	0.17
58	0.17
59	0.21
60	0.27
61	0.31
62	0.37
63	0.37
64	0.42
65	0.47
66	0.51
67	0.54
68	0.53
69	0.51
70	0.47
71	0.52
72	0.49
73	0.42
74	0.42
75	0.43
76	0.41
77	0.44
78	0.46
79	0.41
80	0.43
81	0.44
82	0.42
83	0.41
84	0.47
85	0.49
86	0.48
87	0.5
88	0.44
89	0.41
90	0.42
91	0.36
92	0.29
93	0.23
94	0.23
95	0.22
96	0.22
97	0.23
98	0.22
99	0.19
100	0.21
101	0.24
102	0.21
103	0.23
104	0.24
105	0.25
106	0.27
107	0.28
108	0.28
109	0.29
110	0.31
111	0.26
112	0.25
113	0.26
114	0.24
115	0.27
116	0.26
117	0.22
118	0.19
119	0.21
120	0.2
121	0.18
122	0.17
123	0.13
124	0.1
125	0.08
126	0.09
127	0.06
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.09
132	0.09
133	0.11
134	0.13
135	0.14
136	0.15
137	0.16
138	0.17
139	0.22
140	0.25
141	0.25
142	0.24
143	0.24
144	0.22
145	0.21
146	0.19
147	0.13
148	0.1
149	0.07
150	0.08
151	0.06
152	0.07
153	0.08
154	0.12
155	0.12
156	0.12
157	0.2
158	0.2
159	0.25
160	0.33
161	0.39
162	0.43
163	0.49
164	0.57
165	0.58
166	0.62
167	0.59
168	0.62
169	0.55
170	0.51
171	0.49
172	0.42
173	0.41
174	0.37
175	0.36
176	0.27
177	0.25
178	0.24
179	0.21
180	0.22
181	0.17
182	0.21
183	0.28
184	0.3
185	0.33
186	0.33
187	0.36
188	0.36
189	0.37
190	0.37
191	0.31
192	0.33
193	0.29
194	0.28
195	0.26
196	0.23
197	0.2
198	0.15
199	0.12
200	0.07
201	0.08
202	0.07
203	0.05
204	0.06
205	0.05
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.09
215	0.16
216	0.17
217	0.23
218	0.27
219	0.28
220	0.3
221	0.32
222	0.37
223	0.32
224	0.32
225	0.33
226	0.33
227	0.34
228	0.31
229	0.32
230	0.33
231	0.31
232	0.33
233	0.27
234	0.24
235	0.23
236	0.24
237	0.24
238	0.16
239	0.15
240	0.12
241	0.15
242	0.16
243	0.24
244	0.25
245	0.24
246	0.29
247	0.35
248	0.39
249	0.38
250	0.37
251	0.35
252	0.39
253	0.43
254	0.42
255	0.43
256	0.43
257	0.42
258	0.43
259	0.4
260	0.33
261	0.28
262	0.26
263	0.19
264	0.14
265	0.14
266	0.13
267	0.13
268	0.14
269	0.15
270	0.17
271	0.16
272	0.17
273	0.16
274	0.14
275	0.12
276	0.1
277	0.08
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.06
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.1
299	0.11
300	0.12
301	0.14
302	0.14
303	0.14
304	0.12
305	0.13
306	0.11
307	0.1
308	0.16
309	0.18
310	0.22
311	0.22
312	0.22
313	0.21
314	0.21
315	0.2
316	0.13
317	0.11
318	0.08
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.09
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.09
329	0.11
330	0.13
331	0.13
332	0.15
333	0.14
334	0.13
335	0.12
336	0.12
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.09
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.08
345	0.08
346	0.07
347	0.1
348	0.13
349	0.14
350	0.18
351	0.21
352	0.21
353	0.23
354	0.3
355	0.31
356	0.3
357	0.32
358	0.29
359	0.26
360	0.26
361	0.22
362	0.14
363	0.12
364	0.1
365	0.09
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.09
380	0.09
381	0.08
382	0.09
383	0.1
384	0.09
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.12
389	0.13
390	0.14
391	0.19
392	0.18
393	0.18
394	0.2
395	0.19
396	0.19
397	0.17
398	0.15
399	0.09
400	0.1
401	0.1
402	0.11
403	0.14
404	0.16
405	0.2
406	0.2
407	0.21
408	0.19
409	0.19
410	0.15
411	0.13
412	0.11
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.06
420	0.07
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.09
429	0.1
430	0.11
431	0.13
432	0.14
433	0.17
434	0.16
435	0.16
436	0.15
437	0.16
438	0.15
439	0.13
440	0.12
441	0.09
442	0.1
443	0.09
444	0.07
445	0.06
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.08
452	0.09
453	0.08
454	0.09
455	0.09
456	0.11
457	0.15
458	0.18
459	0.23
460	0.25
461	0.25
462	0.27
463	0.36
464	0.38
465	0.42
466	0.4
467	0.35
468	0.34
469	0.35
470	0.32
471	0.23
472	0.19
473	0.12
474	0.09
475	0.07
476	0.06
477	0.04
478	0.04
479	0.03
480	0.03
481	0.03
482	0.02
483	0.02
484	0.02
485	0.02
486	0.02
487	0.02
488	0.02
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.07
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.13
503	0.16
504	0.18
505	0.25
506	0.26
507	0.33
508	0.42
509	0.52
510	0.58
511	0.58
512	0.64
513	0.6
514	0.65
515	0.58
516	0.53
517	0.44
518	0.35
519	0.32
520	0.25
521	0.26
522	0.18
523	0.19
524	0.19
525	0.18
526	0.17
527	0.21
528	0.23
529	0.21
530	0.26
531	0.27
532	0.24
533	0.26
534	0.26
535	0.24
536	0.26
537	0.28
538	0.28
539	0.29
540	0.29
541	0.27
542	0.27
543	0.3
544	0.24
545	0.23
546	0.19
547	0.16
548	0.15
549	0.15
550	0.17
551	0.13
552	0.13
553	0.14
554	0.16
555	0.15
556	0.15
557	0.17
558	0.17
559	0.22
560	0.23
561	0.23
562	0.23
563	0.25
564	0.26
565	0.32
566	0.34
567	0.31
568	0.36
569	0.39
570	0.41
571	0.42
572	0.4
573	0.34
574	0.32
575	0.29
576	0.27
577	0.21
578	0.21
579	0.2
580	0.19
581	0.19
582	0.17
583	0.17
584	0.15
585	0.13
586	0.1
587	0.1
588	0.11
589	0.14
590	0.21
591	0.28
592	0.33
593	0.41
594	0.44
595	0.44
596	0.47
597	0.5
598	0.44
599	0.39
600	0.37
601	0.35
602	0.32
603	0.31
604	0.29
605	0.25
606	0.25
607	0.25
608	0.21
609	0.17
610	0.18
611	0.21
612	0.21
613	0.19
614	0.19
615	0.18
616	0.25
617	0.24
618	0.22
619	0.19
620	0.18
621	0.16
622	0.19
623	0.19
624	0.12
625	0.12
626	0.13
627	0.13
628	0.13
629	0.13
630	0.13
631	0.14
632	0.19
633	0.22
634	0.2
635	0.21
636	0.24
637	0.24
638	0.26
639	0.25
640	0.22
641	0.19
642	0.21
643	0.23
644	0.24
645	0.33
646	0.35
647	0.35
648	0.33
649	0.34
650	0.35
651	0.36
652	0.33
653	0.31
654	0.3
655	0.28
656	0.29
657	0.27
658	0.25
659	0.21
660	0.2
661	0.13
662	0.09
663	0.09
664	0.1
665	0.1
666	0.1
667	0.1
668	0.09
669	0.09
670	0.09
671	0.09
672	0.07
673	0.08
674	0.1
675	0.1
676	0.1
677	0.12
678	0.13
679	0.14
680	0.15
681	0.14
682	0.14
683	0.15
684	0.16
685	0.15
686	0.13
687	0.14
688	0.14
689	0.15
690	0.16
691	0.14
692	0.14
693	0.19
694	0.2
695	0.2
696	0.24
697	0.26
698	0.29
699	0.31
700	0.31
701	0.26
702	0.26
703	0.32
704	0.33
705	0.3
706	0.29
707	0.3
708	0.35
709	0.45
710	0.48
711	0.47
712	0.5
713	0.56
714	0.61
715	0.66
716	0.64
717	0.61
718	0.61
719	0.58
720	0.56
721	0.54
722	0.52
723	0.49
724	0.5
725	0.46
726	0.46
727	0.46
728	0.42
729	0.43
730	0.41
731	0.4
732	0.35
733	0.34
734	0.35
735	0.35
736	0.37
737	0.34
738	0.3
739	0.27
740	0.28

R0KT30

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer