Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0MIM4

Protein Details
Accession R0MIM4    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-44PLKYPSYPYPPPKKNPPHSYPPNLPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, cyto 11.5, cyto_nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR005570  RPABC3  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF03870  RNA_pol_Rpb8  
Amino Acid Sequences MRVIGYLPPLCILTFTYPPPLKYPSYPYPPPKKNPPHSYPPNLPLSILNPLPLKTPLFFMIHLNKKLVVSDIDKEGKLYTNVSRAYLNDSEIILDYHSLLLRITKGDVLLLSLYEENNGDLDCDYQMNGMVYKIEEKEGKVEIWISFGGLLMIQKMNKDEIGSIKDRSRVVLCVSKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.28
4 0.3
5 0.31
6 0.34
7 0.36
8 0.34
9 0.35
10 0.42
11 0.41
12 0.47
13 0.53
14 0.59
15 0.66
16 0.71
17 0.74
18 0.77
19 0.79
20 0.81
21 0.83
22 0.8
23 0.8
24 0.81
25 0.82
26 0.78
27 0.73
28 0.68
29 0.59
30 0.52
31 0.43
32 0.36
33 0.32
34 0.26
35 0.22
36 0.17
37 0.17
38 0.19
39 0.19
40 0.18
41 0.14
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.17
46 0.19
47 0.26
48 0.32
49 0.32
50 0.31
51 0.29
52 0.28
53 0.27
54 0.24
55 0.18
56 0.14
57 0.14
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.18
63 0.17
64 0.15
65 0.15
66 0.12
67 0.15
68 0.16
69 0.17
70 0.17
71 0.16
72 0.2
73 0.18
74 0.18
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.1
120 0.1
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.17
125 0.18
126 0.18
127 0.16
128 0.17
129 0.14
130 0.15
131 0.14
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.13
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.19
148 0.25
149 0.27
150 0.29
151 0.31
152 0.36
153 0.35
154 0.37
155 0.34
156 0.31
157 0.34