Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0MJE2

Protein Details
Accession R0MJE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-33IDYKEDQTKKTRRTRKAKSSAQFKDFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-19R
21-21R
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 9.666, cyto 6, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51195  Q_MOTIF  
Amino Acid Sequences MSDDELIDYKEDQTKKTRRTRKAKSSAQFKDFLLRDELNEVLKDLAFEHPSEVQQMAIPKAILGQDILCQAKSGTGKTAVFVLSTLQQLRVVEKETCVIVLVHTKEMADQVKEEYKRFCKKLEGVTVEAVYGGVPFEEDLKRLSVSSPTVLVGTPWKNARSCKEKGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.49
3 0.59
4 0.66
5 0.7
6 0.8
7 0.88
8 0.89
9 0.9
10 0.91
11 0.89
12 0.9
13 0.88
14 0.82
15 0.74
16 0.63
17 0.61
18 0.52
19 0.45
20 0.4
21 0.31
22 0.27
23 0.26
24 0.27
25 0.19
26 0.19
27 0.17
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.09
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.15
39 0.13
40 0.11
41 0.11
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.09
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.1
54 0.11
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.1
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.12
67 0.11
68 0.1
69 0.09
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.07
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.14
94 0.15
95 0.11
96 0.1
97 0.13
98 0.19
99 0.21
100 0.23
101 0.26
102 0.33
103 0.4
104 0.42
105 0.41
106 0.42
107 0.46
108 0.52
109 0.55
110 0.51
111 0.46
112 0.46
113 0.44
114 0.37
115 0.31
116 0.23
117 0.13
118 0.09
119 0.06
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.15
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.16
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.19
140 0.19
141 0.22
142 0.26
143 0.29
144 0.32
145 0.38
146 0.46
147 0.47