Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PUB0

Protein Details
Accession A0A1D8PUB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-362ESGGRKLAKKDSEKKKLQQAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-357RKLAKKDSEKKKL
Subcellular Location(s) nucl 24.5, mito_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0031902  C:late endosome membrane  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0071986  C:Ragulator complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:1904669  P:ATP export  
GO:0034599  P:cellular response to oxidative stress  
GO:0032456  P:endocytic recycling  
GO:0006970  P:response to osmotic stress  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
KEGG cal:CAALFM_CR10650WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRRFNKKTATTFNVVHRAHDDARFYDDEASEHVLVPQSTKKKVVTTTELEKKLANTNIRDNEGLAAQYGITYDDSKYDYMQHLKPMGNPDGVFVGAKQSQPKQSIEDLFKDQLPSKETRKVARDLNQNIPDELQGFNPNLDPRLREVLEALDDEAYIEEEDEGGDEDIFNSLLQSGEVEDEEEFYEEADDYDDEWDLDNYEEEYDAKYNSDTPEGVNSNWQRDFMQFKKDNKNKHNDWDSDDEFEDEVPELPEITANKKVSNTKMRKKKGAMTDTSSFSMSSSALFRTEGLTLLDDRYEQMSKKFEHENGEQPHKPFDMKEERHDLEDMLDDFLDNYELESGGRKLAKKDSEKKKLQQAASSVSKGKAARKVNEAFSNMKIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.62
3 0.54
4 0.47
5 0.45
6 0.43
7 0.42
8 0.38
9 0.29
10 0.35
11 0.33
12 0.32
13 0.31
14 0.28
15 0.24
16 0.23
17 0.27
18 0.22
19 0.2
20 0.2
21 0.19
22 0.19
23 0.21
24 0.26
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.35
29 0.37
30 0.43
31 0.48
32 0.47
33 0.48
34 0.55
35 0.6
36 0.6
37 0.56
38 0.51
39 0.46
40 0.46
41 0.46
42 0.42
43 0.37
44 0.43
45 0.47
46 0.49
47 0.47
48 0.4
49 0.35
50 0.3
51 0.26
52 0.17
53 0.12
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.19
67 0.24
68 0.26
69 0.29
70 0.32
71 0.32
72 0.35
73 0.38
74 0.37
75 0.34
76 0.31
77 0.27
78 0.24
79 0.23
80 0.19
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.19
86 0.22
87 0.27
88 0.31
89 0.33
90 0.32
91 0.35
92 0.4
93 0.39
94 0.39
95 0.37
96 0.35
97 0.35
98 0.33
99 0.31
100 0.27
101 0.28
102 0.28
103 0.28
104 0.34
105 0.37
106 0.41
107 0.43
108 0.44
109 0.47
110 0.5
111 0.55
112 0.53
113 0.59
114 0.58
115 0.55
116 0.5
117 0.44
118 0.37
119 0.28
120 0.23
121 0.15
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.2
132 0.2
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.14
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.14
202 0.15
203 0.14
204 0.2
205 0.2
206 0.23
207 0.23
208 0.24
209 0.2
210 0.21
211 0.27
212 0.22
213 0.31
214 0.34
215 0.41
216 0.51
217 0.55
218 0.62
219 0.63
220 0.7
221 0.64
222 0.67
223 0.68
224 0.59
225 0.59
226 0.57
227 0.51
228 0.44
229 0.4
230 0.32
231 0.24
232 0.21
233 0.17
234 0.1
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.08
242 0.11
243 0.17
244 0.17
245 0.19
246 0.22
247 0.27
248 0.33
249 0.43
250 0.49
251 0.53
252 0.63
253 0.69
254 0.73
255 0.74
256 0.74
257 0.74
258 0.72
259 0.68
260 0.64
261 0.61
262 0.56
263 0.53
264 0.45
265 0.35
266 0.26
267 0.22
268 0.15
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.17
289 0.22
290 0.23
291 0.27
292 0.32
293 0.32
294 0.36
295 0.4
296 0.45
297 0.47
298 0.54
299 0.54
300 0.5
301 0.5
302 0.45
303 0.42
304 0.33
305 0.35
306 0.37
307 0.38
308 0.44
309 0.48
310 0.48
311 0.49
312 0.5
313 0.41
314 0.31
315 0.31
316 0.25
317 0.17
318 0.16
319 0.13
320 0.13
321 0.13
322 0.12
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.1
329 0.1
330 0.14
331 0.18
332 0.2
333 0.23
334 0.32
335 0.41
336 0.48
337 0.58
338 0.64
339 0.71
340 0.78
341 0.82
342 0.85
343 0.84
344 0.79
345 0.75
346 0.69
347 0.67
348 0.64
349 0.61
350 0.54
351 0.46
352 0.47
353 0.44
354 0.45
355 0.45
356 0.47
357 0.48
358 0.53
359 0.58
360 0.6
361 0.64
362 0.61
363 0.56