Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0MAC3

Protein Details
Accession R0MAC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-205LRAGKGKMRNRRFTKRKGVLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-202KVKDSKTLRAGKGKMRNRRFTKRK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002136  Ribosomal_L4/L1e  
IPR023574  Ribosomal_L4_dom_sf  
IPR045240  Ribosomal_L4_euk/arch  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00573  Ribosomal_L4  
Amino Acid Sequences MQQKINIYNLDGNTVKDTVEMPDVMTIEVRPDIIETVHSLERLNLRQPYAVSKYAGMQHSAASWGTGRAMARCPRVAGSGTRRAGQGAFANFCRKGRMAHPIKTTRRWCRKVNLNLRRIAIAMAVAASSKPSFVQARGHKVENVKMIPLIVSDEVMSLTKTKDAFELIQNFGLEDEVKKVKDSKTLRAGKGKMRNRRFTKRKGVLIVHTNDSDLRAFTNIQGVDQLNVDKMSIFELAPGGHSGRLILWTESAFKKLSVIFGKINESSEVLKGFTLPKKLVTSDSLEELFYSDEVQSILREPEFIPQWSKKKTEEDIEINEKLFNLFNKEDLIIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.23
3 0.18
4 0.18
5 0.15
6 0.17
7 0.16
8 0.13
9 0.15
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.13
14 0.11
15 0.12
16 0.11
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.14
24 0.16
25 0.16
26 0.15
27 0.18
28 0.24
29 0.26
30 0.3
31 0.29
32 0.29
33 0.32
34 0.33
35 0.36
36 0.36
37 0.36
38 0.31
39 0.28
40 0.3
41 0.34
42 0.34
43 0.28
44 0.23
45 0.21
46 0.2
47 0.21
48 0.17
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.19
57 0.23
58 0.27
59 0.28
60 0.29
61 0.27
62 0.29
63 0.29
64 0.3
65 0.32
66 0.37
67 0.37
68 0.38
69 0.37
70 0.35
71 0.33
72 0.29
73 0.26
74 0.2
75 0.22
76 0.22
77 0.26
78 0.26
79 0.26
80 0.27
81 0.23
82 0.22
83 0.23
84 0.32
85 0.35
86 0.41
87 0.49
88 0.56
89 0.61
90 0.67
91 0.73
92 0.73
93 0.76
94 0.75
95 0.72
96 0.72
97 0.76
98 0.78
99 0.8
100 0.79
101 0.74
102 0.73
103 0.68
104 0.59
105 0.49
106 0.39
107 0.28
108 0.18
109 0.11
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.07
119 0.09
120 0.1
121 0.19
122 0.23
123 0.31
124 0.34
125 0.36
126 0.36
127 0.37
128 0.39
129 0.35
130 0.31
131 0.23
132 0.2
133 0.19
134 0.16
135 0.14
136 0.11
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.11
152 0.14
153 0.18
154 0.16
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.14
160 0.1
161 0.06
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.13
167 0.14
168 0.22
169 0.25
170 0.29
171 0.38
172 0.45
173 0.48
174 0.53
175 0.55
176 0.54
177 0.61
178 0.62
179 0.62
180 0.63
181 0.69
182 0.7
183 0.78
184 0.79
185 0.78
186 0.81
187 0.79
188 0.76
189 0.73
190 0.68
191 0.62
192 0.61
193 0.55
194 0.46
195 0.39
196 0.33
197 0.27
198 0.25
199 0.2
200 0.12
201 0.1
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.14
206 0.12
207 0.12
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.15
237 0.15
238 0.17
239 0.15
240 0.14
241 0.16
242 0.15
243 0.21
244 0.2
245 0.23
246 0.23
247 0.25
248 0.29
249 0.28
250 0.29
251 0.24
252 0.22
253 0.2
254 0.19
255 0.18
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.18
260 0.2
261 0.24
262 0.23
263 0.26
264 0.29
265 0.31
266 0.32
267 0.29
268 0.31
269 0.28
270 0.31
271 0.28
272 0.25
273 0.23
274 0.21
275 0.18
276 0.13
277 0.12
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.13
285 0.11
286 0.13
287 0.13
288 0.19
289 0.22
290 0.24
291 0.29
292 0.35
293 0.43
294 0.48
295 0.51
296 0.5
297 0.54
298 0.58
299 0.59
300 0.59
301 0.58
302 0.6
303 0.63
304 0.6
305 0.52
306 0.47
307 0.39
308 0.32
309 0.27
310 0.21
311 0.22
312 0.21
313 0.22
314 0.24