Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0MMR1

Protein Details
Accession R0MMR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-216EGGAKNKTKRKLLPKITLNKKLLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-214KNKTKRKLLPKITLNKKL
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 10, cyto 8, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
Amino Acid Sequences MTYLKLNYSKKIARKIVEVHLTLENIKSPHYSFIFEDLVEIGDKKTLDSISKFVENNFFELMNDKYGNYVLTKVIKKRPEDTEAFYSKLDLSTLNMNSNIVLRIFENFCKNRDIEKIKKILREFYHIDKDESVFQNLLLKFSDGLNTKYVTVICNLMDLDEDIFNVNNDFVKFYDNAWLNKKCGITLVKGFLEGGAKNKTKRKLLPKITLNKKLLKTKDGLKISNLIKTIKNTRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.62
3 0.63
4 0.63
5 0.57
6 0.5
7 0.46
8 0.43
9 0.37
10 0.32
11 0.26
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.21
17 0.22
18 0.24
19 0.22
20 0.26
21 0.26
22 0.24
23 0.23
24 0.17
25 0.17
26 0.14
27 0.14
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.11
33 0.12
34 0.15
35 0.16
36 0.19
37 0.2
38 0.25
39 0.25
40 0.24
41 0.3
42 0.27
43 0.28
44 0.26
45 0.22
46 0.18
47 0.2
48 0.2
49 0.16
50 0.15
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.17
59 0.21
60 0.26
61 0.33
62 0.38
63 0.4
64 0.44
65 0.47
66 0.47
67 0.46
68 0.46
69 0.47
70 0.44
71 0.43
72 0.37
73 0.32
74 0.26
75 0.23
76 0.17
77 0.1
78 0.09
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.08
91 0.1
92 0.11
93 0.17
94 0.18
95 0.19
96 0.21
97 0.22
98 0.22
99 0.28
100 0.33
101 0.32
102 0.37
103 0.44
104 0.44
105 0.48
106 0.47
107 0.46
108 0.41
109 0.41
110 0.38
111 0.36
112 0.41
113 0.37
114 0.37
115 0.31
116 0.31
117 0.3
118 0.28
119 0.23
120 0.15
121 0.14
122 0.19
123 0.19
124 0.18
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.17
130 0.12
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.19
162 0.21
163 0.24
164 0.3
165 0.33
166 0.32
167 0.35
168 0.35
169 0.27
170 0.29
171 0.28
172 0.25
173 0.27
174 0.31
175 0.28
176 0.28
177 0.28
178 0.23
179 0.23
180 0.19
181 0.19
182 0.22
183 0.25
184 0.3
185 0.38
186 0.44
187 0.49
188 0.57
189 0.64
190 0.67
191 0.73
192 0.78
193 0.8
194 0.84
195 0.86
196 0.87
197 0.82
198 0.79
199 0.77
200 0.76
201 0.71
202 0.66
203 0.61
204 0.59
205 0.64
206 0.62
207 0.57
208 0.51
209 0.54
210 0.51
211 0.51
212 0.46
213 0.39
214 0.36
215 0.41