Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DKM0

Protein Details
Accession B0DKM0    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-87DDEPVVKKRSSKPKKASALLSSHydrophilic
174-201NKPTPKASTSKSKLKPKKRETDDDDFDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-79KRSSKPK
139-141KRK
157-192PKKKSAVSMKSKVGSAKNKPTPKASTSKSKLKPKKR
221-268KPRKPVKKVAAPKKTAEKPKAVENGKGKQKEVAAKPQKFDWAAAKAAK
368-391KLDDKTKKKMEKEQAEIKKAAKEM
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR012178  RFC1  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006271  P:DNA strand elongation involved in DNA replication  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_303901  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF00533  BRCT  
PF08519  RFC1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
CDD cd00009  AAA  
cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MAPTNLAKVVKPGAKDIRMFFKGPSGQKTPASTPISTLGSRKGDTIEISDDDSVEQPSKARLVDSDDEPVVKKRSSKPKKASALLSSDESGAQRSSYYYPLNDLVQMMGSSQKPSRKVSTKSLKVDDSDDDVPVSAARKRKKPTALVSSDEEEFSPPKKKSAVSMKSKVGSAKNKPTPKASTSKSKLKPKKRETDDDDFDMQSPGDSPDSGSEVPEEEEEKPRKPVKKVAAPKKTAEKPKAVENGKGKQKEVAAKPQKFDWAAAKAAKLAGPAARGSKEVPDGAPDCLAGLSFVFTGELSSFSRDEAIDLAKRFGGRVVLQPSSKTDYVVLGDNAGPSKIAAIKKHKINTLSEDEFLGLIATRKGSGKLDDKTKKKMEKEQAEIKKAAKEMEKREQKDHIAAQSGKTIDPSTQLWTTRYAPQSLKEVCGNKSQVEKLQLWLHDWPNSLKSGFKKPGKNGMNVFRSVLITGSPGIGKTTSAHLCAKLEGFTPIELNASDARSKKLVENGMNINNKSLDGYINGAHDTNSLGVQITDKTCLIMDEVDGMSAGDRGGVGALNALIKKTKIPIICIANDRQAQKLKPLVATTFNLTFQKPQVNSIRSRILTIAFKEKMKIPANVIDQLITGTQSDIRQVLNMLSTWKLSNDAMSFDEGKNLAKMNEKYSTMSPFDITSKMLGPYLFSHTARETLGEKMEYYFQDHSFVPLFIQENYLKTQPAKLRNLEGPEKILKELELMDKAASSISDGDLVDALIHGPEQHWGLMPLHAVCSAVRPSSFLYGTGAHYGGPNSMSFPQWLGQNSKQTKLNRQLGDVQIQMRLKVSGDKHEIRQSYIPALFPHIVKPLMDVGASAVDEVIERMDEYYLNKESWDTIVELGVDTHKDVDVLKKITTATKSNFTKKYNAMEHPIPFHKAQDLGKVPKKLAGGPAPDIEEAYEVRYLEQWIHTTILT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.49
3 0.5
4 0.52
5 0.52
6 0.52
7 0.44
8 0.44
9 0.46
10 0.48
11 0.5
12 0.47
13 0.48
14 0.51
15 0.56
16 0.51
17 0.53
18 0.52
19 0.45
20 0.41
21 0.42
22 0.41
23 0.37
24 0.36
25 0.34
26 0.34
27 0.34
28 0.33
29 0.3
30 0.28
31 0.28
32 0.29
33 0.26
34 0.23
35 0.25
36 0.23
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.18
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.15
45 0.18
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.23
50 0.27
51 0.29
52 0.31
53 0.3
54 0.31
55 0.32
56 0.35
57 0.31
58 0.29
59 0.33
60 0.38
61 0.48
62 0.58
63 0.67
64 0.71
65 0.78
66 0.85
67 0.85
68 0.82
69 0.78
70 0.73
71 0.65
72 0.59
73 0.49
74 0.4
75 0.35
76 0.28
77 0.23
78 0.17
79 0.14
80 0.11
81 0.13
82 0.15
83 0.18
84 0.2
85 0.19
86 0.23
87 0.25
88 0.26
89 0.24
90 0.22
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.12
95 0.14
96 0.14
97 0.16
98 0.2
99 0.25
100 0.28
101 0.33
102 0.42
103 0.47
104 0.52
105 0.59
106 0.66
107 0.7
108 0.74
109 0.74
110 0.68
111 0.62
112 0.59
113 0.51
114 0.46
115 0.38
116 0.3
117 0.24
118 0.21
119 0.19
120 0.17
121 0.16
122 0.14
123 0.21
124 0.27
125 0.35
126 0.41
127 0.5
128 0.57
129 0.64
130 0.69
131 0.73
132 0.71
133 0.67
134 0.66
135 0.6
136 0.53
137 0.44
138 0.35
139 0.26
140 0.22
141 0.21
142 0.25
143 0.22
144 0.25
145 0.27
146 0.28
147 0.35
148 0.44
149 0.51
150 0.53
151 0.6
152 0.63
153 0.62
154 0.63
155 0.6
156 0.57
157 0.56
158 0.55
159 0.58
160 0.61
161 0.66
162 0.67
163 0.69
164 0.66
165 0.63
166 0.63
167 0.57
168 0.59
169 0.59
170 0.67
171 0.69
172 0.74
173 0.79
174 0.81
175 0.86
176 0.86
177 0.89
178 0.87
179 0.89
180 0.86
181 0.86
182 0.81
183 0.75
184 0.67
185 0.57
186 0.49
187 0.39
188 0.31
189 0.21
190 0.16
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.14
197 0.14
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.13
205 0.21
206 0.24
207 0.26
208 0.32
209 0.38
210 0.44
211 0.46
212 0.52
213 0.54
214 0.61
215 0.7
216 0.73
217 0.77
218 0.74
219 0.75
220 0.76
221 0.75
222 0.74
223 0.69
224 0.65
225 0.58
226 0.62
227 0.66
228 0.58
229 0.57
230 0.55
231 0.58
232 0.59
233 0.6
234 0.52
235 0.46
236 0.49
237 0.5
238 0.48
239 0.5
240 0.52
241 0.53
242 0.54
243 0.52
244 0.53
245 0.45
246 0.42
247 0.37
248 0.3
249 0.3
250 0.3
251 0.28
252 0.24
253 0.24
254 0.22
255 0.17
256 0.15
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.17
266 0.17
267 0.15
268 0.17
269 0.18
270 0.18
271 0.17
272 0.14
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.12
304 0.17
305 0.21
306 0.23
307 0.24
308 0.25
309 0.27
310 0.29
311 0.28
312 0.22
313 0.18
314 0.16
315 0.17
316 0.19
317 0.16
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.06
325 0.07
326 0.11
327 0.13
328 0.18
329 0.26
330 0.33
331 0.39
332 0.43
333 0.46
334 0.44
335 0.44
336 0.44
337 0.44
338 0.4
339 0.34
340 0.3
341 0.27
342 0.24
343 0.21
344 0.14
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.06
350 0.07
351 0.08
352 0.1
353 0.14
354 0.19
355 0.23
356 0.33
357 0.41
358 0.44
359 0.51
360 0.58
361 0.6
362 0.59
363 0.64
364 0.64
365 0.64
366 0.67
367 0.69
368 0.69
369 0.66
370 0.64
371 0.56
372 0.49
373 0.42
374 0.37
375 0.33
376 0.32
377 0.35
378 0.42
379 0.5
380 0.49
381 0.52
382 0.53
383 0.49
384 0.47
385 0.43
386 0.36
387 0.33
388 0.31
389 0.28
390 0.27
391 0.26
392 0.21
393 0.19
394 0.17
395 0.11
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.15
400 0.16
401 0.16
402 0.19
403 0.21
404 0.25
405 0.25
406 0.25
407 0.24
408 0.25
409 0.31
410 0.28
411 0.28
412 0.26
413 0.28
414 0.26
415 0.3
416 0.3
417 0.25
418 0.27
419 0.27
420 0.25
421 0.27
422 0.25
423 0.23
424 0.25
425 0.23
426 0.22
427 0.25
428 0.23
429 0.21
430 0.22
431 0.2
432 0.18
433 0.18
434 0.17
435 0.16
436 0.18
437 0.23
438 0.3
439 0.36
440 0.4
441 0.42
442 0.52
443 0.53
444 0.54
445 0.5
446 0.51
447 0.47
448 0.42
449 0.39
450 0.3
451 0.27
452 0.22
453 0.18
454 0.09
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.1
465 0.1
466 0.13
467 0.14
468 0.14
469 0.14
470 0.15
471 0.14
472 0.11
473 0.11
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.11
485 0.11
486 0.13
487 0.13
488 0.14
489 0.14
490 0.18
491 0.22
492 0.21
493 0.25
494 0.27
495 0.34
496 0.36
497 0.34
498 0.3
499 0.25
500 0.23
501 0.19
502 0.16
503 0.09
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.06
528 0.06
529 0.07
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.03
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.09
552 0.13
553 0.13
554 0.16
555 0.21
556 0.25
557 0.28
558 0.31
559 0.31
560 0.32
561 0.35
562 0.33
563 0.31
564 0.31
565 0.29
566 0.3
567 0.32
568 0.29
569 0.27
570 0.27
571 0.25
572 0.24
573 0.25
574 0.23
575 0.2
576 0.2
577 0.2
578 0.19
579 0.18
580 0.17
581 0.22
582 0.2
583 0.24
584 0.3
585 0.33
586 0.35
587 0.38
588 0.42
589 0.36
590 0.36
591 0.32
592 0.27
593 0.26
594 0.26
595 0.29
596 0.25
597 0.26
598 0.26
599 0.29
600 0.34
601 0.34
602 0.34
603 0.28
604 0.33
605 0.35
606 0.37
607 0.33
608 0.25
609 0.22
610 0.2
611 0.17
612 0.11
613 0.08
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.1
628 0.1
629 0.1
630 0.11
631 0.1
632 0.12
633 0.12
634 0.13
635 0.13
636 0.15
637 0.17
638 0.14
639 0.17
640 0.15
641 0.15
642 0.14
643 0.14
644 0.13
645 0.18
646 0.2
647 0.22
648 0.26
649 0.26
650 0.28
651 0.29
652 0.32
653 0.27
654 0.26
655 0.22
656 0.19
657 0.2
658 0.18
659 0.17
660 0.14
661 0.14
662 0.13
663 0.14
664 0.12
665 0.12
666 0.13
667 0.19
668 0.21
669 0.2
670 0.22
671 0.21
672 0.23
673 0.22
674 0.22
675 0.17
676 0.15
677 0.17
678 0.16
679 0.15
680 0.15
681 0.18
682 0.17
683 0.19
684 0.2
685 0.18
686 0.2
687 0.2
688 0.21
689 0.19
690 0.18
691 0.14
692 0.15
693 0.15
694 0.13
695 0.17
696 0.16
697 0.16
698 0.19
699 0.2
700 0.19
701 0.18
702 0.25
703 0.28
704 0.35
705 0.4
706 0.4
707 0.44
708 0.47
709 0.52
710 0.51
711 0.45
712 0.41
713 0.39
714 0.37
715 0.33
716 0.29
717 0.23
718 0.19
719 0.2
720 0.19
721 0.16
722 0.16
723 0.15
724 0.14
725 0.14
726 0.13
727 0.1
728 0.08
729 0.07
730 0.07
731 0.09
732 0.08
733 0.09
734 0.09
735 0.09
736 0.07
737 0.07
738 0.06
739 0.04
740 0.04
741 0.04
742 0.04
743 0.06
744 0.07
745 0.08
746 0.08
747 0.1
748 0.11
749 0.12
750 0.14
751 0.13
752 0.12
753 0.12
754 0.12
755 0.1
756 0.13
757 0.14
758 0.14
759 0.13
760 0.14
761 0.16
762 0.2
763 0.2
764 0.17
765 0.18
766 0.18
767 0.2
768 0.2
769 0.19
770 0.14
771 0.15
772 0.15
773 0.13
774 0.12
775 0.11
776 0.11
777 0.13
778 0.13
779 0.13
780 0.14
781 0.15
782 0.18
783 0.21
784 0.25
785 0.29
786 0.38
787 0.41
788 0.44
789 0.49
790 0.51
791 0.57
792 0.61
793 0.65
794 0.57
795 0.57
796 0.6
797 0.57
798 0.57
799 0.51
800 0.41
801 0.38
802 0.36
803 0.33
804 0.26
805 0.23
806 0.19
807 0.22
808 0.24
809 0.26
810 0.34
811 0.38
812 0.42
813 0.49
814 0.5
815 0.47
816 0.49
817 0.43
818 0.42
819 0.39
820 0.35
821 0.29
822 0.33
823 0.31
824 0.27
825 0.27
826 0.25
827 0.24
828 0.22
829 0.23
830 0.2
831 0.19
832 0.18
833 0.15
834 0.12
835 0.13
836 0.13
837 0.11
838 0.08
839 0.07
840 0.07
841 0.07
842 0.07
843 0.05
844 0.05
845 0.06
846 0.07
847 0.08
848 0.1
849 0.16
850 0.17
851 0.17
852 0.17
853 0.17
854 0.18
855 0.19
856 0.19
857 0.14
858 0.13
859 0.14
860 0.14
861 0.13
862 0.13
863 0.13
864 0.12
865 0.11
866 0.11
867 0.1
868 0.1
869 0.11
870 0.17
871 0.23
872 0.25
873 0.25
874 0.26
875 0.28
876 0.33
877 0.37
878 0.38
879 0.35
880 0.42
881 0.5
882 0.56
883 0.63
884 0.6
885 0.63
886 0.62
887 0.67
888 0.65
889 0.63
890 0.61
891 0.6
892 0.6
893 0.6
894 0.58
895 0.53
896 0.46
897 0.42
898 0.38
899 0.37
900 0.35
901 0.38
902 0.42
903 0.47
904 0.54
905 0.56
906 0.54
907 0.52
908 0.52
909 0.46
910 0.46
911 0.44
912 0.41
913 0.41
914 0.43
915 0.42
916 0.4
917 0.36
918 0.29
919 0.23
920 0.18
921 0.17
922 0.16
923 0.13
924 0.14
925 0.15
926 0.16
927 0.17
928 0.2
929 0.2
930 0.2