Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0MBE2

Protein Details
Accession R0MBE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MIQKTKKTRRLRGHVSHGHGRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-32TKKTRRLRGHVSHGHGRVGKHRKHPGGR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 8.5, cyto_nucl 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036227  L18e/L15P_sf  
IPR021131  Ribosomal_L18e/L15P  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00828  Ribosomal_L27A  
Amino Acid Sequences MIQKTKKTRRLRGHVSHGHGRVGKHRKHPGGRGACGASTHMKTWFQKYHPDYLGTKGQRFYHIRKNTSWAKPISASRLWSLIPKETRYNLLSNTDDVPVINCRDFGYHVVQDGKLSLERPVVVKARGFTEGAKKEIESVGGKWIICP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.84
3 0.82
4 0.73
5 0.68
6 0.61
7 0.53
8 0.52
9 0.54
10 0.53
11 0.54
12 0.61
13 0.65
14 0.69
15 0.75
16 0.75
17 0.74
18 0.69
19 0.64
20 0.56
21 0.48
22 0.41
23 0.36
24 0.3
25 0.23
26 0.21
27 0.2
28 0.23
29 0.24
30 0.3
31 0.34
32 0.31
33 0.39
34 0.41
35 0.46
36 0.44
37 0.45
38 0.4
39 0.38
40 0.45
41 0.38
42 0.37
43 0.32
44 0.31
45 0.35
46 0.38
47 0.38
48 0.4
49 0.45
50 0.46
51 0.44
52 0.49
53 0.5
54 0.5
55 0.5
56 0.41
57 0.35
58 0.36
59 0.36
60 0.35
61 0.28
62 0.25
63 0.2
64 0.21
65 0.19
66 0.19
67 0.19
68 0.19
69 0.2
70 0.21
71 0.24
72 0.24
73 0.27
74 0.26
75 0.27
76 0.23
77 0.25
78 0.23
79 0.22
80 0.22
81 0.19
82 0.17
83 0.15
84 0.14
85 0.12
86 0.14
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.18
94 0.17
95 0.19
96 0.21
97 0.21
98 0.2
99 0.19
100 0.18
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.12
105 0.13
106 0.15
107 0.19
108 0.21
109 0.21
110 0.23
111 0.23
112 0.24
113 0.25
114 0.25
115 0.23
116 0.29
117 0.32
118 0.31
119 0.31
120 0.28
121 0.29
122 0.29
123 0.3
124 0.22
125 0.19
126 0.24
127 0.26