Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R0MHE6

Protein Details
Accession R0MHE6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-259AFVDKTKKVVRLKFKREFKEKECKNHydrophilic
277-303YCENITVKSKKQPKGDKKKGKKNNKKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-303KSKKQPKGDKKKGKKNNKKE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 13.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
CDD cd07323  LAM  
cd12291  RRM1_La  
Amino Acid Sequences MTNEKIKKQVEFYFSDANFRVDAFLKQQALLHNDFVPIETILTFKRMKELGATLENVKESLKDSKIVEIKENNIKKIDTEEFKNYLTQKNIDSNFIYISGFDKENTLEDIENILSPFMKFKLVRMRRGKDKKFSGSVFVELENEKEVEDVCKLEIPAKEGPEGGETKRVKEETEFLKIMKKTDYQKEKEKIDEEKNNKEAKEKLLKDFQDKLYKFEITGKDVEIHEIKKLVEDTAFVDKTKKVVRLKFKREFKEKECKNDETTLKLIKMNEDEVKEYCENITVKSKKQPKGDKKKGKKNNKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.49
3 0.44
4 0.38
5 0.33
6 0.29
7 0.26
8 0.19
9 0.21
10 0.19
11 0.24
12 0.23
13 0.24
14 0.26
15 0.28
16 0.32
17 0.32
18 0.3
19 0.25
20 0.25
21 0.24
22 0.22
23 0.19
24 0.14
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.14
30 0.15
31 0.13
32 0.19
33 0.19
34 0.19
35 0.22
36 0.24
37 0.25
38 0.27
39 0.29
40 0.25
41 0.26
42 0.26
43 0.22
44 0.19
45 0.15
46 0.14
47 0.18
48 0.18
49 0.2
50 0.21
51 0.28
52 0.32
53 0.33
54 0.36
55 0.33
56 0.37
57 0.44
58 0.46
59 0.41
60 0.39
61 0.38
62 0.32
63 0.35
64 0.35
65 0.3
66 0.31
67 0.35
68 0.35
69 0.36
70 0.39
71 0.35
72 0.34
73 0.33
74 0.3
75 0.27
76 0.32
77 0.33
78 0.32
79 0.3
80 0.26
81 0.23
82 0.22
83 0.19
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.11
106 0.1
107 0.14
108 0.25
109 0.31
110 0.4
111 0.48
112 0.54
113 0.6
114 0.71
115 0.73
116 0.71
117 0.73
118 0.69
119 0.65
120 0.6
121 0.55
122 0.46
123 0.41
124 0.33
125 0.26
126 0.22
127 0.16
128 0.16
129 0.11
130 0.1
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.1
141 0.11
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.16
148 0.14
149 0.15
150 0.12
151 0.19
152 0.18
153 0.19
154 0.22
155 0.22
156 0.21
157 0.2
158 0.25
159 0.21
160 0.26
161 0.25
162 0.22
163 0.28
164 0.28
165 0.29
166 0.26
167 0.27
168 0.27
169 0.36
170 0.44
171 0.43
172 0.52
173 0.57
174 0.58
175 0.57
176 0.55
177 0.53
178 0.52
179 0.57
180 0.53
181 0.54
182 0.58
183 0.57
184 0.53
185 0.5
186 0.44
187 0.42
188 0.47
189 0.42
190 0.41
191 0.45
192 0.47
193 0.49
194 0.52
195 0.51
196 0.51
197 0.48
198 0.47
199 0.43
200 0.41
201 0.36
202 0.37
203 0.34
204 0.27
205 0.28
206 0.26
207 0.25
208 0.25
209 0.28
210 0.23
211 0.21
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.15
218 0.13
219 0.13
220 0.15
221 0.21
222 0.22
223 0.19
224 0.21
225 0.21
226 0.25
227 0.3
228 0.34
229 0.34
230 0.41
231 0.52
232 0.61
233 0.7
234 0.76
235 0.8
236 0.82
237 0.85
238 0.85
239 0.82
240 0.82
241 0.78
242 0.79
243 0.76
244 0.71
245 0.66
246 0.66
247 0.61
248 0.55
249 0.53
250 0.48
251 0.43
252 0.42
253 0.38
254 0.34
255 0.35
256 0.34
257 0.35
258 0.32
259 0.33
260 0.31
261 0.36
262 0.32
263 0.29
264 0.24
265 0.25
266 0.23
267 0.24
268 0.33
269 0.31
270 0.36
271 0.45
272 0.55
273 0.56
274 0.66
275 0.74
276 0.75
277 0.81
278 0.88
279 0.89
280 0.91
281 0.95
282 0.96
283 0.96