Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0MEA9

Protein Details
Accession R0MEA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-341YSNTDKRIPKGKYQCYKCKKDEYDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003511  HORMA_dom  
IPR036570  HORMA_dom_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02301  HORMA  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50815  HORMA  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
Amino Acid Sequences MQVQSQIQSLVHTTFSCIAYLRDLLDDSCFEDQKLGKSLIKKLVRNSKSKEILNLLEGMYESIKLEYLESFEIGIYRDNGYNNDGGNLKGEGDNLLLTNPSLPPSQPTPHPLLESYSFEINYNQNESNPESTIKSFCLYLQKLKPLPPSKYVTLKLYYNEKVPLNYNPKGFKDGGYHNFIYKNKKIKIEGEGNGVTLKEIYVEEENEEVKEVGDGAIQPILSQPSQPSQRILNQPSQVIPSQPSQVFPSQPSQPTPTHPTPTQPSLNTQPTPNTPSLNPTTNNNDPISCLCGDPSDTFDLIQCDYCNYWLHTVCCGFYSNTDKRIPKGKYQCYKCKKDEYDINVIYFRKSLSILYNEGFKSYSFFNKRMNVKGDDAKNLILKLEEEGFLKKYGKNVYVVKNDKIKKKIKEYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.2
4 0.18
5 0.18
6 0.19
7 0.2
8 0.19
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.17
13 0.17
14 0.17
15 0.2
16 0.19
17 0.18
18 0.21
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.34
25 0.42
26 0.47
27 0.53
28 0.53
29 0.57
30 0.64
31 0.67
32 0.71
33 0.71
34 0.71
35 0.71
36 0.69
37 0.66
38 0.6
39 0.56
40 0.49
41 0.44
42 0.34
43 0.26
44 0.24
45 0.19
46 0.14
47 0.12
48 0.1
49 0.08
50 0.09
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.12
62 0.11
63 0.12
64 0.14
65 0.14
66 0.16
67 0.18
68 0.19
69 0.17
70 0.18
71 0.17
72 0.15
73 0.16
74 0.15
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.13
91 0.18
92 0.21
93 0.23
94 0.27
95 0.31
96 0.32
97 0.33
98 0.3
99 0.29
100 0.29
101 0.29
102 0.27
103 0.23
104 0.22
105 0.21
106 0.22
107 0.21
108 0.2
109 0.2
110 0.19
111 0.18
112 0.2
113 0.22
114 0.22
115 0.21
116 0.2
117 0.18
118 0.19
119 0.2
120 0.18
121 0.16
122 0.14
123 0.15
124 0.22
125 0.22
126 0.29
127 0.31
128 0.38
129 0.4
130 0.43
131 0.51
132 0.49
133 0.51
134 0.49
135 0.5
136 0.47
137 0.51
138 0.5
139 0.44
140 0.4
141 0.38
142 0.35
143 0.36
144 0.33
145 0.29
146 0.3
147 0.27
148 0.26
149 0.26
150 0.31
151 0.32
152 0.34
153 0.35
154 0.35
155 0.35
156 0.38
157 0.36
158 0.31
159 0.29
160 0.32
161 0.32
162 0.34
163 0.34
164 0.31
165 0.35
166 0.36
167 0.38
168 0.37
169 0.41
170 0.39
171 0.43
172 0.44
173 0.43
174 0.46
175 0.47
176 0.43
177 0.39
178 0.36
179 0.32
180 0.29
181 0.26
182 0.19
183 0.11
184 0.09
185 0.05
186 0.04
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.12
212 0.16
213 0.17
214 0.18
215 0.2
216 0.26
217 0.33
218 0.35
219 0.36
220 0.34
221 0.34
222 0.33
223 0.33
224 0.27
225 0.21
226 0.2
227 0.16
228 0.18
229 0.18
230 0.18
231 0.19
232 0.2
233 0.21
234 0.21
235 0.23
236 0.23
237 0.25
238 0.26
239 0.27
240 0.26
241 0.3
242 0.36
243 0.36
244 0.36
245 0.35
246 0.37
247 0.38
248 0.42
249 0.42
250 0.35
251 0.35
252 0.38
253 0.43
254 0.39
255 0.36
256 0.33
257 0.32
258 0.36
259 0.33
260 0.28
261 0.23
262 0.27
263 0.3
264 0.31
265 0.28
266 0.28
267 0.34
268 0.35
269 0.38
270 0.34
271 0.29
272 0.26
273 0.27
274 0.26
275 0.19
276 0.16
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.18
296 0.2
297 0.22
298 0.24
299 0.24
300 0.23
301 0.22
302 0.22
303 0.18
304 0.19
305 0.26
306 0.27
307 0.32
308 0.38
309 0.39
310 0.41
311 0.5
312 0.49
313 0.51
314 0.57
315 0.62
316 0.65
317 0.73
318 0.8
319 0.81
320 0.86
321 0.83
322 0.83
323 0.78
324 0.77
325 0.77
326 0.73
327 0.73
328 0.66
329 0.61
330 0.55
331 0.5
332 0.42
333 0.34
334 0.27
335 0.18
336 0.16
337 0.16
338 0.18
339 0.21
340 0.23
341 0.24
342 0.29
343 0.28
344 0.28
345 0.26
346 0.21
347 0.19
348 0.19
349 0.28
350 0.28
351 0.31
352 0.37
353 0.45
354 0.51
355 0.56
356 0.59
357 0.54
358 0.54
359 0.59
360 0.57
361 0.55
362 0.51
363 0.46
364 0.43
365 0.39
366 0.33
367 0.26
368 0.22
369 0.19
370 0.19
371 0.17
372 0.16
373 0.19
374 0.2
375 0.23
376 0.25
377 0.24
378 0.27
379 0.33
380 0.34
381 0.38
382 0.44
383 0.5
384 0.58
385 0.62
386 0.62
387 0.65
388 0.69
389 0.71
390 0.73
391 0.73
392 0.72