Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7Z5C3

Protein Details
Accession R7Z5C3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-123DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-429KRRKQTEDRREAGAKRRRL
1090-1106RGRGGRGGGGGGGRGGR
Subcellular Location(s) nucl 9cyto 9cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSQKYPKIVSQVIEEQPQEIDGEFIPVDTRGPNPNGEETDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKPAPATEQEMMVEVFKYTDRVVKMSRPRKLLMIASDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKDEDKAEFLKMLQSQKKDGVIEEEVHEAINKKTWDSNAITPGTPFMDILAASLRYWCAYKLNTDPAWAKLKVIISDATVPGEGEHKIMEFIRSQRRSPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQEGKQRTCRICGQTGHKAEECRGEAKKKQGEFDEKQNSPTLKPFIWLHVSVLREYLAEELYVPDQPFKFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREQGIDTLISIWRENIPIMGGYVTKDGHVDLARAQCILSGLAKQEDAIFKRRKQTEDRREAGAKRRRLEDARNGRNYTPGGRQNGHSDPSTPTSNPKRGRKPPAAPSIADMAQIPSFTPGESNPEDARIMSHEMFVNRKAMFQAQQAQQAQEAQQANKSAAAVLKEKLLGRRAPGTQDGAGEAATVDGEPNGTDIPGTPASDVGLTPQSALGKRKADMIDDDSADLGRATPDAGADPQKNSDEPAPDTVRLWEDGYADRYYEQKFKVDPKDVEFRHKVANAYVEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDLDKLEITFDKGRPFRPYEQLMGVLPAASNHAIPEVFRPLMVEPSEIADFYPEDFEVDLNGKKFAWQGVALLPFINAKRLLDAMATKYPLLTAEEVARNELGKDVLLFSTSHPLYEEVSTNFYSKKQGAPKYKLNARISEGLSGKVEKNEDYLPGSTLSYPGGDGTMPDIEDDQSISVHYEMPKSTHIHKSMLLPGVKFPPPALDRSDIETTRARASRSGRSYGGAQFNNNDFNGGSRPGRGGGRNSHQFRNNNNRNGGGGGGGYEDQGPRSYDTRSSNGGNQGGLNYANPIAAHLNPNFDPSSFGRGPPGFPPFDPRGPPPDPRMLPPGFMQQWAQAQGMPPMPMPGAGRGGYGGQGGYGAPQASRGGYGGGYDGSQNRGGGGDGYDRYDGRESYSGQQQQQGRDGGGGGYRGRGGRGGGGGGGRGGRGGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.55
4 0.56
5 0.5
6 0.48
7 0.49
8 0.47
9 0.46
10 0.43
11 0.37
12 0.33
13 0.31
14 0.25
15 0.17
16 0.15
17 0.09
18 0.12
19 0.11
20 0.1
21 0.11
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.14
26 0.18
27 0.2
28 0.24
29 0.26
30 0.32
31 0.34
32 0.35
33 0.35
34 0.33
35 0.36
36 0.33
37 0.3
38 0.25
39 0.21
40 0.19
41 0.17
42 0.13
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.18
50 0.22
51 0.22
52 0.29
53 0.33
54 0.37
55 0.42
56 0.42
57 0.4
58 0.38
59 0.4
60 0.33
61 0.3
62 0.25
63 0.21
64 0.19
65 0.16
66 0.15
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.16
73 0.17
74 0.21
75 0.24
76 0.32
77 0.43
78 0.51
79 0.57
80 0.57
81 0.57
82 0.57
83 0.59
84 0.55
85 0.49
86 0.45
87 0.39
88 0.35
89 0.36
90 0.31
91 0.28
92 0.23
93 0.19
94 0.15
95 0.19
96 0.25
97 0.3
98 0.4
99 0.49
100 0.58
101 0.68
102 0.76
103 0.8
104 0.82
105 0.79
106 0.76
107 0.77
108 0.77
109 0.75
110 0.78
111 0.72
112 0.69
113 0.72
114 0.66
115 0.57
116 0.53
117 0.45
118 0.38
119 0.38
120 0.34
121 0.27
122 0.26
123 0.3
124 0.27
125 0.35
126 0.37
127 0.36
128 0.39
129 0.42
130 0.46
131 0.41
132 0.38
133 0.34
134 0.31
135 0.3
136 0.28
137 0.26
138 0.22
139 0.21
140 0.21
141 0.17
142 0.15
143 0.18
144 0.17
145 0.16
146 0.2
147 0.22
148 0.26
149 0.29
150 0.34
151 0.35
152 0.37
153 0.35
154 0.32
155 0.32
156 0.28
157 0.23
158 0.17
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.19
174 0.24
175 0.32
176 0.32
177 0.35
178 0.36
179 0.37
180 0.42
181 0.37
182 0.32
183 0.28
184 0.3
185 0.27
186 0.27
187 0.23
188 0.19
189 0.22
190 0.22
191 0.19
192 0.16
193 0.15
194 0.13
195 0.14
196 0.12
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.1
201 0.1
202 0.12
203 0.13
204 0.2
205 0.3
206 0.33
207 0.35
208 0.41
209 0.46
210 0.53
211 0.57
212 0.61
213 0.6
214 0.66
215 0.69
216 0.66
217 0.69
218 0.61
219 0.54
220 0.43
221 0.35
222 0.27
223 0.25
224 0.19
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.12
240 0.14
241 0.14
242 0.18
243 0.2
244 0.24
245 0.26
246 0.27
247 0.25
248 0.27
249 0.27
250 0.23
251 0.28
252 0.28
253 0.28
254 0.31
255 0.35
256 0.33
257 0.38
258 0.44
259 0.41
260 0.44
261 0.47
262 0.5
263 0.54
264 0.57
265 0.57
266 0.53
267 0.48
268 0.44
269 0.44
270 0.39
271 0.34
272 0.34
273 0.36
274 0.38
275 0.46
276 0.51
277 0.46
278 0.48
279 0.51
280 0.55
281 0.53
282 0.58
283 0.59
284 0.52
285 0.52
286 0.53
287 0.47
288 0.39
289 0.41
290 0.34
291 0.25
292 0.27
293 0.27
294 0.26
295 0.29
296 0.28
297 0.25
298 0.25
299 0.26
300 0.23
301 0.22
302 0.18
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.11
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.14
317 0.16
318 0.16
319 0.15
320 0.19
321 0.2
322 0.22
323 0.21
324 0.24
325 0.21
326 0.19
327 0.18
328 0.15
329 0.11
330 0.09
331 0.08
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.12
346 0.14
347 0.15
348 0.14
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.14
353 0.09
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.09
376 0.1
377 0.09
378 0.11
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.09
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.11
393 0.14
394 0.16
395 0.23
396 0.27
397 0.3
398 0.39
399 0.43
400 0.46
401 0.52
402 0.6
403 0.63
404 0.67
405 0.67
406 0.64
407 0.64
408 0.64
409 0.64
410 0.61
411 0.57
412 0.5
413 0.5
414 0.5
415 0.49
416 0.52
417 0.52
418 0.55
419 0.57
420 0.6
421 0.6
422 0.55
423 0.54
424 0.48
425 0.41
426 0.37
427 0.34
428 0.32
429 0.31
430 0.32
431 0.35
432 0.36
433 0.35
434 0.28
435 0.25
436 0.22
437 0.25
438 0.26
439 0.21
440 0.25
441 0.3
442 0.38
443 0.44
444 0.51
445 0.57
446 0.63
447 0.72
448 0.74
449 0.74
450 0.75
451 0.77
452 0.71
453 0.61
454 0.54
455 0.48
456 0.39
457 0.32
458 0.23
459 0.15
460 0.12
461 0.12
462 0.1
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.11
469 0.12
470 0.15
471 0.14
472 0.15
473 0.15
474 0.15
475 0.15
476 0.11
477 0.14
478 0.11
479 0.12
480 0.12
481 0.14
482 0.15
483 0.16
484 0.17
485 0.14
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.15
490 0.16
491 0.23
492 0.22
493 0.28
494 0.28
495 0.28
496 0.26
497 0.25
498 0.23
499 0.21
500 0.21
501 0.14
502 0.16
503 0.16
504 0.16
505 0.15
506 0.15
507 0.1
508 0.09
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.11
513 0.12
514 0.14
515 0.15
516 0.18
517 0.17
518 0.17
519 0.2
520 0.2
521 0.21
522 0.22
523 0.21
524 0.18
525 0.18
526 0.16
527 0.12
528 0.11
529 0.09
530 0.07
531 0.04
532 0.04
533 0.03
534 0.03
535 0.02
536 0.03
537 0.02
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.06
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.09
557 0.1
558 0.13
559 0.15
560 0.16
561 0.16
562 0.21
563 0.21
564 0.2
565 0.2
566 0.22
567 0.2
568 0.19
569 0.18
570 0.14
571 0.13
572 0.12
573 0.1
574 0.06
575 0.04
576 0.03
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.06
582 0.09
583 0.1
584 0.11
585 0.12
586 0.13
587 0.13
588 0.14
589 0.15
590 0.14
591 0.14
592 0.19
593 0.19
594 0.19
595 0.19
596 0.19
597 0.18
598 0.16
599 0.15
600 0.11
601 0.1
602 0.11
603 0.14
604 0.13
605 0.12
606 0.12
607 0.14
608 0.15
609 0.18
610 0.17
611 0.17
612 0.19
613 0.26
614 0.32
615 0.37
616 0.36
617 0.36
618 0.45
619 0.43
620 0.49
621 0.44
622 0.39
623 0.37
624 0.37
625 0.33
626 0.25
627 0.27
628 0.2
629 0.19
630 0.18
631 0.13
632 0.11
633 0.1
634 0.09
635 0.05
636 0.05
637 0.03
638 0.03
639 0.03
640 0.04
641 0.04
642 0.05
643 0.06
644 0.06
645 0.07
646 0.12
647 0.16
648 0.15
649 0.19
650 0.2
651 0.25
652 0.28
653 0.3
654 0.27
655 0.23
656 0.23
657 0.2
658 0.19
659 0.15
660 0.12
661 0.09
662 0.07
663 0.08
664 0.09
665 0.09
666 0.08
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.07
671 0.1
672 0.12
673 0.13
674 0.2
675 0.22
676 0.24
677 0.29
678 0.34
679 0.35
680 0.38
681 0.4
682 0.36
683 0.36
684 0.35
685 0.3
686 0.26
687 0.21
688 0.14
689 0.11
690 0.08
691 0.08
692 0.07
693 0.06
694 0.05
695 0.06
696 0.06
697 0.07
698 0.09
699 0.11
700 0.11
701 0.11
702 0.12
703 0.12
704 0.15
705 0.15
706 0.13
707 0.1
708 0.12
709 0.13
710 0.11
711 0.11
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.09
716 0.06
717 0.06
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.09
722 0.11
723 0.1
724 0.11
725 0.1
726 0.11
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.1
731 0.11
732 0.14
733 0.16
734 0.15
735 0.14
736 0.13
737 0.13
738 0.13
739 0.14
740 0.11
741 0.1
742 0.11
743 0.11
744 0.11
745 0.11
746 0.12
747 0.14
748 0.16
749 0.17
750 0.16
751 0.15
752 0.15
753 0.14
754 0.14
755 0.11
756 0.1
757 0.13
758 0.17
759 0.17
760 0.18
761 0.18
762 0.16
763 0.15
764 0.15
765 0.11
766 0.07
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.08
771 0.08
772 0.08
773 0.16
774 0.16
775 0.15
776 0.15
777 0.16
778 0.17
779 0.18
780 0.19
781 0.13
782 0.16
783 0.17
784 0.18
785 0.18
786 0.17
787 0.19
788 0.18
789 0.24
790 0.29
791 0.37
792 0.46
793 0.52
794 0.59
795 0.64
796 0.69
797 0.72
798 0.67
799 0.62
800 0.56
801 0.56
802 0.48
803 0.45
804 0.4
805 0.32
806 0.3
807 0.28
808 0.25
809 0.21
810 0.21
811 0.16
812 0.18
813 0.17
814 0.18
815 0.18
816 0.18
817 0.17
818 0.16
819 0.17
820 0.14
821 0.14
822 0.12
823 0.1
824 0.09
825 0.08
826 0.07
827 0.06
828 0.06
829 0.08
830 0.08
831 0.08
832 0.08
833 0.09
834 0.09
835 0.09
836 0.09
837 0.07
838 0.06
839 0.07
840 0.08
841 0.07
842 0.1
843 0.11
844 0.13
845 0.13
846 0.15
847 0.19
848 0.21
849 0.27
850 0.32
851 0.33
852 0.33
853 0.35
854 0.37
855 0.4
856 0.43
857 0.4
858 0.32
859 0.32
860 0.36
861 0.35
862 0.3
863 0.24
864 0.26
865 0.25
866 0.27
867 0.28
868 0.27
869 0.27
870 0.32
871 0.38
872 0.31
873 0.33
874 0.34
875 0.32
876 0.35
877 0.35
878 0.31
879 0.3
880 0.35
881 0.41
882 0.42
883 0.45
884 0.39
885 0.39
886 0.42
887 0.43
888 0.46
889 0.38
890 0.35
891 0.34
892 0.35
893 0.36
894 0.33
895 0.27
896 0.18
897 0.19
898 0.2
899 0.2
900 0.18
901 0.16
902 0.17
903 0.19
904 0.23
905 0.25
906 0.27
907 0.32
908 0.4
909 0.49
910 0.52
911 0.56
912 0.6
913 0.62
914 0.66
915 0.7
916 0.7
917 0.68
918 0.67
919 0.61
920 0.54
921 0.5
922 0.41
923 0.3
924 0.2
925 0.12
926 0.11
927 0.09
928 0.09
929 0.09
930 0.09
931 0.09
932 0.11
933 0.12
934 0.14
935 0.15
936 0.17
937 0.22
938 0.27
939 0.3
940 0.33
941 0.34
942 0.37
943 0.42
944 0.41
945 0.35
946 0.31
947 0.27
948 0.25
949 0.22
950 0.17
951 0.12
952 0.11
953 0.11
954 0.1
955 0.11
956 0.12
957 0.13
958 0.18
959 0.17
960 0.22
961 0.21
962 0.25
963 0.24
964 0.22
965 0.24
966 0.22
967 0.3
968 0.26
969 0.26
970 0.3
971 0.31
972 0.33
973 0.34
974 0.37
975 0.3
976 0.3
977 0.37
978 0.36
979 0.41
980 0.42
981 0.41
982 0.43
983 0.45
984 0.5
985 0.49
986 0.52
987 0.49
988 0.49
989 0.53
990 0.46
991 0.44
992 0.42
993 0.45
994 0.36
995 0.36
996 0.33
997 0.29
998 0.32
999 0.33
1000 0.31
1001 0.23
1002 0.22
1003 0.25
1004 0.27
1005 0.24
1006 0.2
1007 0.18
1008 0.18
1009 0.19
1010 0.19
1011 0.17
1012 0.18
1013 0.17
1014 0.17
1015 0.16
1016 0.17
1017 0.16
1018 0.15
1019 0.12
1020 0.08
1021 0.08
1022 0.07
1023 0.08
1024 0.09
1025 0.09
1026 0.08
1027 0.1
1028 0.11
1029 0.11
1030 0.12
1031 0.11
1032 0.1
1033 0.1
1034 0.11
1035 0.1
1036 0.1
1037 0.1
1038 0.11
1039 0.13
1040 0.15
1041 0.17
1042 0.16
1043 0.15
1044 0.15
1045 0.15
1046 0.14
1047 0.14
1048 0.17
1049 0.16
1050 0.19
1051 0.21
1052 0.2
1053 0.23
1054 0.25
1055 0.23
1056 0.23
1057 0.27
1058 0.27
1059 0.31
1060 0.4
1061 0.43
1062 0.42
1063 0.49
1064 0.48
1065 0.49
1066 0.51
1067 0.48
1068 0.4
1069 0.34
1070 0.32
1071 0.27
1072 0.24
1073 0.22
1074 0.17
1075 0.16
1076 0.18
1077 0.18
1078 0.18
1079 0.19
1080 0.18
1081 0.18
1082 0.19
1083 0.18
1084 0.17
1085 0.17
1086 0.17
1087 0.16
1088 0.16
1089 0.12