Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YXJ5

Protein Details
Accession R7YXJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-37LYHTAAKIKESQRRRHAPEAIVHydrophilic
76-98QKEIGQKKKARHLGRNSMKKKEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-96QKKKARHLGRNSMKKK
470-482KAKGKAPGPKPKI
Subcellular Location(s) mito 14, cyto_mito 10, nucl 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002314  aa-tRNA-synt_IIb  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR002317  Ser-tRNA-ligase_type_1  
IPR042103  SerRS_1_N_sf  
IPR033729  SerRS_core  
IPR010978  tRNA-bd_arm  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004828  F:serine-tRNA ligase activity  
GO:0006434  P:seryl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00587  tRNA-synt_2b  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
CDD cd00770  SerRS_core  
Amino Acid Sequences MSPVFCRRRVRTLTSLYHTAAKIKESQRRRHAPEAIVDEIIEAFEDHRKMSPSDDPQSDAKRRKATQIGAEINATQKEIGQKKKARHLGRNSMKKKEDLQKEKASQEELAAEKLAALNRKAKSIGNYVHDSVPVSNNEDDNALIRKWAPEGVTPQNLDCLSHHEVLTRLNGYDPERGTKIVGHRGYCLTGYGLFLNLALVNYGLEFLFNKGYTPNQPPYFMLREAMAKTAQLEQFDEELYKVTEDENNKTTDKYLIATSEQPLSALHSEEWLQDNDLPIKYAGYSTCFRKEAGAHGRDAWGIFRVHQFEKIEQFIFCKPEASWDMFDSMISTSEEFYQSLGLPYRIMAIVSGALNNAASKKYDLEAWFPYQGEYKGMFNACYLGSNCTDYQSRELEIRYGAKKKTDTTKTYVHALNSTLCATERALCCVLENYQKEDGIEVPAVLRKYIPGNPEFLPYVKELPKDSTSQKAKGKAPGPKPKIAAPGEAPDKLHELERLKIGQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.7
3 0.62
4 0.6
5 0.53
6 0.49
7 0.41
8 0.35
9 0.38
10 0.41
11 0.48
12 0.52
13 0.61
14 0.67
15 0.75
16 0.8
17 0.81
18 0.81
19 0.76
20 0.75
21 0.71
22 0.63
23 0.53
24 0.45
25 0.36
26 0.28
27 0.23
28 0.15
29 0.08
30 0.07
31 0.11
32 0.12
33 0.13
34 0.16
35 0.18
36 0.19
37 0.23
38 0.3
39 0.34
40 0.41
41 0.42
42 0.42
43 0.46
44 0.54
45 0.59
46 0.59
47 0.59
48 0.6
49 0.6
50 0.66
51 0.67
52 0.65
53 0.64
54 0.66
55 0.62
56 0.55
57 0.54
58 0.46
59 0.41
60 0.35
61 0.27
62 0.18
63 0.15
64 0.22
65 0.28
66 0.35
67 0.41
68 0.47
69 0.54
70 0.64
71 0.71
72 0.72
73 0.74
74 0.77
75 0.78
76 0.83
77 0.87
78 0.83
79 0.83
80 0.77
81 0.71
82 0.7
83 0.68
84 0.69
85 0.67
86 0.69
87 0.69
88 0.72
89 0.71
90 0.65
91 0.57
92 0.47
93 0.39
94 0.36
95 0.27
96 0.22
97 0.19
98 0.16
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.16
104 0.22
105 0.22
106 0.25
107 0.26
108 0.27
109 0.29
110 0.33
111 0.37
112 0.35
113 0.38
114 0.38
115 0.37
116 0.35
117 0.32
118 0.26
119 0.24
120 0.19
121 0.19
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.15
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.14
135 0.13
136 0.14
137 0.19
138 0.25
139 0.28
140 0.28
141 0.27
142 0.29
143 0.28
144 0.26
145 0.2
146 0.21
147 0.21
148 0.22
149 0.22
150 0.19
151 0.2
152 0.21
153 0.23
154 0.18
155 0.13
156 0.12
157 0.15
158 0.16
159 0.2
160 0.2
161 0.2
162 0.2
163 0.21
164 0.21
165 0.21
166 0.23
167 0.27
168 0.29
169 0.27
170 0.28
171 0.28
172 0.29
173 0.26
174 0.22
175 0.14
176 0.11
177 0.11
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.1
199 0.14
200 0.19
201 0.25
202 0.25
203 0.26
204 0.27
205 0.31
206 0.33
207 0.29
208 0.24
209 0.18
210 0.19
211 0.19
212 0.19
213 0.14
214 0.11
215 0.11
216 0.15
217 0.15
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.09
231 0.11
232 0.14
233 0.15
234 0.17
235 0.18
236 0.18
237 0.18
238 0.16
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.1
271 0.13
272 0.15
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.21
277 0.22
278 0.26
279 0.33
280 0.31
281 0.28
282 0.28
283 0.29
284 0.27
285 0.26
286 0.18
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.13
291 0.16
292 0.16
293 0.21
294 0.22
295 0.22
296 0.25
297 0.26
298 0.24
299 0.2
300 0.22
301 0.2
302 0.21
303 0.19
304 0.17
305 0.14
306 0.19
307 0.21
308 0.22
309 0.21
310 0.19
311 0.21
312 0.19
313 0.19
314 0.14
315 0.12
316 0.1
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.1
348 0.1
349 0.15
350 0.16
351 0.19
352 0.22
353 0.25
354 0.26
355 0.25
356 0.25
357 0.23
358 0.22
359 0.21
360 0.19
361 0.16
362 0.18
363 0.19
364 0.19
365 0.16
366 0.17
367 0.14
368 0.16
369 0.16
370 0.14
371 0.15
372 0.18
373 0.17
374 0.19
375 0.21
376 0.19
377 0.22
378 0.22
379 0.22
380 0.21
381 0.22
382 0.21
383 0.22
384 0.26
385 0.29
386 0.33
387 0.34
388 0.37
389 0.39
390 0.43
391 0.5
392 0.53
393 0.52
394 0.52
395 0.57
396 0.54
397 0.58
398 0.55
399 0.47
400 0.4
401 0.36
402 0.33
403 0.27
404 0.25
405 0.19
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.2
410 0.18
411 0.21
412 0.22
413 0.21
414 0.22
415 0.22
416 0.25
417 0.27
418 0.29
419 0.29
420 0.31
421 0.32
422 0.3
423 0.3
424 0.27
425 0.22
426 0.2
427 0.15
428 0.13
429 0.16
430 0.17
431 0.15
432 0.15
433 0.13
434 0.17
435 0.21
436 0.26
437 0.24
438 0.27
439 0.28
440 0.32
441 0.32
442 0.28
443 0.27
444 0.24
445 0.29
446 0.29
447 0.31
448 0.29
449 0.33
450 0.36
451 0.38
452 0.4
453 0.43
454 0.46
455 0.51
456 0.55
457 0.57
458 0.6
459 0.63
460 0.67
461 0.67
462 0.71
463 0.74
464 0.74
465 0.73
466 0.71
467 0.68
468 0.69
469 0.62
470 0.57
471 0.5
472 0.52
473 0.51
474 0.5
475 0.45
476 0.38
477 0.39
478 0.34
479 0.32
480 0.3
481 0.28
482 0.3
483 0.35