Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DBT4

Protein Details
Accession B0DBT4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
468-496PGAPATPPANQRRKRKAKGWFCPICRQPYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
479-485RRKRKAK
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 11.5, nucl 4, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045194  MGRN1/RNF157-like  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_297698  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
Amino Acid Sequences MSHQPTAAGGAPVVQLDHLLSPNTADPTNAPNNVKDKKSQDPLFGPNIGSVNAGPAWTSTMDKKIVTDELTPDIVNGWIEKSKESSQPTTTLQALVNLKRPTLRLSPLSSVAEDSATPTPGEPYHQHHHGLEFEYDCDAPKCGIYVHVYLPKAHPDAPPAPPHHPFSRLLVFESVVEGGFASHLTLDDGALLELGRFEHIPAASTSSDATGASTAPADALPGTKPTNDDHPSDLSANPAASSEVGTTGRQNRRRFSRFHFRRRSLNRSISGPALAVVDAEPAAQETKNKNGKDGENEGVKVTIRLAALDEQATELASPNEQITYLHIVRLGAKPADAEEGTEDTRPWVVKVVKREATIGPHTFHLHEIFGLTSAANHAATPVTPSSPTHTYPPIDHAQGADEDSPQSECLLCLSSPREVVLLPCRHLVACKDCALNMVEFGAGGNITQGVAEPAVPAVAGETGAPATPGAPATPPANQRRKRKAKGWFCPICRQPYTSLLRITTAPPPPLEDKGDSETEDEAPPAEPETAETPTTEVRSGGLLGGSLRPGFLRGLSLSRNPQQTVRPDIESTAGLGRVGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.08
3 0.09
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.13
9 0.16
10 0.19
11 0.18
12 0.16
13 0.17
14 0.23
15 0.3
16 0.34
17 0.33
18 0.35
19 0.44
20 0.5
21 0.51
22 0.51
23 0.5
24 0.54
25 0.62
26 0.61
27 0.6
28 0.6
29 0.63
30 0.61
31 0.57
32 0.48
33 0.41
34 0.37
35 0.3
36 0.25
37 0.19
38 0.16
39 0.14
40 0.13
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.14
46 0.14
47 0.19
48 0.22
49 0.22
50 0.22
51 0.24
52 0.26
53 0.26
54 0.26
55 0.24
56 0.25
57 0.26
58 0.25
59 0.21
60 0.18
61 0.17
62 0.14
63 0.12
64 0.11
65 0.13
66 0.14
67 0.15
68 0.19
69 0.23
70 0.29
71 0.34
72 0.36
73 0.36
74 0.4
75 0.42
76 0.41
77 0.38
78 0.33
79 0.28
80 0.29
81 0.32
82 0.31
83 0.36
84 0.32
85 0.32
86 0.32
87 0.33
88 0.32
89 0.32
90 0.35
91 0.32
92 0.36
93 0.39
94 0.41
95 0.42
96 0.36
97 0.32
98 0.27
99 0.23
100 0.17
101 0.17
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.17
109 0.17
110 0.23
111 0.28
112 0.32
113 0.34
114 0.33
115 0.35
116 0.33
117 0.33
118 0.28
119 0.23
120 0.2
121 0.2
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.11
131 0.13
132 0.15
133 0.19
134 0.24
135 0.25
136 0.26
137 0.27
138 0.29
139 0.28
140 0.28
141 0.25
142 0.25
143 0.29
144 0.32
145 0.37
146 0.36
147 0.39
148 0.4
149 0.44
150 0.41
151 0.4
152 0.37
153 0.36
154 0.38
155 0.34
156 0.32
157 0.28
158 0.26
159 0.22
160 0.22
161 0.17
162 0.1
163 0.09
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.2
214 0.22
215 0.23
216 0.23
217 0.24
218 0.25
219 0.25
220 0.24
221 0.17
222 0.15
223 0.14
224 0.11
225 0.09
226 0.08
227 0.06
228 0.07
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.11
234 0.19
235 0.27
236 0.34
237 0.37
238 0.42
239 0.5
240 0.54
241 0.56
242 0.56
243 0.6
244 0.62
245 0.7
246 0.74
247 0.69
248 0.75
249 0.78
250 0.78
251 0.75
252 0.72
253 0.64
254 0.56
255 0.54
256 0.44
257 0.37
258 0.28
259 0.2
260 0.13
261 0.1
262 0.07
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.04
271 0.08
272 0.09
273 0.18
274 0.25
275 0.25
276 0.27
277 0.3
278 0.32
279 0.34
280 0.37
281 0.32
282 0.27
283 0.28
284 0.25
285 0.22
286 0.2
287 0.15
288 0.11
289 0.1
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.16
316 0.17
317 0.17
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.13
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.13
335 0.17
336 0.2
337 0.27
338 0.34
339 0.36
340 0.37
341 0.39
342 0.35
343 0.35
344 0.38
345 0.33
346 0.26
347 0.24
348 0.25
349 0.23
350 0.23
351 0.19
352 0.14
353 0.11
354 0.11
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.09
371 0.1
372 0.14
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.23
377 0.24
378 0.25
379 0.29
380 0.28
381 0.25
382 0.24
383 0.21
384 0.19
385 0.18
386 0.18
387 0.13
388 0.11
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.09
398 0.08
399 0.11
400 0.13
401 0.14
402 0.14
403 0.15
404 0.14
405 0.12
406 0.15
407 0.21
408 0.23
409 0.23
410 0.23
411 0.24
412 0.23
413 0.25
414 0.27
415 0.24
416 0.24
417 0.26
418 0.25
419 0.24
420 0.27
421 0.26
422 0.22
423 0.17
424 0.13
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.07
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.09
459 0.11
460 0.16
461 0.24
462 0.33
463 0.43
464 0.51
465 0.61
466 0.7
467 0.79
468 0.82
469 0.83
470 0.84
471 0.85
472 0.87
473 0.88
474 0.86
475 0.81
476 0.82
477 0.8
478 0.78
479 0.69
480 0.62
481 0.55
482 0.55
483 0.55
484 0.5
485 0.48
486 0.41
487 0.4
488 0.39
489 0.38
490 0.36
491 0.34
492 0.32
493 0.28
494 0.32
495 0.33
496 0.36
497 0.37
498 0.32
499 0.32
500 0.34
501 0.35
502 0.31
503 0.29
504 0.27
505 0.25
506 0.23
507 0.19
508 0.15
509 0.14
510 0.13
511 0.13
512 0.12
513 0.1
514 0.11
515 0.15
516 0.17
517 0.16
518 0.16
519 0.17
520 0.19
521 0.21
522 0.19
523 0.16
524 0.14
525 0.15
526 0.15
527 0.14
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.11
532 0.12
533 0.11
534 0.11
535 0.1
536 0.12
537 0.12
538 0.11
539 0.13
540 0.14
541 0.19
542 0.23
543 0.29
544 0.35
545 0.41
546 0.46
547 0.44
548 0.47
549 0.49
550 0.52
551 0.54
552 0.51
553 0.49
554 0.44
555 0.44
556 0.42
557 0.35
558 0.3
559 0.25
560 0.21