Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PGF5

Protein Details
Accession A0A1D8PGF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
520-542SLYYNKTTIKRHAKKNNYIIINNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 2, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0000395  P:mRNA 5'-splice site recognition  
GO:0000375  P:RNA splicing, via transesterification reactions  
KEGG cal:CAALFM_C201830WA  -  
Amino Acid Sequences MAVENYPNSISLWTQYLSSILIHDKDKTDTELFRNAYKQALIHNGYDFNSHPIWDMAIEFETNQSKQSKELLELYLRIIKIPLYQYAQYYNQFSEINKQFEIQQIITSSDQLNQYVNEFGKNHLDDLSLLEKHQIIDDFTASIFSNTQSRVNKNWQFESLLETQEFTLEIGISNNNNNNNNIAKEKPIWINYLHQEIDTYAKKPNNDQFELVCTLFQRCLIPNCYDSEIWLKYLDFINNSSLSKQEKFDKQQEIYINITAKLIPLDNNETRLKYVELLIDYEKNQEANEYLFSWMKLFSGGSKKYYKASYLEITKELFNLWIKLLDDEQFITIAESMINKYFNIHEKQPRKEKDEGTANNNNNNTTPNSESKSKLELTDSLITSVISFLNDESICILTVLYLKQLQHQQSQSQSQLETKQSQTIKIRKFFNKFNHEKCFKTSIQFWNFYFQFELTQNHWKNLKSLINHIKFNTQLPKIIIDSFIEWMYEISNDNLINFLKLNDGRSDETIIMKDLEISNSLYYNKTTIKRHAKKNNYIIINNNNNNNNNNNNNNNNNNSNNSFDKKRNNIGGEEEFLRLTSKQIGHPGIFIDAVPQITNRLMLDGNDIDLAQENLSIPPLPMFKNVEKASQPIKYPSTTTTTITQTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.14
6 0.15
7 0.15
8 0.18
9 0.2
10 0.22
11 0.24
12 0.26
13 0.28
14 0.31
15 0.31
16 0.33
17 0.35
18 0.4
19 0.4
20 0.41
21 0.42
22 0.38
23 0.36
24 0.33
25 0.3
26 0.26
27 0.33
28 0.32
29 0.31
30 0.33
31 0.32
32 0.31
33 0.32
34 0.28
35 0.24
36 0.22
37 0.2
38 0.19
39 0.17
40 0.17
41 0.15
42 0.14
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.1
47 0.14
48 0.17
49 0.17
50 0.21
51 0.21
52 0.21
53 0.23
54 0.29
55 0.27
56 0.27
57 0.32
58 0.32
59 0.33
60 0.34
61 0.35
62 0.33
63 0.31
64 0.27
65 0.23
66 0.19
67 0.21
68 0.22
69 0.24
70 0.23
71 0.25
72 0.27
73 0.31
74 0.35
75 0.33
76 0.34
77 0.3
78 0.28
79 0.28
80 0.26
81 0.31
82 0.33
83 0.34
84 0.31
85 0.31
86 0.3
87 0.34
88 0.38
89 0.29
90 0.25
91 0.22
92 0.25
93 0.25
94 0.25
95 0.2
96 0.19
97 0.2
98 0.18
99 0.18
100 0.15
101 0.16
102 0.19
103 0.19
104 0.19
105 0.18
106 0.2
107 0.26
108 0.26
109 0.25
110 0.22
111 0.22
112 0.18
113 0.21
114 0.24
115 0.18
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.19
121 0.16
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.13
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.12
133 0.13
134 0.2
135 0.23
136 0.27
137 0.32
138 0.42
139 0.47
140 0.49
141 0.5
142 0.46
143 0.44
144 0.4
145 0.41
146 0.33
147 0.29
148 0.24
149 0.21
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.1
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.08
159 0.09
160 0.11
161 0.15
162 0.19
163 0.21
164 0.21
165 0.23
166 0.23
167 0.25
168 0.25
169 0.23
170 0.22
171 0.22
172 0.26
173 0.28
174 0.28
175 0.28
176 0.27
177 0.32
178 0.31
179 0.34
180 0.3
181 0.25
182 0.23
183 0.21
184 0.26
185 0.21
186 0.2
187 0.2
188 0.22
189 0.23
190 0.29
191 0.35
192 0.37
193 0.37
194 0.37
195 0.33
196 0.34
197 0.37
198 0.31
199 0.25
200 0.18
201 0.17
202 0.15
203 0.15
204 0.13
205 0.12
206 0.16
207 0.19
208 0.21
209 0.21
210 0.23
211 0.25
212 0.23
213 0.23
214 0.23
215 0.21
216 0.19
217 0.19
218 0.16
219 0.15
220 0.17
221 0.17
222 0.13
223 0.13
224 0.15
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.18
230 0.19
231 0.2
232 0.24
233 0.3
234 0.35
235 0.42
236 0.47
237 0.44
238 0.48
239 0.48
240 0.44
241 0.39
242 0.36
243 0.29
244 0.22
245 0.21
246 0.16
247 0.14
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.09
252 0.15
253 0.16
254 0.2
255 0.21
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.2
260 0.14
261 0.15
262 0.13
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.09
286 0.16
287 0.17
288 0.2
289 0.23
290 0.24
291 0.26
292 0.28
293 0.26
294 0.21
295 0.23
296 0.24
297 0.25
298 0.25
299 0.24
300 0.24
301 0.22
302 0.2
303 0.16
304 0.14
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.09
329 0.14
330 0.17
331 0.22
332 0.3
333 0.36
334 0.44
335 0.53
336 0.56
337 0.56
338 0.6
339 0.56
340 0.54
341 0.57
342 0.53
343 0.51
344 0.54
345 0.5
346 0.48
347 0.47
348 0.4
349 0.3
350 0.29
351 0.23
352 0.18
353 0.2
354 0.19
355 0.21
356 0.24
357 0.26
358 0.26
359 0.28
360 0.26
361 0.24
362 0.22
363 0.2
364 0.22
365 0.25
366 0.23
367 0.19
368 0.19
369 0.17
370 0.16
371 0.15
372 0.1
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.05
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.09
389 0.09
390 0.13
391 0.19
392 0.22
393 0.26
394 0.28
395 0.3
396 0.33
397 0.37
398 0.35
399 0.31
400 0.29
401 0.26
402 0.28
403 0.29
404 0.28
405 0.25
406 0.29
407 0.28
408 0.33
409 0.39
410 0.42
411 0.46
412 0.48
413 0.55
414 0.56
415 0.61
416 0.63
417 0.65
418 0.67
419 0.68
420 0.7
421 0.72
422 0.68
423 0.65
424 0.62
425 0.59
426 0.49
427 0.45
428 0.45
429 0.44
430 0.46
431 0.49
432 0.44
433 0.46
434 0.45
435 0.42
436 0.36
437 0.26
438 0.23
439 0.21
440 0.23
441 0.19
442 0.29
443 0.29
444 0.32
445 0.35
446 0.33
447 0.32
448 0.36
449 0.38
450 0.3
451 0.39
452 0.45
453 0.47
454 0.49
455 0.48
456 0.45
457 0.41
458 0.44
459 0.42
460 0.33
461 0.32
462 0.3
463 0.32
464 0.29
465 0.29
466 0.25
467 0.18
468 0.18
469 0.16
470 0.15
471 0.12
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.12
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.13
487 0.15
488 0.17
489 0.17
490 0.2
491 0.22
492 0.23
493 0.25
494 0.2
495 0.21
496 0.2
497 0.19
498 0.16
499 0.14
500 0.15
501 0.13
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.14
509 0.14
510 0.16
511 0.21
512 0.26
513 0.3
514 0.38
515 0.49
516 0.56
517 0.66
518 0.74
519 0.78
520 0.82
521 0.87
522 0.85
523 0.8
524 0.74
525 0.71
526 0.7
527 0.69
528 0.63
529 0.6
530 0.57
531 0.54
532 0.54
533 0.52
534 0.48
535 0.45
536 0.48
537 0.48
538 0.49
539 0.53
540 0.55
541 0.56
542 0.55
543 0.51
544 0.5
545 0.46
546 0.44
547 0.43
548 0.43
549 0.43
550 0.45
551 0.51
552 0.53
553 0.59
554 0.62
555 0.6
556 0.57
557 0.58
558 0.55
559 0.49
560 0.44
561 0.37
562 0.29
563 0.26
564 0.25
565 0.18
566 0.16
567 0.19
568 0.2
569 0.23
570 0.3
571 0.34
572 0.33
573 0.33
574 0.33
575 0.27
576 0.25
577 0.21
578 0.16
579 0.13
580 0.13
581 0.12
582 0.11
583 0.12
584 0.12
585 0.14
586 0.12
587 0.13
588 0.13
589 0.13
590 0.18
591 0.17
592 0.17
593 0.16
594 0.15
595 0.14
596 0.14
597 0.14
598 0.09
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.11
603 0.11
604 0.1
605 0.13
606 0.16
607 0.17
608 0.21
609 0.27
610 0.29
611 0.38
612 0.39
613 0.43
614 0.42
615 0.45
616 0.47
617 0.46
618 0.47
619 0.44
620 0.47
621 0.43
622 0.43
623 0.42
624 0.41
625 0.39
626 0.38
627 0.36