Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YPA0

Protein Details
Accession R7YPA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-297GSGGKAKREREKKEKARVELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-128RGRGSRGGRGYGGR
279-381SGGKAKREREKKEKARVELGDIVDRRPAGGREGGFRGGRGGGRGRGEGGGFRGDRGDRGDRGEGRGGRGEGGFRGEGRGRGGRGRGDRGEFRGGDRGARGGAR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 11, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSGIASKNLYDLLGNDPELDPDREPEPPTKAIDKPVQRAGKRNAGAEGSPKDTPRPLGGGRGGRHEVFSGSEQAFRDRGAGAYQNRSKPPDDGLRQDRHPDRLRGPDEHRDIGNRGRGSRGGRGYGGRGTRTGRDDRHSRTGIAEHEKQAAHGWGETTGTGEWADEKAGEAIAKEEEKEGFDAVVPAPVNADGDAWEPMAGHENDWAGAVVAGAGEDIPPPEPEDKTKSYAEYLAELAEKKLQLGGGLEARKANEGAAKKFPEGKPLEREEGEDFIAGSGGKAKREREKKEKARVELGDIVDRRPAGGREGGFRGGRGGGRGRGEGGGFRGDRGDRGDRGEGRGGRGEGGFRGEGRGRGGRGRGDRGEFRGGDRGARGGARGGASQAVNLDDQSAFPSLGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.18
4 0.21
5 0.24
6 0.25
7 0.2
8 0.2
9 0.22
10 0.23
11 0.26
12 0.29
13 0.31
14 0.31
15 0.35
16 0.38
17 0.39
18 0.43
19 0.49
20 0.52
21 0.53
22 0.59
23 0.63
24 0.61
25 0.67
26 0.67
27 0.68
28 0.63
29 0.59
30 0.53
31 0.47
32 0.45
33 0.43
34 0.4
35 0.34
36 0.34
37 0.32
38 0.32
39 0.32
40 0.33
41 0.28
42 0.3
43 0.27
44 0.31
45 0.37
46 0.41
47 0.4
48 0.44
49 0.45
50 0.4
51 0.39
52 0.33
53 0.28
54 0.23
55 0.23
56 0.21
57 0.19
58 0.22
59 0.21
60 0.23
61 0.23
62 0.2
63 0.2
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.2
68 0.21
69 0.3
70 0.37
71 0.41
72 0.44
73 0.47
74 0.46
75 0.41
76 0.43
77 0.44
78 0.42
79 0.46
80 0.5
81 0.53
82 0.53
83 0.6
84 0.58
85 0.57
86 0.58
87 0.55
88 0.52
89 0.56
90 0.58
91 0.56
92 0.58
93 0.58
94 0.57
95 0.54
96 0.5
97 0.43
98 0.42
99 0.4
100 0.41
101 0.34
102 0.3
103 0.29
104 0.32
105 0.33
106 0.37
107 0.34
108 0.3
109 0.3
110 0.3
111 0.3
112 0.32
113 0.31
114 0.25
115 0.24
116 0.24
117 0.26
118 0.29
119 0.33
120 0.31
121 0.34
122 0.4
123 0.44
124 0.5
125 0.47
126 0.43
127 0.39
128 0.39
129 0.38
130 0.38
131 0.36
132 0.29
133 0.31
134 0.31
135 0.29
136 0.27
137 0.23
138 0.17
139 0.14
140 0.12
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.09
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.08
209 0.08
210 0.11
211 0.17
212 0.19
213 0.22
214 0.23
215 0.23
216 0.23
217 0.24
218 0.22
219 0.18
220 0.16
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.13
241 0.12
242 0.15
243 0.18
244 0.23
245 0.25
246 0.25
247 0.33
248 0.33
249 0.37
250 0.38
251 0.4
252 0.41
253 0.44
254 0.47
255 0.39
256 0.42
257 0.35
258 0.32
259 0.28
260 0.2
261 0.16
262 0.12
263 0.12
264 0.09
265 0.07
266 0.11
267 0.12
268 0.15
269 0.19
270 0.23
271 0.32
272 0.42
273 0.51
274 0.55
275 0.65
276 0.71
277 0.79
278 0.83
279 0.78
280 0.78
281 0.7
282 0.65
283 0.6
284 0.52
285 0.48
286 0.4
287 0.36
288 0.3
289 0.28
290 0.23
291 0.19
292 0.18
293 0.14
294 0.18
295 0.19
296 0.21
297 0.24
298 0.28
299 0.26
300 0.25
301 0.24
302 0.21
303 0.21
304 0.2
305 0.21
306 0.21
307 0.23
308 0.23
309 0.23
310 0.22
311 0.22
312 0.2
313 0.18
314 0.2
315 0.18
316 0.18
317 0.2
318 0.19
319 0.2
320 0.24
321 0.28
322 0.23
323 0.28
324 0.35
325 0.34
326 0.38
327 0.43
328 0.4
329 0.38
330 0.41
331 0.37
332 0.31
333 0.3
334 0.27
335 0.21
336 0.23
337 0.2
338 0.15
339 0.19
340 0.2
341 0.21
342 0.25
343 0.28
344 0.27
345 0.31
346 0.34
347 0.37
348 0.41
349 0.47
350 0.47
351 0.49
352 0.52
353 0.52
354 0.56
355 0.49
356 0.46
357 0.46
358 0.42
359 0.38
360 0.34
361 0.31
362 0.26
363 0.26
364 0.24
365 0.18
366 0.2
367 0.19
368 0.18
369 0.18
370 0.19
371 0.19
372 0.18
373 0.17
374 0.16
375 0.15
376 0.14
377 0.15
378 0.11
379 0.11
380 0.13
381 0.13