Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YJQ2

Protein Details
Accession R7YJQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-235EEQDRRTPRISRKRARSASPRSPHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-228PRISRKRARSA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000684  RNA_pol_II_repeat_euk  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF05001  RNA_pol_Rpb1_R  
Amino Acid Sequences MNNTFGGDLAARRARLHDAEASHAQHQPCEVVFVASSPIASTATLSPSSPAPPTPTTRLPAPDDRLPFRYDYAPPSPVQQYATVPSGHLADPGMYPSGARSPSPPSPSYSPTSPEYTPPSPTFAPFSPIFSPPSPTFSPTSPRYSPTSPRYSPTSPCGVRPSLSYSPPNWPYLSRTPTVSPCSPTYSPCSPVEAPATPPPAATAPEGNSVEEQDRRTPRISRKRARSASPRSPHSSLPSHLRYRVRVAAVDVQFALALTDRALEKVDEALRGLDAARVGLVAVRNSLTASADGLRESGGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.31
4 0.3
5 0.28
6 0.33
7 0.38
8 0.39
9 0.36
10 0.39
11 0.35
12 0.31
13 0.29
14 0.25
15 0.2
16 0.2
17 0.17
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.12
23 0.12
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.14
35 0.17
36 0.16
37 0.16
38 0.18
39 0.21
40 0.27
41 0.32
42 0.35
43 0.36
44 0.38
45 0.42
46 0.42
47 0.46
48 0.46
49 0.46
50 0.47
51 0.48
52 0.47
53 0.44
54 0.4
55 0.35
56 0.33
57 0.29
58 0.3
59 0.3
60 0.3
61 0.28
62 0.31
63 0.3
64 0.28
65 0.27
66 0.23
67 0.2
68 0.21
69 0.23
70 0.19
71 0.17
72 0.16
73 0.16
74 0.14
75 0.13
76 0.1
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.18
89 0.23
90 0.28
91 0.28
92 0.29
93 0.32
94 0.35
95 0.37
96 0.33
97 0.31
98 0.29
99 0.33
100 0.29
101 0.28
102 0.31
103 0.29
104 0.31
105 0.28
106 0.3
107 0.26
108 0.26
109 0.26
110 0.2
111 0.23
112 0.19
113 0.22
114 0.2
115 0.21
116 0.23
117 0.2
118 0.24
119 0.2
120 0.25
121 0.22
122 0.22
123 0.23
124 0.21
125 0.26
126 0.25
127 0.31
128 0.27
129 0.29
130 0.31
131 0.33
132 0.38
133 0.39
134 0.43
135 0.38
136 0.39
137 0.43
138 0.41
139 0.4
140 0.36
141 0.38
142 0.31
143 0.32
144 0.33
145 0.28
146 0.26
147 0.25
148 0.29
149 0.24
150 0.27
151 0.27
152 0.25
153 0.31
154 0.33
155 0.33
156 0.26
157 0.24
158 0.27
159 0.31
160 0.34
161 0.27
162 0.27
163 0.28
164 0.32
165 0.36
166 0.32
167 0.28
168 0.26
169 0.31
170 0.3
171 0.29
172 0.31
173 0.29
174 0.31
175 0.29
176 0.32
177 0.26
178 0.28
179 0.3
180 0.24
181 0.25
182 0.25
183 0.28
184 0.22
185 0.22
186 0.21
187 0.18
188 0.19
189 0.16
190 0.14
191 0.13
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.18
196 0.18
197 0.19
198 0.2
199 0.2
200 0.22
201 0.25
202 0.27
203 0.3
204 0.36
205 0.44
206 0.53
207 0.61
208 0.64
209 0.71
210 0.79
211 0.82
212 0.83
213 0.83
214 0.82
215 0.82
216 0.8
217 0.77
218 0.73
219 0.69
220 0.64
221 0.59
222 0.54
223 0.47
224 0.48
225 0.48
226 0.46
227 0.5
228 0.52
229 0.49
230 0.5
231 0.52
232 0.46
233 0.39
234 0.39
235 0.41
236 0.37
237 0.35
238 0.29
239 0.23
240 0.21
241 0.19
242 0.16
243 0.07
244 0.07
245 0.05
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.1
250 0.09
251 0.1
252 0.15
253 0.16
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.09
267 0.11
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.12
275 0.1
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.13