Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YJG1

Protein Details
Accession R7YJG1    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-110ETYHPTRSRHAKIHPPRKNPPRVLVQKEHydrophilic
159-178QESNDRKRKREVSYRTKSTNHydrophilic
248-267ASAAKFRKPKKNNTIPKEAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-104HAKIHPPRKNPPR
255-255K
308-320RGKRRSARTAKRP
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MPMPVNSYNLKNGIQAGVKGSRHSSGPPISIVGNRLYRKQHTPDTPPAKQTPRTPLDDDDIHCEPKGSSDEELASDDAAAEFETYHPTRSRHAKIHPPRKNPPRVLVQKEQRSDKRTDKRSADAEAAESMVETKGEHEGQDNGSRDEGNDRMNEFQWSQESNDRKRKREVSYRTKSTNIHALQPKTSLKKERSDSPEESDSAKGPSGWIAPPVGARKSEKLTFKRPSGAAKKESHESDSSAHSFKDTASAAKFRKPKKNNTIPKEAPFVQPRGQSTADGNAASSAFRFPSGIPTPDSSLGSHQERDDRGKRRSARTAKRPTKDDRTPVQDFIIPTSLTGDNIKTLLNETSHMLEKPYPKPDTGPDRPSSPLTSVPDSPIISPAKSIADLTKLSDEDNAPAICPMCRDPVDPDLLRSWTVGKPRMALREQIQFCRAHKQHEAEQTCIQRGYPPINWARLPTRMRRHNAFIESILEQRVPSHFRDRLAEKVSKGENRSLMQTLKSGASETLTPGYYGPKGARVMMDHITKTFSAAIRTRAGSDRLIASGGVSGYIQAVLVPELATRLVMDDMGVGEARAREVLAESIEIGELLNEQEQDRVKVEDDDEDGGMYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.27
4 0.31
5 0.31
6 0.32
7 0.32
8 0.3
9 0.29
10 0.3
11 0.33
12 0.3
13 0.32
14 0.31
15 0.3
16 0.3
17 0.31
18 0.31
19 0.29
20 0.32
21 0.32
22 0.36
23 0.41
24 0.45
25 0.5
26 0.55
27 0.59
28 0.59
29 0.65
30 0.7
31 0.73
32 0.73
33 0.72
34 0.73
35 0.7
36 0.68
37 0.67
38 0.67
39 0.64
40 0.64
41 0.61
42 0.56
43 0.55
44 0.55
45 0.49
46 0.46
47 0.42
48 0.38
49 0.34
50 0.31
51 0.25
52 0.24
53 0.25
54 0.21
55 0.19
56 0.2
57 0.22
58 0.22
59 0.24
60 0.2
61 0.16
62 0.14
63 0.12
64 0.1
65 0.08
66 0.07
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.13
71 0.13
72 0.17
73 0.2
74 0.22
75 0.29
76 0.38
77 0.45
78 0.46
79 0.53
80 0.61
81 0.68
82 0.78
83 0.8
84 0.8
85 0.84
86 0.87
87 0.89
88 0.84
89 0.8
90 0.8
91 0.8
92 0.79
93 0.79
94 0.78
95 0.77
96 0.77
97 0.79
98 0.76
99 0.71
100 0.7
101 0.7
102 0.71
103 0.7
104 0.73
105 0.68
106 0.68
107 0.67
108 0.63
109 0.57
110 0.47
111 0.4
112 0.32
113 0.27
114 0.19
115 0.15
116 0.12
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.17
127 0.24
128 0.25
129 0.22
130 0.22
131 0.22
132 0.21
133 0.22
134 0.21
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.2
139 0.21
140 0.23
141 0.19
142 0.19
143 0.2
144 0.19
145 0.2
146 0.25
147 0.32
148 0.38
149 0.48
150 0.53
151 0.55
152 0.62
153 0.67
154 0.68
155 0.72
156 0.73
157 0.74
158 0.78
159 0.81
160 0.76
161 0.73
162 0.66
163 0.59
164 0.58
165 0.48
166 0.46
167 0.45
168 0.43
169 0.4
170 0.43
171 0.45
172 0.41
173 0.45
174 0.45
175 0.42
176 0.48
177 0.51
178 0.55
179 0.56
180 0.58
181 0.56
182 0.53
183 0.53
184 0.46
185 0.44
186 0.36
187 0.3
188 0.24
189 0.21
190 0.15
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.13
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.19
203 0.21
204 0.25
205 0.3
206 0.35
207 0.38
208 0.46
209 0.49
210 0.5
211 0.52
212 0.5
213 0.53
214 0.54
215 0.54
216 0.52
217 0.51
218 0.51
219 0.5
220 0.49
221 0.43
222 0.36
223 0.31
224 0.26
225 0.26
226 0.25
227 0.21
228 0.2
229 0.17
230 0.16
231 0.14
232 0.16
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.2
237 0.21
238 0.27
239 0.34
240 0.37
241 0.47
242 0.52
243 0.6
244 0.65
245 0.74
246 0.78
247 0.78
248 0.81
249 0.74
250 0.71
251 0.66
252 0.57
253 0.52
254 0.45
255 0.42
256 0.35
257 0.34
258 0.32
259 0.31
260 0.29
261 0.25
262 0.22
263 0.23
264 0.2
265 0.16
266 0.15
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.12
277 0.15
278 0.16
279 0.17
280 0.18
281 0.2
282 0.21
283 0.21
284 0.15
285 0.14
286 0.17
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.18
291 0.19
292 0.25
293 0.31
294 0.34
295 0.35
296 0.42
297 0.47
298 0.49
299 0.57
300 0.61
301 0.63
302 0.67
303 0.75
304 0.76
305 0.76
306 0.76
307 0.73
308 0.72
309 0.69
310 0.65
311 0.59
312 0.58
313 0.55
314 0.51
315 0.45
316 0.38
317 0.32
318 0.27
319 0.24
320 0.16
321 0.13
322 0.15
323 0.14
324 0.12
325 0.13
326 0.11
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.14
341 0.19
342 0.23
343 0.29
344 0.28
345 0.27
346 0.29
347 0.34
348 0.4
349 0.41
350 0.43
351 0.38
352 0.39
353 0.41
354 0.41
355 0.36
356 0.29
357 0.27
358 0.24
359 0.25
360 0.23
361 0.23
362 0.24
363 0.23
364 0.21
365 0.21
366 0.19
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.09
374 0.11
375 0.12
376 0.13
377 0.15
378 0.14
379 0.14
380 0.16
381 0.15
382 0.13
383 0.16
384 0.14
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.14
393 0.15
394 0.18
395 0.2
396 0.27
397 0.25
398 0.26
399 0.24
400 0.24
401 0.23
402 0.2
403 0.2
404 0.17
405 0.22
406 0.25
407 0.24
408 0.27
409 0.3
410 0.36
411 0.35
412 0.36
413 0.35
414 0.39
415 0.41
416 0.4
417 0.4
418 0.36
419 0.36
420 0.42
421 0.4
422 0.36
423 0.39
424 0.41
425 0.44
426 0.51
427 0.53
428 0.46
429 0.51
430 0.49
431 0.45
432 0.4
433 0.33
434 0.27
435 0.26
436 0.28
437 0.24
438 0.28
439 0.3
440 0.34
441 0.35
442 0.35
443 0.36
444 0.39
445 0.41
446 0.43
447 0.49
448 0.54
449 0.6
450 0.61
451 0.64
452 0.63
453 0.62
454 0.55
455 0.46
456 0.41
457 0.36
458 0.32
459 0.27
460 0.2
461 0.16
462 0.15
463 0.18
464 0.17
465 0.19
466 0.26
467 0.28
468 0.3
469 0.36
470 0.38
471 0.42
472 0.45
473 0.46
474 0.39
475 0.43
476 0.47
477 0.46
478 0.46
479 0.43
480 0.42
481 0.4
482 0.42
483 0.39
484 0.35
485 0.31
486 0.29
487 0.26
488 0.23
489 0.21
490 0.19
491 0.15
492 0.15
493 0.14
494 0.14
495 0.15
496 0.14
497 0.14
498 0.13
499 0.16
500 0.15
501 0.17
502 0.16
503 0.18
504 0.19
505 0.21
506 0.22
507 0.21
508 0.25
509 0.28
510 0.32
511 0.27
512 0.27
513 0.28
514 0.26
515 0.25
516 0.24
517 0.2
518 0.22
519 0.24
520 0.27
521 0.29
522 0.31
523 0.32
524 0.33
525 0.34
526 0.29
527 0.29
528 0.26
529 0.23
530 0.22
531 0.19
532 0.15
533 0.14
534 0.13
535 0.11
536 0.08
537 0.08
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.05
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.09
558 0.08
559 0.07
560 0.08
561 0.09
562 0.1
563 0.09
564 0.08
565 0.08
566 0.09
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.1
571 0.11
572 0.11
573 0.1
574 0.08
575 0.07
576 0.06
577 0.07
578 0.09
579 0.09
580 0.1
581 0.14
582 0.17
583 0.19
584 0.21
585 0.22
586 0.21
587 0.24
588 0.25
589 0.25
590 0.25
591 0.25
592 0.23