Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YG65

Protein Details
Accession R7YG65    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-125YTARQPPPKASPPKRAAKPARTGYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-119KASPPKRAAK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDATLPRDRGHQAYKPGFGATPDAFAGLSGRDDDADALDFEDTYDGLGDRLDETDDAFNDDTFGGEPATQQNVAKDFDFSGQTAKIANTLQEEQMLYTARQPPPKASPPKRAAKPARTGYENYAQPDYIPKLEANAGLWGIPPKKASPQPQAHQRQESQGAPIAAESSRKMMSLEEVEAAMRAQSRKPAAPQPQVPQAPQLFAPVPPAQPSPAEFSHQAGFGVPPQILQRPQAAYDQRPLSAPRPPAQAELPPQGVQHPQILQRQRPVQPEPVAHRQAPQQPAAQPQRPPSQPRQILQNPNRLSGQGQPIAQPGPRHGMQQMGPGHQRGPSYPANVVTYPQQILDMSSEERAAHLEAEAKRAKRNYKIHLLSKDNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVTATGGVDDQGPEAALAEDFYYQVYSQIRGAPRQNPNQPASQFAQTYLFQTGGRYGNNRRRPRGGDNHIQRMEQQVQRAVEAAKAKPKNKQLVIEGSLGKISFSNAKTPKPLLNIKRTESGTPRPESAARRPSHMHRDPTTADRKVVLKDIENVYSTLMQMEDHERHMPPPLAEDSEPAVVEAHMLWRQTIQSLNEKLWRELKVMEPIIPNSPTPHPFIAILSHPKGKKAVPRIFRHITDQQRITILTMIVVHLDALDVIRNAVPTHLNGIDQPIPASVREDVELFAQTVLPPFFAYLAEAPLNIATGLLGLVLDRTNLTAVARTKIGLLVLTMFVSRAELLRPVPPAPPSAQDDWVQWTELYTRLFDAVEPVLPFVFPGSVNDAEDVYVWQFLAAMGVGASPEQQQRLVLGVKERVMETVAACRALPEEMRARRLGDVNLFMRAIGLDVELLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.41
4 0.46
5 0.51
6 0.54
7 0.51
8 0.5
9 0.44
10 0.38
11 0.37
12 0.28
13 0.24
14 0.2
15 0.19
16 0.17
17 0.16
18 0.16
19 0.11
20 0.11
21 0.09
22 0.1
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.06
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.09
44 0.08
45 0.1
46 0.14
47 0.14
48 0.17
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.16
53 0.14
54 0.12
55 0.12
56 0.09
57 0.08
58 0.1
59 0.12
60 0.16
61 0.16
62 0.17
63 0.2
64 0.22
65 0.24
66 0.23
67 0.22
68 0.2
69 0.21
70 0.22
71 0.19
72 0.2
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.16
79 0.17
80 0.18
81 0.2
82 0.2
83 0.21
84 0.21
85 0.19
86 0.21
87 0.21
88 0.16
89 0.2
90 0.27
91 0.29
92 0.35
93 0.36
94 0.4
95 0.46
96 0.56
97 0.61
98 0.61
99 0.68
100 0.7
101 0.79
102 0.8
103 0.82
104 0.82
105 0.8
106 0.82
107 0.8
108 0.77
109 0.71
110 0.68
111 0.63
112 0.62
113 0.56
114 0.5
115 0.43
116 0.36
117 0.32
118 0.35
119 0.32
120 0.25
121 0.23
122 0.19
123 0.2
124 0.22
125 0.22
126 0.18
127 0.16
128 0.15
129 0.13
130 0.14
131 0.17
132 0.16
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.25
137 0.32
138 0.4
139 0.45
140 0.53
141 0.6
142 0.69
143 0.77
144 0.76
145 0.76
146 0.7
147 0.66
148 0.62
149 0.55
150 0.48
151 0.42
152 0.35
153 0.28
154 0.26
155 0.21
156 0.16
157 0.16
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.15
165 0.16
166 0.17
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.16
177 0.2
178 0.23
179 0.28
180 0.36
181 0.43
182 0.49
183 0.54
184 0.54
185 0.6
186 0.59
187 0.55
188 0.53
189 0.45
190 0.38
191 0.32
192 0.3
193 0.22
194 0.19
195 0.24
196 0.19
197 0.19
198 0.2
199 0.21
200 0.18
201 0.19
202 0.2
203 0.21
204 0.2
205 0.23
206 0.21
207 0.22
208 0.23
209 0.22
210 0.2
211 0.15
212 0.15
213 0.13
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.12
218 0.16
219 0.16
220 0.17
221 0.2
222 0.19
223 0.21
224 0.27
225 0.29
226 0.28
227 0.34
228 0.34
229 0.3
230 0.31
231 0.32
232 0.28
233 0.3
234 0.31
235 0.28
236 0.32
237 0.33
238 0.33
239 0.32
240 0.35
241 0.33
242 0.34
243 0.33
244 0.28
245 0.27
246 0.26
247 0.25
248 0.22
249 0.2
250 0.19
251 0.21
252 0.28
253 0.34
254 0.35
255 0.4
256 0.45
257 0.47
258 0.5
259 0.49
260 0.49
261 0.48
262 0.5
263 0.5
264 0.52
265 0.51
266 0.45
267 0.44
268 0.42
269 0.45
270 0.43
271 0.39
272 0.34
273 0.32
274 0.41
275 0.46
276 0.44
277 0.41
278 0.43
279 0.48
280 0.49
281 0.52
282 0.51
283 0.54
284 0.55
285 0.53
286 0.57
287 0.58
288 0.64
289 0.64
290 0.66
291 0.57
292 0.54
293 0.53
294 0.44
295 0.37
296 0.31
297 0.31
298 0.25
299 0.23
300 0.22
301 0.23
302 0.24
303 0.24
304 0.2
305 0.16
306 0.18
307 0.18
308 0.18
309 0.17
310 0.2
311 0.19
312 0.25
313 0.26
314 0.25
315 0.26
316 0.25
317 0.25
318 0.24
319 0.23
320 0.17
321 0.2
322 0.19
323 0.2
324 0.2
325 0.22
326 0.22
327 0.21
328 0.22
329 0.19
330 0.18
331 0.16
332 0.14
333 0.13
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.12
348 0.12
349 0.17
350 0.21
351 0.21
352 0.24
353 0.29
354 0.33
355 0.36
356 0.42
357 0.43
358 0.5
359 0.55
360 0.59
361 0.62
362 0.62
363 0.54
364 0.5
365 0.46
366 0.36
367 0.29
368 0.23
369 0.17
370 0.14
371 0.17
372 0.15
373 0.16
374 0.16
375 0.17
376 0.18
377 0.18
378 0.19
379 0.2
380 0.22
381 0.22
382 0.26
383 0.24
384 0.24
385 0.23
386 0.21
387 0.15
388 0.13
389 0.1
390 0.06
391 0.06
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.04
396 0.03
397 0.04
398 0.03
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.08
413 0.12
414 0.13
415 0.16
416 0.19
417 0.25
418 0.31
419 0.37
420 0.42
421 0.43
422 0.45
423 0.46
424 0.44
425 0.4
426 0.36
427 0.31
428 0.26
429 0.22
430 0.22
431 0.17
432 0.18
433 0.15
434 0.13
435 0.11
436 0.11
437 0.13
438 0.12
439 0.13
440 0.15
441 0.21
442 0.3
443 0.4
444 0.45
445 0.46
446 0.49
447 0.54
448 0.59
449 0.62
450 0.59
451 0.6
452 0.6
453 0.66
454 0.62
455 0.56
456 0.49
457 0.44
458 0.43
459 0.35
460 0.3
461 0.25
462 0.24
463 0.24
464 0.24
465 0.2
466 0.16
467 0.18
468 0.17
469 0.22
470 0.27
471 0.29
472 0.34
473 0.4
474 0.45
475 0.45
476 0.48
477 0.43
478 0.44
479 0.46
480 0.43
481 0.37
482 0.29
483 0.26
484 0.22
485 0.18
486 0.12
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.2
491 0.22
492 0.24
493 0.26
494 0.29
495 0.31
496 0.31
497 0.39
498 0.38
499 0.44
500 0.48
501 0.47
502 0.51
503 0.5
504 0.47
505 0.44
506 0.45
507 0.42
508 0.39
509 0.37
510 0.33
511 0.36
512 0.38
513 0.41
514 0.42
515 0.36
516 0.38
517 0.41
518 0.45
519 0.51
520 0.53
521 0.51
522 0.45
523 0.5
524 0.48
525 0.52
526 0.53
527 0.44
528 0.39
529 0.35
530 0.34
531 0.3
532 0.32
533 0.26
534 0.21
535 0.24
536 0.26
537 0.25
538 0.24
539 0.22
540 0.19
541 0.18
542 0.16
543 0.11
544 0.09
545 0.07
546 0.07
547 0.12
548 0.12
549 0.14
550 0.16
551 0.16
552 0.17
553 0.2
554 0.21
555 0.16
556 0.18
557 0.18
558 0.19
559 0.18
560 0.19
561 0.18
562 0.17
563 0.17
564 0.13
565 0.12
566 0.09
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.09
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.1
575 0.11
576 0.14
577 0.15
578 0.21
579 0.23
580 0.26
581 0.31
582 0.32
583 0.33
584 0.35
585 0.34
586 0.27
587 0.27
588 0.29
589 0.3
590 0.29
591 0.3
592 0.27
593 0.27
594 0.29
595 0.28
596 0.25
597 0.21
598 0.24
599 0.22
600 0.24
601 0.23
602 0.21
603 0.2
604 0.21
605 0.2
606 0.21
607 0.25
608 0.24
609 0.3
610 0.29
611 0.3
612 0.32
613 0.33
614 0.36
615 0.4
616 0.46
617 0.49
618 0.55
619 0.62
620 0.65
621 0.64
622 0.63
623 0.61
624 0.61
625 0.6
626 0.55
627 0.48
628 0.44
629 0.42
630 0.36
631 0.3
632 0.21
633 0.14
634 0.12
635 0.11
636 0.09
637 0.09
638 0.07
639 0.05
640 0.05
641 0.04
642 0.04
643 0.05
644 0.05
645 0.06
646 0.06
647 0.07
648 0.07
649 0.09
650 0.1
651 0.09
652 0.13
653 0.13
654 0.13
655 0.13
656 0.18
657 0.19
658 0.18
659 0.18
660 0.15
661 0.15
662 0.15
663 0.17
664 0.14
665 0.12
666 0.13
667 0.13
668 0.12
669 0.13
670 0.13
671 0.12
672 0.1
673 0.1
674 0.09
675 0.11
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.09
682 0.11
683 0.08
684 0.11
685 0.11
686 0.11
687 0.11
688 0.11
689 0.11
690 0.09
691 0.08
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.03
697 0.03
698 0.04
699 0.04
700 0.05
701 0.05
702 0.06
703 0.06
704 0.07
705 0.07
706 0.12
707 0.14
708 0.16
709 0.17
710 0.17
711 0.17
712 0.17
713 0.17
714 0.12
715 0.11
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.09
720 0.09
721 0.08
722 0.09
723 0.08
724 0.07
725 0.08
726 0.1
727 0.12
728 0.16
729 0.18
730 0.19
731 0.22
732 0.22
733 0.25
734 0.24
735 0.28
736 0.3
737 0.31
738 0.32
739 0.31
740 0.31
741 0.34
742 0.33
743 0.29
744 0.24
745 0.21
746 0.2
747 0.22
748 0.22
749 0.16
750 0.16
751 0.16
752 0.16
753 0.15
754 0.16
755 0.14
756 0.16
757 0.15
758 0.15
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.11
763 0.11
764 0.08
765 0.1
766 0.15
767 0.16
768 0.17
769 0.18
770 0.17
771 0.16
772 0.16
773 0.15
774 0.11
775 0.1
776 0.09
777 0.08
778 0.08
779 0.07
780 0.08
781 0.06
782 0.05
783 0.04
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.06
788 0.09
789 0.12
790 0.13
791 0.14
792 0.14
793 0.15
794 0.19
795 0.22
796 0.21
797 0.24
798 0.27
799 0.29
800 0.3
801 0.3
802 0.26
803 0.25
804 0.23
805 0.19
806 0.22
807 0.21
808 0.2
809 0.2
810 0.19
811 0.19
812 0.2
813 0.2
814 0.18
815 0.26
816 0.31
817 0.36
818 0.37
819 0.38
820 0.4
821 0.43
822 0.41
823 0.38
824 0.4
825 0.37
826 0.38
827 0.36
828 0.31
829 0.28
830 0.23
831 0.18
832 0.11
833 0.1