Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YSI3

Protein Details
Accession R7YSI3    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-131PQYNRPGAKKPRTPKAKKTKDEDDNBasic
141-162PESPTKPAPKKRGRPKAEPADEBasic
187-208EEEKPKPKRASRAKKPKATQADBasic
218-240ENEPEPPKAKRGRKKKDAEEANGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-125PGAKKPRTPKAKKT
146-203KPAPKKRGRPKAEPADEEAEAPAPKKSRGRPKKAVADDAEEEEEKPKPKRASRAKKPK
224-234PKAKRGRKKKD
248-253PKAKGK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR001510  Znf_PARP  
IPR036957  Znf_PARP_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00533  BRCT  
PF00645  zf-PARP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
PS50064  ZF_PARP_2  
Amino Acid Sequences MPTAYRIELSPNNRAGCKDTECKNNGVKILKGECRLATLIEIQEKQSWAYKHWGCVSPKVISNMQAHCQGDLGLIEGYEEMPDEWQDKIARALEQGHIDDEDYKGDPQYNRPGAKKPRTPKAKKTKDEDDNDEGEDGEDGPESPTKPAPKKRGRPKAEPADEEAEAPAPKKSRGRPKKAVADDAEEEEEKPKPKRASRAKKPKATQADAADEEDDEVENEPEPPKAKRGRKKKDAEEANGDADEAPAPKAKGKKTTGAASASNGVKAPRQVPEGAPDALDGLTFVVTGVIDGYTRKEAEAVIKQFGGKTASGISKKVDHIVLGTDAGPKKLEMIEKDNLSTLDWDGLLQLIKDQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.44
3 0.42
4 0.44
5 0.44
6 0.44
7 0.51
8 0.52
9 0.57
10 0.58
11 0.57
12 0.56
13 0.53
14 0.49
15 0.47
16 0.51
17 0.51
18 0.48
19 0.47
20 0.41
21 0.4
22 0.38
23 0.31
24 0.25
25 0.23
26 0.23
27 0.26
28 0.26
29 0.25
30 0.27
31 0.27
32 0.27
33 0.29
34 0.26
35 0.24
36 0.32
37 0.33
38 0.36
39 0.42
40 0.48
41 0.45
42 0.51
43 0.52
44 0.46
45 0.47
46 0.46
47 0.42
48 0.4
49 0.43
50 0.39
51 0.38
52 0.4
53 0.37
54 0.32
55 0.3
56 0.24
57 0.19
58 0.16
59 0.14
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.04
68 0.05
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.19
80 0.19
81 0.21
82 0.2
83 0.18
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.14
93 0.15
94 0.19
95 0.28
96 0.33
97 0.36
98 0.38
99 0.47
100 0.53
101 0.61
102 0.65
103 0.64
104 0.67
105 0.74
106 0.79
107 0.81
108 0.82
109 0.84
110 0.82
111 0.82
112 0.82
113 0.8
114 0.78
115 0.74
116 0.68
117 0.59
118 0.52
119 0.44
120 0.34
121 0.25
122 0.19
123 0.12
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.12
132 0.17
133 0.25
134 0.33
135 0.42
136 0.51
137 0.6
138 0.7
139 0.78
140 0.79
141 0.8
142 0.82
143 0.82
144 0.78
145 0.7
146 0.63
147 0.56
148 0.49
149 0.41
150 0.31
151 0.22
152 0.16
153 0.14
154 0.12
155 0.09
156 0.12
157 0.16
158 0.23
159 0.33
160 0.43
161 0.52
162 0.59
163 0.66
164 0.73
165 0.71
166 0.7
167 0.61
168 0.55
169 0.46
170 0.39
171 0.32
172 0.23
173 0.2
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.2
179 0.24
180 0.28
181 0.38
182 0.48
183 0.57
184 0.65
185 0.76
186 0.79
187 0.82
188 0.81
189 0.8
190 0.78
191 0.7
192 0.64
193 0.57
194 0.52
195 0.44
196 0.42
197 0.33
198 0.24
199 0.2
200 0.15
201 0.11
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.17
212 0.26
213 0.36
214 0.44
215 0.55
216 0.65
217 0.73
218 0.82
219 0.83
220 0.85
221 0.84
222 0.8
223 0.76
224 0.68
225 0.59
226 0.49
227 0.4
228 0.3
229 0.22
230 0.17
231 0.1
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.13
236 0.18
237 0.22
238 0.3
239 0.33
240 0.39
241 0.42
242 0.46
243 0.47
244 0.46
245 0.43
246 0.36
247 0.38
248 0.31
249 0.27
250 0.23
251 0.19
252 0.17
253 0.19
254 0.2
255 0.18
256 0.2
257 0.22
258 0.22
259 0.25
260 0.27
261 0.25
262 0.22
263 0.19
264 0.17
265 0.15
266 0.13
267 0.09
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.08
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.19
286 0.27
287 0.27
288 0.27
289 0.28
290 0.28
291 0.28
292 0.3
293 0.26
294 0.17
295 0.15
296 0.18
297 0.24
298 0.25
299 0.26
300 0.27
301 0.29
302 0.31
303 0.33
304 0.3
305 0.23
306 0.22
307 0.23
308 0.22
309 0.18
310 0.17
311 0.2
312 0.2
313 0.21
314 0.2
315 0.17
316 0.18
317 0.21
318 0.25
319 0.24
320 0.29
321 0.35
322 0.37
323 0.38
324 0.38
325 0.35
326 0.31
327 0.28
328 0.23
329 0.18
330 0.15
331 0.14
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.11