Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D8Q6

Protein Details
Accession B0D8Q6    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-101VEEKSASRKRRQQKVDEQSDGHydrophilic
107-126ESPPPPKKAKKAKKDISDAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-122PPPKKAKKAKKDI
138-163RSTRTGGKSRGSSNSGAKKGGRKKKS
181-187KPKKPSG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.666, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_296406  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd10567  SWIB-MDM2_like  
Amino Acid Sequences MAFDFSTLEPQIRQILSAPGTDLATISAKRVRRQLLDLNPSLTAEFLKENKDNVDAIISGVFEQVSPVDDTEDAREHPVEVEEKSASRKRRQQKVDEQSDGGDEDEESPPPPKKAKKAKKDISDAELARKLSSEINSRSTRTGGKSRGSSNSGAKKGGRKKKSAATVNSDDDSDDNVTEKKPKKPSGGAKGGFAKEFLLSEPLAAVLQVNKLSRPQVVKQLWVYIKGNELQNPENKREIMCDVNLKAVFGVDKIDMFKMNKVLGQHLHENEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.23
3 0.23
4 0.23
5 0.22
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.16
10 0.12
11 0.14
12 0.13
13 0.15
14 0.19
15 0.22
16 0.27
17 0.34
18 0.38
19 0.39
20 0.45
21 0.51
22 0.56
23 0.6
24 0.58
25 0.53
26 0.47
27 0.44
28 0.37
29 0.28
30 0.19
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.18
35 0.19
36 0.21
37 0.22
38 0.24
39 0.23
40 0.19
41 0.19
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.1
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.12
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.12
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.19
72 0.24
73 0.28
74 0.34
75 0.43
76 0.5
77 0.6
78 0.67
79 0.7
80 0.76
81 0.8
82 0.81
83 0.75
84 0.66
85 0.56
86 0.49
87 0.4
88 0.29
89 0.18
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.14
98 0.19
99 0.22
100 0.31
101 0.42
102 0.51
103 0.59
104 0.69
105 0.75
106 0.78
107 0.81
108 0.74
109 0.67
110 0.63
111 0.53
112 0.46
113 0.41
114 0.33
115 0.25
116 0.22
117 0.19
118 0.15
119 0.17
120 0.18
121 0.17
122 0.23
123 0.25
124 0.26
125 0.26
126 0.26
127 0.26
128 0.24
129 0.28
130 0.26
131 0.29
132 0.31
133 0.33
134 0.35
135 0.35
136 0.34
137 0.35
138 0.38
139 0.36
140 0.35
141 0.34
142 0.38
143 0.45
144 0.51
145 0.5
146 0.47
147 0.51
148 0.56
149 0.63
150 0.63
151 0.58
152 0.56
153 0.56
154 0.55
155 0.5
156 0.43
157 0.34
158 0.26
159 0.23
160 0.16
161 0.11
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.17
166 0.22
167 0.27
168 0.35
169 0.41
170 0.46
171 0.54
172 0.63
173 0.65
174 0.7
175 0.64
176 0.6
177 0.61
178 0.57
179 0.48
180 0.38
181 0.29
182 0.19
183 0.19
184 0.15
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.07
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.14
199 0.15
200 0.19
201 0.23
202 0.24
203 0.32
204 0.34
205 0.38
206 0.38
207 0.44
208 0.42
209 0.42
210 0.4
211 0.31
212 0.33
213 0.32
214 0.33
215 0.29
216 0.32
217 0.31
218 0.37
219 0.41
220 0.41
221 0.41
222 0.39
223 0.36
224 0.35
225 0.35
226 0.32
227 0.31
228 0.33
229 0.3
230 0.36
231 0.35
232 0.32
233 0.27
234 0.24
235 0.21
236 0.14
237 0.16
238 0.1
239 0.11
240 0.13
241 0.14
242 0.18
243 0.19
244 0.23
245 0.25
246 0.25
247 0.26
248 0.26
249 0.3
250 0.31
251 0.35
252 0.4