FuNGI

R7YU00

Protein Details

Accession

R7YU00

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-84	QQQALKDERMRKRQENQAKI	Hydrophilic
413-435	ASGNESTRRKKVKKNNQDTSSAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
317-322	KKKLER
353-377	REEERKALAENKDKDKAKSDKPPSG
421-423	RKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MRLRAPGTIDLTQQRTKSEDGSEDPSTAGFVRPISLHRRRLDDDSGLHKDGDQKDGDEDDKQREQQQALKDERMRKRQENQAKIAPSAKNNRAARTGPFQKKTEQLFRTNDTPEAIKRQQLRYEEALPWHLEDDSGQRLYVGTYEAALSGCHVLLLPEETGQFRMLPLEKWYNFTAKSRVEKQPPPPSGAGVKEETAQSGILGTIARHRAKQAADEEERKFLGPRIKRPGEQDDAKPTSFFAGKRDVEDADVIDFELGEEFQDDEERDMFGADDEVDIKETEEKLKKEQLKANVFELGNEQRAWQEEEEQKKGEELKKKLERDTRKALVKREKDYNYEDDENYTDEEEEEKRREEERKALAENKDKDKAKSDKPPSGASTKGTNTPTGRPKQPEQPAKLASLKRPGSPNLSDASGNESTRRKKVKKNNQDTSSALPSRPDVGSRKPSIAMRVAAGSGSDTEATATDGGRKPRLKIRMSPNGTPNGSRAGSPVAGGRPNGSRAGSPSANAPLPSVAEIMAKIPPEGISMKDIIAAFRDRTKARPMEFVQLLKQHSRFDNKTKMFFQRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.37
3	0.37
4	0.35
5	0.33
6	0.32
7	0.32
8	0.37
9	0.37
10	0.34
11	0.32
12	0.28
13	0.25
14	0.21
15	0.18
16	0.12
17	0.11
18	0.12
19	0.14
20	0.19
21	0.28
22	0.36
23	0.43
24	0.46
25	0.53
26	0.55
27	0.6
28	0.61
29	0.57
30	0.54
31	0.54
32	0.55
33	0.5
34	0.45
35	0.4
36	0.43
37	0.39
38	0.38
39	0.31
40	0.26
41	0.27
42	0.3
43	0.31
44	0.28
45	0.29
46	0.31
47	0.35
48	0.37
49	0.39
50	0.41
51	0.41
52	0.42
53	0.46
54	0.48
55	0.48
56	0.54
57	0.56
58	0.61
59	0.67
60	0.72
61	0.72
62	0.71
63	0.74
64	0.76
65	0.8
66	0.79
67	0.77
68	0.76
69	0.7
70	0.65
71	0.64
72	0.57
73	0.54
74	0.54
75	0.53
76	0.54
77	0.54
78	0.55
79	0.54
80	0.52
81	0.49
82	0.5
83	0.55
84	0.55
85	0.58
86	0.56
87	0.56
88	0.61
89	0.63
90	0.63
91	0.58
92	0.56
93	0.56
94	0.59
95	0.59
96	0.54
97	0.47
98	0.39
99	0.37
100	0.32
101	0.35
102	0.32
103	0.33
104	0.37
105	0.41
106	0.45
107	0.46
108	0.49
109	0.45
110	0.47
111	0.45
112	0.41
113	0.38
114	0.33
115	0.3
116	0.25
117	0.2
118	0.15
119	0.13
120	0.14
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.13
125	0.14
126	0.14
127	0.14
128	0.11
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.08
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.05
141	0.06
142	0.08
143	0.07
144	0.07
145	0.08
146	0.09
147	0.1
148	0.11
149	0.1
150	0.08
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.17
155	0.24
156	0.24
157	0.28
158	0.29
159	0.29
160	0.3
161	0.32
162	0.33
163	0.3
164	0.36
165	0.4
166	0.46
167	0.5
168	0.55
169	0.62
170	0.66
171	0.62
172	0.6
173	0.54
174	0.48
175	0.44
176	0.4
177	0.34
178	0.25
179	0.24
180	0.2
181	0.2
182	0.18
183	0.14
184	0.12
185	0.09
186	0.07
187	0.06
188	0.05
189	0.06
190	0.05
191	0.09
192	0.15
193	0.16
194	0.17
195	0.18
196	0.22
197	0.22
198	0.27
199	0.27
200	0.29
201	0.32
202	0.38
203	0.38
204	0.36
205	0.36
206	0.31
207	0.28
208	0.24
209	0.27
210	0.26
211	0.33
212	0.4
213	0.44
214	0.46
215	0.5
216	0.53
217	0.52
218	0.51
219	0.46
220	0.45
221	0.45
222	0.43
223	0.37
224	0.31
225	0.26
226	0.25
227	0.22
228	0.16
229	0.2
230	0.2
231	0.22
232	0.23
233	0.22
234	0.2
235	0.2
236	0.17
237	0.09
238	0.09
239	0.07
240	0.06
241	0.05
242	0.04
243	0.04
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.07
267	0.07
268	0.12
269	0.16
270	0.17
271	0.19
272	0.27
273	0.31
274	0.35
275	0.39
276	0.43
277	0.45
278	0.45
279	0.44
280	0.42
281	0.38
282	0.32
283	0.31
284	0.24
285	0.19
286	0.18
287	0.16
288	0.12
289	0.13
290	0.15
291	0.12
292	0.16
293	0.2
294	0.24
295	0.27
296	0.27
297	0.25
298	0.25
299	0.29
300	0.29
301	0.31
302	0.3
303	0.38
304	0.45
305	0.48
306	0.53
307	0.58
308	0.6
309	0.59
310	0.65
311	0.61
312	0.62
313	0.63
314	0.65
315	0.66
316	0.64
317	0.61
318	0.62
319	0.58
320	0.54
321	0.54
322	0.5
323	0.46
324	0.43
325	0.38
326	0.31
327	0.28
328	0.25
329	0.21
330	0.17
331	0.11
332	0.08
333	0.1
334	0.11
335	0.13
336	0.14
337	0.15
338	0.16
339	0.2
340	0.24
341	0.25
342	0.31
343	0.34
344	0.37
345	0.39
346	0.44
347	0.46
348	0.51
349	0.53
350	0.51
351	0.53
352	0.5
353	0.48
354	0.51
355	0.51
356	0.5
357	0.55
358	0.56
359	0.55
360	0.56
361	0.59
362	0.54
363	0.51
364	0.45
365	0.37
366	0.35
367	0.3
368	0.33
369	0.3
370	0.31
371	0.3
372	0.35
373	0.42
374	0.42
375	0.47
376	0.46
377	0.49
378	0.54
379	0.62
380	0.64
381	0.6
382	0.62
383	0.58
384	0.57
385	0.59
386	0.53
387	0.48
388	0.48
389	0.45
390	0.41
391	0.43
392	0.42
393	0.41
394	0.39
395	0.37
396	0.29
397	0.29
398	0.25
399	0.22
400	0.25
401	0.22
402	0.21
403	0.23
404	0.27
405	0.3
406	0.38
407	0.47
408	0.47
409	0.54
410	0.65
411	0.72
412	0.77
413	0.84
414	0.86
415	0.81
416	0.8
417	0.73
418	0.68
419	0.65
420	0.56
421	0.45
422	0.35
423	0.32
424	0.3
425	0.28
426	0.26
427	0.22
428	0.28
429	0.36
430	0.38
431	0.39
432	0.39
433	0.41
434	0.41
435	0.41
436	0.34
437	0.27
438	0.25
439	0.23
440	0.2
441	0.18
442	0.14
443	0.1
444	0.09
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.13
453	0.18
454	0.22
455	0.29
456	0.31
457	0.34
458	0.42
459	0.5
460	0.49
461	0.54
462	0.6
463	0.63
464	0.68
465	0.7
466	0.68
467	0.68
468	0.64
469	0.56
470	0.48
471	0.43
472	0.38
473	0.31
474	0.27
475	0.23
476	0.21
477	0.2
478	0.22
479	0.2
480	0.22
481	0.22
482	0.23
483	0.22
484	0.24
485	0.26
486	0.24
487	0.21
488	0.23
489	0.3
490	0.28
491	0.25
492	0.26
493	0.28
494	0.29
495	0.28
496	0.25
497	0.19
498	0.19
499	0.2
500	0.17
501	0.12
502	0.11
503	0.12
504	0.12
505	0.13
506	0.12
507	0.11
508	0.12
509	0.11
510	0.13
511	0.14
512	0.14
513	0.15
514	0.16
515	0.16
516	0.19
517	0.19
518	0.17
519	0.19
520	0.21
521	0.2
522	0.24
523	0.3
524	0.28
525	0.32
526	0.41
527	0.45
528	0.44
529	0.52
530	0.5
531	0.53
532	0.56
533	0.55
534	0.53
535	0.51
536	0.53
537	0.5
538	0.5
539	0.46
540	0.48
541	0.54
542	0.54
543	0.58
544	0.64
545	0.63
546	0.68
547	0.69

R7YU00

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer