Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R7YIR7

Protein Details
Accession R7YIR7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-355LPPPRRALPFANKKPQNQPAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-248QPKEAPKGRRAGPSRTSKRKAKGKA
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11, cyto 8, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MSDQHVVHVRRTDAEGSFVLVNVARNGALPLDVRLVGTEGENPYVGSVRQSQINQLRAHNYQGSEDEWKTVLEKCLLHKPAIGDYAAVLEGLEMVASVGEDNQITLTLRKNISGITQRLGAISLRLEEDEAIELFNWTAAAAQSASRVRDEVADLRVQLNAQQDTVNKLNAQLQDLIQAKQDHENALLEKFKDLLNAKKLKIRDQQRLLARAKTGPPAVAEAQQPKEAPKGRRAGPSRTSKRKAKGKASAVVSKSEDDKMRMDEEHTEEAREEEEAMPEAVTPDRTETETEDEDGFAAPPASQPSQSATAGVGSKGKAIEVAVTKEMEQATPELPPPRRALPFANKKPQNQPAKAAGSAPQAAIADDEETDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.27
3 0.25
4 0.23
5 0.21
6 0.18
7 0.15
8 0.16
9 0.13
10 0.13
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.1
15 0.11
16 0.1
17 0.11
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.15
26 0.13
27 0.15
28 0.15
29 0.14
30 0.14
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.16
35 0.16
36 0.22
37 0.22
38 0.3
39 0.36
40 0.43
41 0.43
42 0.42
43 0.46
44 0.43
45 0.47
46 0.42
47 0.35
48 0.31
49 0.3
50 0.29
51 0.29
52 0.27
53 0.24
54 0.21
55 0.21
56 0.2
57 0.21
58 0.21
59 0.19
60 0.21
61 0.23
62 0.32
63 0.34
64 0.33
65 0.33
66 0.32
67 0.31
68 0.31
69 0.27
70 0.18
71 0.16
72 0.16
73 0.14
74 0.12
75 0.07
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.02
81 0.02
82 0.02
83 0.02
84 0.03
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.06
92 0.07
93 0.1
94 0.15
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.17
99 0.21
100 0.27
101 0.26
102 0.23
103 0.24
104 0.24
105 0.24
106 0.24
107 0.19
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.08
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.14
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.17
152 0.19
153 0.17
154 0.13
155 0.14
156 0.17
157 0.17
158 0.18
159 0.15
160 0.14
161 0.19
162 0.2
163 0.2
164 0.18
165 0.18
166 0.17
167 0.2
168 0.2
169 0.15
170 0.14
171 0.15
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.11
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.13
180 0.14
181 0.17
182 0.24
183 0.29
184 0.3
185 0.33
186 0.34
187 0.38
188 0.44
189 0.47
190 0.48
191 0.49
192 0.54
193 0.55
194 0.62
195 0.56
196 0.5
197 0.44
198 0.38
199 0.34
200 0.31
201 0.26
202 0.2
203 0.18
204 0.18
205 0.18
206 0.18
207 0.19
208 0.2
209 0.21
210 0.22
211 0.22
212 0.2
213 0.25
214 0.29
215 0.29
216 0.32
217 0.37
218 0.4
219 0.48
220 0.52
221 0.53
222 0.54
223 0.62
224 0.65
225 0.69
226 0.72
227 0.71
228 0.76
229 0.78
230 0.78
231 0.77
232 0.76
233 0.73
234 0.72
235 0.7
236 0.68
237 0.6
238 0.55
239 0.47
240 0.39
241 0.34
242 0.31
243 0.27
244 0.22
245 0.23
246 0.21
247 0.22
248 0.21
249 0.21
250 0.21
251 0.24
252 0.28
253 0.26
254 0.24
255 0.22
256 0.22
257 0.21
258 0.17
259 0.14
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.19
276 0.2
277 0.21
278 0.19
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.14
283 0.09
284 0.08
285 0.06
286 0.07
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.17
292 0.21
293 0.21
294 0.2
295 0.16
296 0.18
297 0.19
298 0.19
299 0.17
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.14
304 0.12
305 0.11
306 0.15
307 0.16
308 0.2
309 0.2
310 0.2
311 0.21
312 0.23
313 0.23
314 0.19
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.18
320 0.23
321 0.26
322 0.3
323 0.33
324 0.38
325 0.41
326 0.42
327 0.47
328 0.5
329 0.58
330 0.64
331 0.71
332 0.71
333 0.74
334 0.8
335 0.81
336 0.81
337 0.74
338 0.71
339 0.69
340 0.67
341 0.62
342 0.54
343 0.49
344 0.44
345 0.41
346 0.34
347 0.28
348 0.22
349 0.21
350 0.2
351 0.17
352 0.12
353 0.1
354 0.11