Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DB40

Protein Details
Accession B0DB40    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-172HDSKNVPTGKKRKSKRKHTILSTSAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
155-164GKKRKSKRKH
181-189QRKAAAPKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008895  Vps72/YL1  
IPR013272  Vps72/YL1_C  
IPR046757  YL1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140849  F:ATP-dependent H2AZ histone chaperone activity  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_297882  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05764  YL1  
PF08265  YL1_C  
Amino Acid Sequences MDEEPIEFLVARRSRRSTAGNRMEAALAEMALDDADKDLEDDKEFVDDKEEQDVFGSDFESTDEEAEQQGVDAGETMIQEEEQRARRTARSRVEKATAIAHERQKATFNPQAEASASVIKHKAKVRSQRQVSLRDATDTADGETVEHDSKNVPTGKKRKSKRKHTILSTSAAVARQKESEQRKAAAPKKIKNITRTLTQAELIARALDNEEGNIVEHRDYLKVEEEKRKRARVVRATVHGPLLRWVSKVEEIEVVEEAPAPVPTFAGTASSIYGTGLAPYQGLPWIASTSTTNAMASAAPPQFPGSPFPAWPPFPSFPQSTPLLAPPTLPTQPATLPEPRKRTEKVAKNYLIHELAQYTDAPKATWNDTMKAMFGDHVKWDELKVYTTKGRPLSRPIQSCPITGKPAIYFDPRTGVPFADVAAFDVLTRLLAHEYVWSPELGCYTGKEEPPPEQEEVGDADRVRKTRSTVMIAEGED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.46
3 0.55
4 0.55
5 0.61
6 0.67
7 0.65
8 0.61
9 0.6
10 0.54
11 0.45
12 0.37
13 0.27
14 0.16
15 0.11
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.04
21 0.04
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.08
26 0.1
27 0.11
28 0.12
29 0.12
30 0.16
31 0.17
32 0.16
33 0.19
34 0.19
35 0.19
36 0.26
37 0.25
38 0.21
39 0.22
40 0.23
41 0.19
42 0.17
43 0.16
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.07
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.09
68 0.16
69 0.21
70 0.24
71 0.26
72 0.29
73 0.36
74 0.42
75 0.49
76 0.53
77 0.56
78 0.59
79 0.63
80 0.65
81 0.6
82 0.55
83 0.52
84 0.45
85 0.4
86 0.41
87 0.4
88 0.41
89 0.4
90 0.39
91 0.37
92 0.36
93 0.39
94 0.37
95 0.34
96 0.3
97 0.29
98 0.29
99 0.26
100 0.25
101 0.19
102 0.19
103 0.17
104 0.18
105 0.21
106 0.21
107 0.26
108 0.3
109 0.36
110 0.4
111 0.51
112 0.58
113 0.65
114 0.69
115 0.72
116 0.73
117 0.72
118 0.68
119 0.63
120 0.54
121 0.45
122 0.4
123 0.33
124 0.28
125 0.22
126 0.18
127 0.13
128 0.12
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.16
138 0.2
139 0.21
140 0.29
141 0.39
142 0.48
143 0.56
144 0.66
145 0.71
146 0.77
147 0.85
148 0.87
149 0.89
150 0.88
151 0.88
152 0.88
153 0.8
154 0.73
155 0.63
156 0.53
157 0.43
158 0.35
159 0.28
160 0.2
161 0.17
162 0.15
163 0.16
164 0.23
165 0.27
166 0.33
167 0.35
168 0.36
169 0.4
170 0.47
171 0.52
172 0.53
173 0.54
174 0.53
175 0.59
176 0.65
177 0.64
178 0.6
179 0.61
180 0.55
181 0.52
182 0.49
183 0.42
184 0.36
185 0.31
186 0.28
187 0.21
188 0.19
189 0.14
190 0.11
191 0.09
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.13
209 0.17
210 0.21
211 0.3
212 0.34
213 0.43
214 0.48
215 0.51
216 0.5
217 0.53
218 0.58
219 0.57
220 0.61
221 0.56
222 0.54
223 0.52
224 0.49
225 0.44
226 0.36
227 0.27
228 0.21
229 0.19
230 0.16
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.12
241 0.1
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.17
295 0.2
296 0.24
297 0.24
298 0.25
299 0.28
300 0.26
301 0.27
302 0.31
303 0.3
304 0.26
305 0.29
306 0.29
307 0.24
308 0.23
309 0.23
310 0.22
311 0.2
312 0.19
313 0.17
314 0.19
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.16
319 0.17
320 0.19
321 0.21
322 0.24
323 0.31
324 0.38
325 0.44
326 0.45
327 0.5
328 0.5
329 0.56
330 0.58
331 0.6
332 0.62
333 0.66
334 0.69
335 0.66
336 0.65
337 0.6
338 0.52
339 0.42
340 0.34
341 0.24
342 0.18
343 0.17
344 0.15
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.13
350 0.15
351 0.17
352 0.23
353 0.25
354 0.24
355 0.27
356 0.28
357 0.26
358 0.23
359 0.21
360 0.16
361 0.16
362 0.15
363 0.14
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.18
369 0.17
370 0.19
371 0.18
372 0.21
373 0.26
374 0.28
375 0.34
376 0.38
377 0.43
378 0.43
379 0.5
380 0.55
381 0.57
382 0.6
383 0.59
384 0.61
385 0.57
386 0.55
387 0.53
388 0.49
389 0.44
390 0.39
391 0.37
392 0.29
393 0.31
394 0.33
395 0.32
396 0.3
397 0.27
398 0.3
399 0.28
400 0.29
401 0.27
402 0.24
403 0.2
404 0.18
405 0.17
406 0.14
407 0.14
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.12
421 0.14
422 0.16
423 0.17
424 0.16
425 0.15
426 0.16
427 0.18
428 0.15
429 0.14
430 0.13
431 0.17
432 0.23
433 0.24
434 0.27
435 0.29
436 0.34
437 0.39
438 0.42
439 0.4
440 0.35
441 0.33
442 0.3
443 0.32
444 0.28
445 0.25
446 0.21
447 0.24
448 0.28
449 0.3
450 0.31
451 0.31
452 0.33
453 0.39
454 0.45
455 0.46
456 0.44
457 0.47