Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YX46

Protein Details
Accession R7YX46    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
427-455ATWKAGKRGTYYRKRRRWERVKRVVDETRBasic
611-633EGKVEARGKFSKKRKVEPTNGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
434-435RG
437-448YYRKRRRWERVK
618-625GKFSKKRK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, mito 8, cyto_nucl 8, nucl 4.5, plas 1, extr 1, pero 1, E.R. 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDNSSAIHSYVRPNTHIVLRLPSGLSKIVEIQPNTTISIGKFGAFSANLLLGRPYYLTFELSDPEDGVLSTELRVVSPTELHAEALSSNHATPAESRAEAADDTGGVEFDIVGENGDVLMRSNRLTVDDPTRQALSMEEIEELKRAGSGSGKDIVAKIMASHQALGEKTSFSLAKYTLRKTKKYMKRFTVLPLDVSMLAQILLEREAPRIMELREEMLGLISAWANVHYSGDSRDSTNGSGVGRVGGGRWLVVDDTGGLVVAALAEKMGILYPEEADEEETLPEQETTTESHPSQARPVEPALSADAQSPPPPSSDQAMPDAPPTSHPLSTSDPTPFSPSHTRRPHPTNAPPAMSAPTNTLTLLHTHAQPNLSLLRYFSYDASLTHPPTTTHPLHTHLKTLSWLQLLHPSSDAAYTEPLLVPEAELATWKAGKRGTYYRKRRRWERVKRVVDETRAGGFDGLVVASLLDPVGVLRACVPLLRGAGQVVVYSATVEPLVRVMDLYSRERRTAWVVRQQQQGQQQGRGAAGESGGVGDEKKVKREAVNGTEDVEAEEADEDFPVNPTLLLSPMLQTARVRSWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYLFTATRVFPVEGKVEARGKFSKKRKVEPTNGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.4
3 0.44
4 0.39
5 0.38
6 0.36
7 0.37
8 0.35
9 0.33
10 0.3
11 0.27
12 0.25
13 0.2
14 0.24
15 0.26
16 0.31
17 0.3
18 0.31
19 0.31
20 0.32
21 0.32
22 0.27
23 0.24
24 0.18
25 0.22
26 0.2
27 0.17
28 0.16
29 0.15
30 0.18
31 0.16
32 0.16
33 0.13
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.16
46 0.17
47 0.18
48 0.19
49 0.2
50 0.16
51 0.15
52 0.14
53 0.12
54 0.12
55 0.11
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.14
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.16
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.18
86 0.17
87 0.16
88 0.12
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.14
112 0.17
113 0.2
114 0.26
115 0.3
116 0.32
117 0.33
118 0.33
119 0.3
120 0.28
121 0.24
122 0.2
123 0.17
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.15
129 0.14
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.11
135 0.12
136 0.14
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.15
143 0.14
144 0.11
145 0.11
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.16
151 0.16
152 0.17
153 0.14
154 0.12
155 0.12
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.2
162 0.25
163 0.31
164 0.37
165 0.43
166 0.47
167 0.51
168 0.61
169 0.63
170 0.69
171 0.73
172 0.71
173 0.7
174 0.69
175 0.68
176 0.67
177 0.58
178 0.49
179 0.4
180 0.33
181 0.28
182 0.25
183 0.19
184 0.09
185 0.08
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.05
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.08
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.15
279 0.17
280 0.17
281 0.2
282 0.2
283 0.19
284 0.19
285 0.19
286 0.17
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.12
291 0.12
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.14
303 0.14
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.12
310 0.12
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.16
316 0.19
317 0.21
318 0.21
319 0.19
320 0.18
321 0.18
322 0.21
323 0.17
324 0.18
325 0.27
326 0.29
327 0.38
328 0.44
329 0.46
330 0.5
331 0.56
332 0.58
333 0.56
334 0.59
335 0.59
336 0.55
337 0.53
338 0.47
339 0.42
340 0.37
341 0.29
342 0.22
343 0.15
344 0.13
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.11
350 0.13
351 0.12
352 0.14
353 0.14
354 0.16
355 0.16
356 0.15
357 0.16
358 0.15
359 0.14
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.13
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.15
370 0.17
371 0.17
372 0.17
373 0.18
374 0.17
375 0.2
376 0.26
377 0.23
378 0.24
379 0.25
380 0.29
381 0.35
382 0.35
383 0.36
384 0.3
385 0.29
386 0.26
387 0.26
388 0.24
389 0.19
390 0.18
391 0.15
392 0.22
393 0.22
394 0.21
395 0.2
396 0.16
397 0.15
398 0.16
399 0.15
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.09
416 0.09
417 0.12
418 0.13
419 0.15
420 0.19
421 0.29
422 0.38
423 0.47
424 0.58
425 0.66
426 0.74
427 0.82
428 0.87
429 0.88
430 0.89
431 0.9
432 0.9
433 0.9
434 0.9
435 0.85
436 0.83
437 0.78
438 0.71
439 0.62
440 0.53
441 0.44
442 0.35
443 0.3
444 0.22
445 0.16
446 0.12
447 0.09
448 0.07
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.11
468 0.12
469 0.12
470 0.11
471 0.12
472 0.12
473 0.11
474 0.09
475 0.08
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.1
489 0.14
490 0.2
491 0.26
492 0.29
493 0.3
494 0.31
495 0.33
496 0.36
497 0.41
498 0.43
499 0.45
500 0.52
501 0.58
502 0.66
503 0.67
504 0.65
505 0.65
506 0.66
507 0.6
508 0.55
509 0.5
510 0.43
511 0.4
512 0.34
513 0.27
514 0.18
515 0.14
516 0.11
517 0.08
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.07
523 0.15
524 0.17
525 0.21
526 0.24
527 0.26
528 0.29
529 0.36
530 0.43
531 0.42
532 0.46
533 0.43
534 0.42
535 0.4
536 0.37
537 0.31
538 0.22
539 0.15
540 0.09
541 0.09
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.07
551 0.08
552 0.09
553 0.09
554 0.11
555 0.1
556 0.1
557 0.15
558 0.15
559 0.17
560 0.17
561 0.2
562 0.23
563 0.27
564 0.28
565 0.27
566 0.31
567 0.36
568 0.42
569 0.44
570 0.43
571 0.45
572 0.51
573 0.48
574 0.45
575 0.4
576 0.38
577 0.35
578 0.33
579 0.32
580 0.24
581 0.25
582 0.24
583 0.22
584 0.18
585 0.14
586 0.13
587 0.1
588 0.1
589 0.08
590 0.11
591 0.11
592 0.12
593 0.15
594 0.15
595 0.14
596 0.18
597 0.2
598 0.21
599 0.23
600 0.27
601 0.3
602 0.31
603 0.35
604 0.39
605 0.44
606 0.51
607 0.6
608 0.64
609 0.67
610 0.76
611 0.81
612 0.84
613 0.87