Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YUA8

Protein Details
Accession R7YUA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
737-764EMDAKRAKTRAARERRQQRVEEKRQATVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
637-662HSRARARALTAARRIGRHRGFGKRKG
719-755EHIHRAKAEKQRERIIKEEMDAKRAKTRAARERRQQR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035970  60S_ribosomal_L19/L19e_sf  
IPR047192  Euk_RPA1_DBD_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR004365  NA-bd_OB_tRNA  
IPR013955  Rep_factor-A_C  
IPR007199  Rep_factor-A_N  
IPR031657  REPA_OB_2  
IPR004591  Rfa1  
IPR000196  Ribosomal_L19/L19e  
IPR015972  Ribosomal_L19/L19e_dom1  
IPR033935  Ribosomal_L19_euka  
IPR039547  RPL19  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04057  Rep-A_N  
PF08646  Rep_fac-A_C  
PF16900  REPA_OB_2  
PF01280  Ribosomal_L19e  
PF01336  tRNA_anti-codon  
CDD cd01417  Ribosomal_L19e_E  
cd04474  RPA1_DBD_A  
cd04475  RPA1_DBD_B  
cd04476  RPA1_DBD_C  
cd04477  RPA1N  
Amino Acid Sequences MSAEAASHITQGALRAVFEQGREAVGEPVVQAVQIKPLEAKGDGPERYRVVFSDMQNFVQSMIAEKYSSVVSDGTLKRGAIVRLIQYTPNVIKGKKILIVGEVQVLSELGEHEKLGNPKGLEAAPEQEQQNAQPGSISGDGFYGAKPQQQQLQPQRQNLPSRTNVSADSSANHGNIYPIEALSPYSHKWTIKARVTYKSPIKTWHKQSSEGKLFSVNLLDESGEIKMTGFNAECDAWYNVLQEGSVYYISSPCKVNMAKKQFSNLNNDYELALERDTVIEAAPDQSSVPQVRFNFTTIGDLESVEKNTTIDTIGVLQQVGEVSEIVSKTTSKPYAKRELTLVDNTNHSVRLTIWGDTAHSFDAPEGSAIAFKGVKVSDFGGRSLSLLSSGSMTIDPDIDEAHKLKGWYDAQGRQDTFQSFQNMGASLGGGGNSSKTIQEVKDENLGMNEEKPDYFNLKATVVFIKQDNIAYPACLSPDCNKKVVEVDPGQWRCEKCDKTHPRPQYRYMMSINVSDHTGQMWLSAFDDHGRLLLGMDADQIMAWKEEENKQALDDAFQAANCKTYVFRCRAKMDNFQDQQRVNLTTQKRLAASVAGCGKRKIWMDPNESNELSNANSRNTIRKLLKDGLIIKKPVTMHSRARARALTAARRIGRHRGFGKRKGTADARMPSQVLWMRHQRVLRRLLVKYRASGKIDKHLYHELYALSKGNTFKHKRALVEHIHRAKAEKQRERIIKEEMDAKRAKTRAARERRQQRVEEKRQATVAEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.17
4 0.18
5 0.18
6 0.19
7 0.16
8 0.16
9 0.17
10 0.17
11 0.15
12 0.14
13 0.14
14 0.11
15 0.12
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.09
20 0.16
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.18
25 0.2
26 0.2
27 0.21
28 0.21
29 0.28
30 0.31
31 0.32
32 0.36
33 0.36
34 0.38
35 0.36
36 0.31
37 0.3
38 0.33
39 0.33
40 0.37
41 0.37
42 0.36
43 0.36
44 0.35
45 0.29
46 0.24
47 0.22
48 0.16
49 0.16
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.13
55 0.14
56 0.11
57 0.09
58 0.09
59 0.18
60 0.19
61 0.22
62 0.23
63 0.23
64 0.24
65 0.28
66 0.28
67 0.23
68 0.26
69 0.26
70 0.29
71 0.31
72 0.3
73 0.27
74 0.32
75 0.28
76 0.33
77 0.33
78 0.28
79 0.31
80 0.33
81 0.36
82 0.34
83 0.35
84 0.28
85 0.26
86 0.29
87 0.26
88 0.26
89 0.22
90 0.18
91 0.16
92 0.15
93 0.12
94 0.1
95 0.1
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.14
101 0.17
102 0.19
103 0.23
104 0.21
105 0.21
106 0.24
107 0.23
108 0.21
109 0.2
110 0.21
111 0.2
112 0.24
113 0.24
114 0.23
115 0.23
116 0.22
117 0.28
118 0.25
119 0.21
120 0.17
121 0.17
122 0.19
123 0.2
124 0.19
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.15
133 0.17
134 0.19
135 0.26
136 0.3
137 0.4
138 0.46
139 0.57
140 0.6
141 0.64
142 0.69
143 0.68
144 0.72
145 0.66
146 0.63
147 0.58
148 0.56
149 0.52
150 0.47
151 0.41
152 0.38
153 0.36
154 0.3
155 0.25
156 0.23
157 0.23
158 0.21
159 0.2
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.13
171 0.12
172 0.16
173 0.2
174 0.2
175 0.23
176 0.31
177 0.38
178 0.44
179 0.51
180 0.51
181 0.55
182 0.59
183 0.64
184 0.64
185 0.61
186 0.55
187 0.56
188 0.6
189 0.62
190 0.66
191 0.68
192 0.63
193 0.65
194 0.69
195 0.71
196 0.7
197 0.62
198 0.53
199 0.46
200 0.43
201 0.35
202 0.3
203 0.2
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.09
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.17
241 0.19
242 0.26
243 0.33
244 0.41
245 0.44
246 0.44
247 0.49
248 0.5
249 0.51
250 0.53
251 0.47
252 0.41
253 0.37
254 0.37
255 0.31
256 0.25
257 0.23
258 0.15
259 0.12
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.14
277 0.14
278 0.17
279 0.18
280 0.19
281 0.18
282 0.17
283 0.18
284 0.14
285 0.15
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.13
317 0.18
318 0.2
319 0.25
320 0.32
321 0.42
322 0.43
323 0.42
324 0.4
325 0.38
326 0.38
327 0.37
328 0.33
329 0.24
330 0.23
331 0.23
332 0.22
333 0.19
334 0.15
335 0.11
336 0.09
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.09
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.05
355 0.04
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.08
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.1
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.14
393 0.14
394 0.18
395 0.21
396 0.25
397 0.28
398 0.32
399 0.32
400 0.27
401 0.29
402 0.25
403 0.23
404 0.21
405 0.2
406 0.16
407 0.17
408 0.17
409 0.15
410 0.14
411 0.12
412 0.09
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.04
422 0.05
423 0.07
424 0.07
425 0.12
426 0.13
427 0.15
428 0.19
429 0.19
430 0.18
431 0.17
432 0.18
433 0.15
434 0.13
435 0.13
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.14
445 0.14
446 0.15
447 0.15
448 0.13
449 0.14
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.13
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.14
464 0.23
465 0.25
466 0.27
467 0.27
468 0.27
469 0.3
470 0.3
471 0.31
472 0.24
473 0.27
474 0.34
475 0.35
476 0.35
477 0.35
478 0.34
479 0.32
480 0.39
481 0.37
482 0.33
483 0.43
484 0.52
485 0.57
486 0.66
487 0.71
488 0.72
489 0.75
490 0.77
491 0.75
492 0.68
493 0.64
494 0.57
495 0.51
496 0.42
497 0.39
498 0.34
499 0.25
500 0.23
501 0.18
502 0.16
503 0.12
504 0.11
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.06
518 0.06
519 0.07
520 0.06
521 0.05
522 0.06
523 0.06
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.1
532 0.15
533 0.19
534 0.21
535 0.2
536 0.2
537 0.23
538 0.22
539 0.2
540 0.16
541 0.15
542 0.13
543 0.13
544 0.15
545 0.12
546 0.13
547 0.12
548 0.12
549 0.11
550 0.15
551 0.22
552 0.27
553 0.33
554 0.37
555 0.42
556 0.49
557 0.53
558 0.58
559 0.58
560 0.62
561 0.6
562 0.59
563 0.6
564 0.53
565 0.5
566 0.43
567 0.39
568 0.3
569 0.34
570 0.32
571 0.33
572 0.36
573 0.36
574 0.33
575 0.31
576 0.3
577 0.27
578 0.24
579 0.23
580 0.28
581 0.28
582 0.29
583 0.29
584 0.29
585 0.3
586 0.32
587 0.33
588 0.34
589 0.39
590 0.46
591 0.52
592 0.57
593 0.57
594 0.56
595 0.5
596 0.41
597 0.33
598 0.26
599 0.25
600 0.22
601 0.17
602 0.21
603 0.23
604 0.3
605 0.32
606 0.39
607 0.38
608 0.41
609 0.47
610 0.47
611 0.49
612 0.48
613 0.52
614 0.52
615 0.54
616 0.5
617 0.44
618 0.42
619 0.4
620 0.4
621 0.38
622 0.36
623 0.37
624 0.45
625 0.53
626 0.52
627 0.55
628 0.51
629 0.47
630 0.49
631 0.48
632 0.47
633 0.44
634 0.5
635 0.48
636 0.51
637 0.52
638 0.55
639 0.53
640 0.53
641 0.55
642 0.58
643 0.64
644 0.69
645 0.74
646 0.71
647 0.69
648 0.68
649 0.65
650 0.61
651 0.6
652 0.57
653 0.51
654 0.47
655 0.45
656 0.38
657 0.4
658 0.38
659 0.32
660 0.34
661 0.4
662 0.41
663 0.45
664 0.5
665 0.5
666 0.53
667 0.58
668 0.59
669 0.57
670 0.58
671 0.62
672 0.66
673 0.63
674 0.61
675 0.61
676 0.6
677 0.58
678 0.58
679 0.54
680 0.55
681 0.59
682 0.55
683 0.53
684 0.54
685 0.52
686 0.47
687 0.44
688 0.36
689 0.31
690 0.31
691 0.28
692 0.2
693 0.22
694 0.23
695 0.27
696 0.36
697 0.4
698 0.43
699 0.51
700 0.55
701 0.55
702 0.59
703 0.62
704 0.63
705 0.66
706 0.7
707 0.68
708 0.66
709 0.63
710 0.6
711 0.59
712 0.58
713 0.6
714 0.58
715 0.59
716 0.66
717 0.73
718 0.75
719 0.72
720 0.7
721 0.63
722 0.57
723 0.59
724 0.51
725 0.5
726 0.48
727 0.46
728 0.47
729 0.45
730 0.47
731 0.46
732 0.54
733 0.57
734 0.64
735 0.71
736 0.74
737 0.83
738 0.88
739 0.88
740 0.86
741 0.86
742 0.87
743 0.87
744 0.87
745 0.81
746 0.75
747 0.69