FuNGI

Q59Y36

Protein Details

Accession

Q59Y36

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
188-207	LKNIKHPKKKHLRAVNTWPL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0003682 F:chromatin binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	cal:CAALFM_C208630CA -
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSNKSSKPIRQDYIAKVRYTNNLPPPPLNPKFIEYNTTDPISTQQEGEYLISSLFRKENFQNLMERIDDQLGLDLNLINNRGFLSEDKMNESVGKLKYNQLHPNDRALLRDAGIGKISKNEPEVSFLRRTEYISDRPLSKGGNNLNTATEEIKVKEKLSKDEHFDADSQLQNVEESFTVANESLYDLKNIKHPKKKHLRAVNTWPLLPDTSMLDNVFLNLRFMGSASINRELNNLKQQQQQQQQQNDKKFDEKLFDRALESSLFKPIKSEGGEWISMYSLDATNTSTTANDNDNEEQINDLYEKLHSTKKEQPINLLDEDEESLETYKFKYTKNYDMTYQPFEHENEELAIKFVSDEIEDPVSKDNFKRKRKMAYYYPINGKIELKKHRASTNSEINKFIKERTYDGINFILREPSTNELKRSDTIRSEYDPMEYEGEDEEEEEEEEEEEQQEEEQQQQEVETKEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.74
2	0.72
3	0.63
4	0.57
5	0.57
6	0.57
7	0.55
8	0.55
9	0.54
10	0.55
11	0.57
12	0.57
13	0.59
14	0.61
15	0.59
16	0.55
17	0.48
18	0.44
19	0.48
20	0.47
21	0.47
22	0.41
23	0.42
24	0.41
25	0.4
26	0.36
27	0.29
28	0.31
29	0.31
30	0.28
31	0.23
32	0.19
33	0.18
34	0.2
35	0.2
36	0.17
37	0.12
38	0.11
39	0.13
40	0.13
41	0.15
42	0.16
43	0.16
44	0.2
45	0.23
46	0.31
47	0.34
48	0.35
49	0.38
50	0.38
51	0.4
52	0.36
53	0.34
54	0.27
55	0.24
56	0.21
57	0.15
58	0.15
59	0.13
60	0.12
61	0.11
62	0.1
63	0.1
64	0.12
65	0.13
66	0.11
67	0.11
68	0.11
69	0.11
70	0.11
71	0.11
72	0.16
73	0.19
74	0.2
75	0.24
76	0.24
77	0.24
78	0.24
79	0.23
80	0.24
81	0.22
82	0.24
83	0.22
84	0.27
85	0.33
86	0.4
87	0.47
88	0.47
89	0.54
90	0.53
91	0.58
92	0.58
93	0.52
94	0.47
95	0.42
96	0.36
97	0.28
98	0.29
99	0.23
100	0.18
101	0.2
102	0.18
103	0.15
104	0.19
105	0.19
106	0.18
107	0.19
108	0.22
109	0.2
110	0.25
111	0.27
112	0.27
113	0.3
114	0.28
115	0.29
116	0.27
117	0.28
118	0.28
119	0.31
120	0.31
121	0.32
122	0.34
123	0.32
124	0.32
125	0.33
126	0.29
127	0.25
128	0.27
129	0.27
130	0.3
131	0.31
132	0.3
133	0.29
134	0.28
135	0.28
136	0.22
137	0.18
138	0.13
139	0.13
140	0.17
141	0.17
142	0.17
143	0.21
144	0.23
145	0.28
146	0.34
147	0.37
148	0.39
149	0.42
150	0.43
151	0.39
152	0.38
153	0.33
154	0.3
155	0.26
156	0.2
157	0.16
158	0.14
159	0.12
160	0.11
161	0.1
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.06
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.06
170	0.07
171	0.08
172	0.08
173	0.1
174	0.1
175	0.11
176	0.17
177	0.26
178	0.33
179	0.39
180	0.44
181	0.53
182	0.63
183	0.72
184	0.75
185	0.76
186	0.76
187	0.75
188	0.8
189	0.79
190	0.69
191	0.6
192	0.51
193	0.42
194	0.34
195	0.27
196	0.17
197	0.1
198	0.09
199	0.1
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.06
213	0.08
214	0.1
215	0.13
216	0.14
217	0.14
218	0.16
219	0.15
220	0.17
221	0.23
222	0.23
223	0.24
224	0.29
225	0.34
226	0.41
227	0.48
228	0.53
229	0.53
230	0.58
231	0.64
232	0.66
233	0.67
234	0.63
235	0.56
236	0.51
237	0.47
238	0.4
239	0.37
240	0.31
241	0.31
242	0.28
243	0.28
244	0.25
245	0.23
246	0.22
247	0.18
248	0.18
249	0.13
250	0.18
251	0.18
252	0.17
253	0.17
254	0.17
255	0.2
256	0.19
257	0.2
258	0.16
259	0.19
260	0.19
261	0.19
262	0.18
263	0.14
264	0.12
265	0.11
266	0.08
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.09
277	0.1
278	0.1
279	0.13
280	0.14
281	0.14
282	0.14
283	0.14
284	0.12
285	0.11
286	0.11
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.09
292	0.1
293	0.15
294	0.15
295	0.21
296	0.29
297	0.38
298	0.44
299	0.44
300	0.47
301	0.48
302	0.51
303	0.46
304	0.38
305	0.29
306	0.23
307	0.23
308	0.17
309	0.12
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.12
316	0.14
317	0.16
318	0.24
319	0.29
320	0.38
321	0.44
322	0.46
323	0.45
324	0.49
325	0.52
326	0.49
327	0.44
328	0.37
329	0.32
330	0.31
331	0.3
332	0.24
333	0.2
334	0.16
335	0.16
336	0.14
337	0.12
338	0.11
339	0.09
340	0.08
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.07
345	0.09
346	0.12
347	0.12
348	0.13
349	0.17
350	0.18
351	0.19
352	0.23
353	0.3
354	0.37
355	0.47
356	0.55
357	0.58
358	0.68
359	0.73
360	0.78
361	0.78
362	0.78
363	0.78
364	0.77
365	0.78
366	0.73
367	0.67
368	0.6
369	0.55
370	0.51
371	0.5
372	0.51
373	0.5
374	0.49
375	0.53
376	0.57
377	0.57
378	0.58
379	0.58
380	0.6
381	0.63
382	0.6
383	0.6
384	0.55
385	0.56
386	0.5
387	0.44
388	0.4
389	0.33
390	0.34
391	0.34
392	0.4
393	0.35
394	0.37
395	0.39
396	0.34
397	0.32
398	0.3
399	0.3
400	0.23
401	0.24
402	0.23
403	0.23
404	0.3
405	0.33
406	0.35
407	0.34
408	0.37
409	0.39
410	0.39
411	0.41
412	0.38
413	0.39
414	0.41
415	0.42
416	0.43
417	0.4
418	0.39
419	0.35
420	0.31
421	0.29
422	0.24
423	0.21
424	0.17
425	0.18
426	0.15
427	0.13
428	0.12
429	0.1
430	0.11
431	0.1
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.1
437	0.09
438	0.09
439	0.09
440	0.12
441	0.12
442	0.16
443	0.17
444	0.17
445	0.17
446	0.18
447	0.23

Q59Y36

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer