FuNGI

R7YMB0

Protein Details

Accession

R7YMB0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
203-223	LESPEGKRRPNPRTARRNVYV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto 8, mito_nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MSSPSRRTADSTDSPSPSHLPRSQFPFPQNDWSRRPSASSRYDPVRRPSTASSVSSIGGSLDTSMQAHGRNRAVAETAQNAISSLLLPPITRTGMLPQTSTTAPSSHRPPSTKDIPPVTLTNIPHVEPSAFKPYLTQVGRLFEAFQRAKDESNNWPPQLSRRDSERPNQEDERLQLLGAGVPHQSLSAPPTPRLGSLAALPPLESPEGKRRPNPRTARRNVYVPTPLTTIPHIFFEDHFHLENPRTFDVVSERSEVVRQEDIKGANGSVSSPGPSGRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLISSISSASTSFFAALGSLKELQSEAAESVARIKELREDLRNLDQEMAVGGLKIIGMKRRRQNLRALGQATTQVQEVVDGATHCEELVDSGELETALERMDILDSFVGGSLDPARFQHAPWLSEDTPRRLLDLRTLKALDGFSDGMRQLRFRIGKGFELRFLEALLADLRRHVQSVSNQETLKRWASASQRSRGDHSQSPSVFPSYLKTDDKLRSELSTTLKGLSRSSHTRPAAAAFREAIMREMKNVIRQHLPSSSEDDAESVSSVSTKASRAQSQQDKSAILARNLRALSTEDAERLLVQMYSNVGEALRRLSTQVKVLLDVTSGIGPPSTPGLRSPLKSPDATSIDGYMQQKITTRPRSSSQVQQELMEALDMSSLLGQAVDVAQSQITKILKVRTEQTVRLPLLHFLRYFTLNRLFADECEAVSGRSGTALKSVVNGQIADFVSILGDTEKQRLAQSMESDRWEARDFSDAENVLLSRILDSTTKDPSPWLRKAAVWEDPDGDKLNGETAASETNGAAKEKARSAVIDEEKYILVDSAVAALKGIEQFENLIAVIPSMASDVSTALLDYLKLFNSRTYQLILAAGATRSAGLKNINTKHLALASQALGFIVAIIPYIREFVRRHSPTSAAALAEFDKVKRLYQEHQSNIHEKLSDIMKGRAAAHISTMRKVDFDGGADVQVSPHMETLVKETSTLHRVMSKHLPEMSVRMIMTSVFESYREQWSKAFQEVEVRTPAGKARLLRDAEFFDARLGKVEGAGNIGAYLIDIVKNKKIAEASGLPAPVTNNQSDTKGRTSTDSSASRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.49
3	0.48
4	0.43
5	0.43
6	0.41
7	0.4
8	0.44
9	0.52
10	0.56
11	0.58
12	0.6
13	0.6
14	0.58
15	0.63
16	0.65
17	0.65
18	0.64
19	0.63
20	0.63
21	0.55
22	0.58
23	0.54
24	0.55
25	0.56
26	0.57
27	0.58
28	0.63
29	0.69
30	0.7
31	0.72
32	0.7
33	0.63
34	0.62
35	0.59
36	0.58
37	0.56
38	0.52
39	0.46
40	0.4
41	0.38
42	0.33
43	0.28
44	0.2
45	0.14
46	0.11
47	0.09
48	0.08
49	0.08
50	0.09
51	0.1
52	0.11
53	0.16
54	0.19
55	0.25
56	0.27
57	0.29
58	0.29
59	0.29
60	0.3
61	0.28
62	0.28
63	0.25
64	0.24
65	0.22
66	0.21
67	0.2
68	0.17
69	0.15
70	0.11
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.1
75	0.11
76	0.14
77	0.15
78	0.15
79	0.16
80	0.19
81	0.26
82	0.27
83	0.27
84	0.24
85	0.27
86	0.27
87	0.28
88	0.23
89	0.19
90	0.2
91	0.25
92	0.31
93	0.35
94	0.41
95	0.42
96	0.47
97	0.53
98	0.58
99	0.6
100	0.61
101	0.59
102	0.56
103	0.56
104	0.52
105	0.48
106	0.46
107	0.4
108	0.39
109	0.35
110	0.32
111	0.29
112	0.29
113	0.25
114	0.21
115	0.25
116	0.27
117	0.25
118	0.24
119	0.25
120	0.27
121	0.35
122	0.35
123	0.35
124	0.29
125	0.33
126	0.34
127	0.33
128	0.32
129	0.25
130	0.33
131	0.29
132	0.27
133	0.29
134	0.29
135	0.31
136	0.32
137	0.34
138	0.34
139	0.44
140	0.49
141	0.44
142	0.44
143	0.44
144	0.48
145	0.53
146	0.49
147	0.43
148	0.44
149	0.52
150	0.56
151	0.64
152	0.66
153	0.61
154	0.63
155	0.63
156	0.59
157	0.54
158	0.52
159	0.47
160	0.37
161	0.32
162	0.25
163	0.22
164	0.19
165	0.15
166	0.14
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.08
171	0.08
172	0.07
173	0.12
174	0.17
175	0.2
176	0.21
177	0.25
178	0.26
179	0.26
180	0.28
181	0.24
182	0.18
183	0.19
184	0.23
185	0.21
186	0.2
187	0.19
188	0.17
189	0.18
190	0.19
191	0.16
192	0.16
193	0.24
194	0.32
195	0.36
196	0.44
197	0.51
198	0.57
199	0.67
200	0.73
201	0.74
202	0.76
203	0.81
204	0.83
205	0.78
206	0.77
207	0.69
208	0.65
209	0.61
210	0.51
211	0.45
212	0.38
213	0.34
214	0.3
215	0.3
216	0.26
217	0.21
218	0.21
219	0.2
220	0.18
221	0.18
222	0.23
223	0.24
224	0.23
225	0.23
226	0.22
227	0.23
228	0.26
229	0.29
230	0.27
231	0.24
232	0.23
233	0.22
234	0.22
235	0.25
236	0.26
237	0.24
238	0.22
239	0.22
240	0.22
241	0.24
242	0.23
243	0.21
244	0.22
245	0.21
246	0.2
247	0.24
248	0.24
249	0.25
250	0.25
251	0.22
252	0.17
253	0.16
254	0.14
255	0.12
256	0.12
257	0.1
258	0.1
259	0.12
260	0.13
261	0.14
262	0.16
263	0.16
264	0.19
265	0.18
266	0.21
267	0.25
268	0.25
269	0.27
270	0.29
271	0.28
272	0.25
273	0.24
274	0.22
275	0.17
276	0.18
277	0.15
278	0.11
279	0.11
280	0.13
281	0.14
282	0.14
283	0.14
284	0.13
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.1
289	0.08
290	0.08
291	0.06
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.1
306	0.09
307	0.09
308	0.1
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.11
320	0.11
321	0.15
322	0.2
323	0.25
324	0.24
325	0.26
326	0.3
327	0.37
328	0.38
329	0.34
330	0.3
331	0.25
332	0.21
333	0.19
334	0.16
335	0.08
336	0.07
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.07
342	0.12
343	0.17
344	0.24
345	0.32
346	0.41
347	0.48
348	0.51
349	0.59
350	0.62
351	0.64
352	0.64
353	0.59
354	0.5
355	0.44
356	0.43
357	0.34
358	0.26
359	0.19
360	0.12
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.05
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.03
387	0.04
388	0.04
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.04
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.11
402	0.11
403	0.12
404	0.19
405	0.2
406	0.2
407	0.22
408	0.29
409	0.25
410	0.32
411	0.34
412	0.31
413	0.33
414	0.32
415	0.32
416	0.27
417	0.27
418	0.3
419	0.35
420	0.32
421	0.3
422	0.3
423	0.28
424	0.29
425	0.28
426	0.2
427	0.14
428	0.14
429	0.1
430	0.11
431	0.12
432	0.12
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.17
437	0.18
438	0.17
439	0.23
440	0.23
441	0.28
442	0.33
443	0.33
444	0.3
445	0.31
446	0.3
447	0.24
448	0.22
449	0.17
450	0.11
451	0.11
452	0.09
453	0.07
454	0.06
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.11
461	0.16
462	0.24
463	0.29
464	0.31
465	0.31
466	0.32
467	0.33
468	0.33
469	0.29
470	0.22
471	0.17
472	0.18
473	0.23
474	0.32
475	0.36
476	0.39
477	0.43
478	0.43
479	0.47
480	0.45
481	0.45
482	0.41
483	0.38
484	0.38
485	0.33
486	0.34
487	0.31
488	0.28
489	0.24
490	0.19
491	0.18
492	0.15
493	0.19
494	0.18
495	0.18
496	0.23
497	0.27
498	0.29
499	0.29
500	0.26
501	0.23
502	0.24
503	0.26
504	0.23
505	0.22
506	0.2
507	0.19
508	0.2
509	0.2
510	0.19
511	0.17
512	0.18
513	0.21
514	0.24
515	0.31
516	0.29
517	0.29
518	0.29
519	0.31
520	0.31
521	0.26
522	0.23
523	0.15
524	0.15
525	0.15
526	0.15
527	0.13
528	0.11
529	0.1
530	0.1
531	0.13
532	0.13
533	0.18
534	0.2
535	0.2
536	0.22
537	0.23
538	0.24
539	0.24
540	0.26
541	0.21
542	0.24
543	0.23
544	0.19
545	0.19
546	0.17
547	0.14
548	0.11
549	0.1
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.05
556	0.06
557	0.1
558	0.13
559	0.16
560	0.19
561	0.27
562	0.34
563	0.36
564	0.38
565	0.36
566	0.33
567	0.31
568	0.35
569	0.29
570	0.23
571	0.25
572	0.22
573	0.25
574	0.25
575	0.24
576	0.19
577	0.18
578	0.18
579	0.15
580	0.15
581	0.1
582	0.11
583	0.11
584	0.1
585	0.08
586	0.07
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.07
598	0.07
599	0.06
600	0.08
601	0.1
602	0.12
603	0.14
604	0.17
605	0.16
606	0.16
607	0.17
608	0.15
609	0.13
610	0.12
611	0.1
612	0.07
613	0.07
614	0.06
615	0.05
616	0.04
617	0.05
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.13
623	0.16
624	0.17
625	0.2
626	0.24
627	0.27
628	0.27
629	0.27
630	0.28
631	0.29
632	0.29
633	0.26
634	0.21
635	0.19
636	0.23
637	0.22
638	0.17
639	0.14
640	0.13
641	0.15
642	0.19
643	0.27
644	0.31
645	0.32
646	0.34
647	0.37
648	0.43
649	0.44
650	0.48
651	0.47
652	0.46
653	0.45
654	0.42
655	0.39
656	0.33
657	0.29
658	0.21
659	0.13
660	0.05
661	0.05
662	0.04
663	0.04
664	0.03
665	0.03
666	0.03
667	0.03
668	0.03
669	0.03
670	0.03
671	0.03
672	0.03
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.08
678	0.08
679	0.09
680	0.12
681	0.16
682	0.18
683	0.2
684	0.23
685	0.27
686	0.31
687	0.32
688	0.35
689	0.38
690	0.36
691	0.36
692	0.34
693	0.29
694	0.29
695	0.29
696	0.24
697	0.18
698	0.2
699	0.21
700	0.21
701	0.21
702	0.24
703	0.23
704	0.23
705	0.25
706	0.24
707	0.21
708	0.25
709	0.22
710	0.16
711	0.16
712	0.16
713	0.12
714	0.12
715	0.12
716	0.06
717	0.08
718	0.09
719	0.07
720	0.09
721	0.1
722	0.09
723	0.1
724	0.12
725	0.12
726	0.13
727	0.13
728	0.11
729	0.15
730	0.15
731	0.14
732	0.12
733	0.1
734	0.09
735	0.09
736	0.09
737	0.05
738	0.07
739	0.07
740	0.1
741	0.11
742	0.11
743	0.12
744	0.14
745	0.16
746	0.16
747	0.2
748	0.23
749	0.25
750	0.26
751	0.27
752	0.25
753	0.25
754	0.24
755	0.21
756	0.16
757	0.2
758	0.19
759	0.19
760	0.24
761	0.22
762	0.2
763	0.2
764	0.19
765	0.14
766	0.13
767	0.11
768	0.06
769	0.06
770	0.07
771	0.07
772	0.1
773	0.12
774	0.17
775	0.17
776	0.17
777	0.19
778	0.27
779	0.33
780	0.35
781	0.36
782	0.34
783	0.35
784	0.4
785	0.43
786	0.41
787	0.35
788	0.33
789	0.31
790	0.3
791	0.3
792	0.27
793	0.22
794	0.15
795	0.13
796	0.13
797	0.11
798	0.1
799	0.09
800	0.07
801	0.08
802	0.08
803	0.09
804	0.07
805	0.1
806	0.11
807	0.12
808	0.12
809	0.13
810	0.16
811	0.17
812	0.2
813	0.18
814	0.17
815	0.2
816	0.27
817	0.3
818	0.28
819	0.27
820	0.26
821	0.25
822	0.25
823	0.22
824	0.13
825	0.08
826	0.07
827	0.06
828	0.07
829	0.08
830	0.07
831	0.07
832	0.07
833	0.08
834	0.09
835	0.1
836	0.07
837	0.07
838	0.08
839	0.08
840	0.09
841	0.08
842	0.07
843	0.06
844	0.06
845	0.06
846	0.05
847	0.05
848	0.05
849	0.04
850	0.04
851	0.04
852	0.04
853	0.05
854	0.05
855	0.05
856	0.05
857	0.06
858	0.06
859	0.07
860	0.08
861	0.09
862	0.1
863	0.11
864	0.13
865	0.17
866	0.19
867	0.19
868	0.2
869	0.19
870	0.19
871	0.19
872	0.17
873	0.13
874	0.13
875	0.11
876	0.09
877	0.08
878	0.07
879	0.07
880	0.08
881	0.09
882	0.11
883	0.14
884	0.23
885	0.27
886	0.31
887	0.32
888	0.33
889	0.33
890	0.32
891	0.29
892	0.21
893	0.2
894	0.17
895	0.15
896	0.14
897	0.12
898	0.1
899	0.09
900	0.08
901	0.05
902	0.04
903	0.04
904	0.04
905	0.05
906	0.05
907	0.07
908	0.07
909	0.12
910	0.13
911	0.2
912	0.31
913	0.33
914	0.37
915	0.39
916	0.41
917	0.39
918	0.43
919	0.38
920	0.28
921	0.25
922	0.23
923	0.2
924	0.21
925	0.19
926	0.14
927	0.18
928	0.18
929	0.2
930	0.23
931	0.27
932	0.3
933	0.39
934	0.49
935	0.49
936	0.55
937	0.59
938	0.58
939	0.56
940	0.53
941	0.43
942	0.33
943	0.32
944	0.27
945	0.26
946	0.25
947	0.25
948	0.25
949	0.26
950	0.27
951	0.26
952	0.26
953	0.21
954	0.23
955	0.28
956	0.28
957	0.29
958	0.3
959	0.27
960	0.26
961	0.26
962	0.25
963	0.19
964	0.19
965	0.19
966	0.17
967	0.17
968	0.17
969	0.16
970	0.13
971	0.13
972	0.13
973	0.09
974	0.09
975	0.1
976	0.1
977	0.11
978	0.16
979	0.19
980	0.18
981	0.18
982	0.2
983	0.24
984	0.27
985	0.28
986	0.24
987	0.25
988	0.25
989	0.31
990	0.39
991	0.37
992	0.39
993	0.4
994	0.4
995	0.36
996	0.39
997	0.36
998	0.3
999	0.26
1000	0.21
1001	0.19
1002	0.18
1003	0.18
1004	0.15
1005	0.14
1006	0.11
1007	0.12
1008	0.15
1009	0.17
1010	0.27
1011	0.28
1012	0.28
1013	0.29
1014	0.35
1015	0.38
1016	0.4
1017	0.39
1018	0.3
1019	0.36
1020	0.38
1021	0.4
1022	0.37
1023	0.34
1024	0.29
1025	0.29
1026	0.31
1027	0.26
1028	0.28
1029	0.27
1030	0.28
1031	0.36
1032	0.39
1033	0.4
1034	0.4
1035	0.4
1036	0.4
1037	0.38
1038	0.34
1039	0.29
1040	0.28
1041	0.26
1042	0.25
1043	0.23
1044	0.18
1045	0.19
1046	0.21
1047	0.18
1048	0.18
1049	0.18
1050	0.14
1051	0.13
1052	0.13
1053	0.1
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.05
1057	0.08
1058	0.12
1059	0.15
1060	0.2
1061	0.23
1062	0.24
1063	0.27
1064	0.28
1065	0.26
1066	0.3
1067	0.31
1068	0.3
1069	0.32
1070	0.32
1071	0.28
1072	0.28
1073	0.28
1074	0.26
1075	0.26
1076	0.24
1077	0.23
1078	0.25
1079	0.29
1080	0.32
1081	0.36
1082	0.36
1083	0.35
1084	0.35
1085	0.36
1086	0.4
1087	0.41
1088	0.45

R7YMB0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer