Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YJA1

Protein Details
Accession R7YJA1    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-45DSPNPFPGNNKRKREPPTRGTHSTHQHydrophilic
86-114AQPSADSTDKPKKKKRRKHNQLGLTPKGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-104KPKKKKRRKH
161-247KNRFPTKARIEEKEKEKERRLAEARAARQEEAERRKKRHDEEIESQKKVKKEKDGGGQDDEQERKREKYLAKAEKLRRKLEKSERKA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039136  NUFIP1-like  
IPR019496  NUFIP1_cons_dom  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10453  NUFIP1  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MGFDNSHPPDPPRPYSTKHDSPNPFPGNNKRKREPPTRGTHSTHQSHNSSFHNQRHHHNGKPDKAKAKVAPQVPNFGFALSTPQAAQPSADSTDKPKKKKRRKHNQLGLTPKGEEHEDSEDEIDEEAAFASAGGALQFTHNGLTSTLNTPTDLAAWIQERKNRFPTKARIEEKEKEKERRLAEARAARQEEAERRKKRHDEEIESQKKVKKEKDGGGQDDEQERKREKYLAKAEKLRRKLEKSERKAAALAAGSSTAKPDSPARDPMQAITAAEPPVVNDKTAVKLEPQPDIVLEPVSADPATIVPNPETDSVITDVQLPNENPMLNALPTTVLATLEDTLTLKYDIEQPKPDLGLSYAASTSSDNDSEDSMSISSSSSDASSDASDSDAPPTETSSRRTGPTKVPPPPRDGTRKPQQGTKVCRYFAKHGRCNLGARCGFRHDQGDEKSGKKERGGMKLFDRLVEQERKEEAELALSAIKYLGSNGFLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.61
3 0.66
4 0.66
5 0.66
6 0.7
7 0.7
8 0.71
9 0.76
10 0.73
11 0.66
12 0.65
13 0.68
14 0.69
15 0.72
16 0.74
17 0.7
18 0.73
19 0.79
20 0.83
21 0.82
22 0.81
23 0.82
24 0.82
25 0.82
26 0.8
27 0.8
28 0.78
29 0.73
30 0.7
31 0.67
32 0.62
33 0.57
34 0.56
35 0.52
36 0.52
37 0.54
38 0.54
39 0.57
40 0.56
41 0.61
42 0.67
43 0.68
44 0.66
45 0.68
46 0.71
47 0.71
48 0.77
49 0.78
50 0.74
51 0.72
52 0.73
53 0.69
54 0.68
55 0.65
56 0.62
57 0.63
58 0.58
59 0.63
60 0.55
61 0.52
62 0.43
63 0.36
64 0.29
65 0.2
66 0.25
67 0.16
68 0.17
69 0.14
70 0.16
71 0.17
72 0.17
73 0.18
74 0.12
75 0.14
76 0.17
77 0.17
78 0.16
79 0.23
80 0.34
81 0.41
82 0.49
83 0.56
84 0.64
85 0.74
86 0.84
87 0.87
88 0.88
89 0.92
90 0.94
91 0.95
92 0.94
93 0.92
94 0.91
95 0.86
96 0.77
97 0.66
98 0.55
99 0.46
100 0.37
101 0.28
102 0.22
103 0.2
104 0.18
105 0.19
106 0.19
107 0.18
108 0.17
109 0.16
110 0.12
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.09
131 0.11
132 0.13
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.15
144 0.18
145 0.21
146 0.24
147 0.29
148 0.38
149 0.41
150 0.43
151 0.47
152 0.54
153 0.61
154 0.67
155 0.67
156 0.64
157 0.66
158 0.7
159 0.69
160 0.69
161 0.67
162 0.64
163 0.65
164 0.65
165 0.59
166 0.61
167 0.57
168 0.51
169 0.51
170 0.51
171 0.49
172 0.49
173 0.48
174 0.39
175 0.37
176 0.37
177 0.38
178 0.4
179 0.46
180 0.46
181 0.48
182 0.57
183 0.63
184 0.63
185 0.65
186 0.64
187 0.62
188 0.65
189 0.72
190 0.7
191 0.64
192 0.64
193 0.56
194 0.52
195 0.5
196 0.46
197 0.43
198 0.44
199 0.49
200 0.55
201 0.59
202 0.58
203 0.56
204 0.52
205 0.45
206 0.42
207 0.38
208 0.3
209 0.27
210 0.26
211 0.23
212 0.24
213 0.28
214 0.25
215 0.33
216 0.41
217 0.46
218 0.5
219 0.57
220 0.64
221 0.66
222 0.7
223 0.67
224 0.64
225 0.6
226 0.63
227 0.66
228 0.68
229 0.67
230 0.7
231 0.65
232 0.59
233 0.55
234 0.46
235 0.37
236 0.27
237 0.2
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.06
244 0.05
245 0.07
246 0.09
247 0.13
248 0.16
249 0.22
250 0.23
251 0.27
252 0.27
253 0.26
254 0.25
255 0.21
256 0.18
257 0.14
258 0.14
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.12
272 0.17
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.15
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.08
290 0.07
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.11
299 0.13
300 0.12
301 0.12
302 0.13
303 0.12
304 0.13
305 0.16
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.16
333 0.2
334 0.23
335 0.27
336 0.28
337 0.3
338 0.3
339 0.29
340 0.22
341 0.18
342 0.18
343 0.15
344 0.14
345 0.12
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.15
380 0.19
381 0.21
382 0.25
383 0.29
384 0.3
385 0.33
386 0.37
387 0.39
388 0.43
389 0.51
390 0.57
391 0.59
392 0.67
393 0.67
394 0.7
395 0.71
396 0.7
397 0.7
398 0.67
399 0.68
400 0.68
401 0.74
402 0.7
403 0.7
404 0.72
405 0.71
406 0.73
407 0.74
408 0.71
409 0.64
410 0.66
411 0.66
412 0.65
413 0.65
414 0.67
415 0.64
416 0.63
417 0.68
418 0.66
419 0.67
420 0.61
421 0.62
422 0.55
423 0.52
424 0.49
425 0.48
426 0.46
427 0.44
428 0.45
429 0.38
430 0.42
431 0.42
432 0.46
433 0.44
434 0.44
435 0.49
436 0.5
437 0.51
438 0.44
439 0.48
440 0.49
441 0.54
442 0.57
443 0.55
444 0.54
445 0.59
446 0.58
447 0.51
448 0.46
449 0.39
450 0.41
451 0.44
452 0.4
453 0.37
454 0.39
455 0.41
456 0.4
457 0.38
458 0.31
459 0.26
460 0.24
461 0.21
462 0.21
463 0.18
464 0.16
465 0.14
466 0.14
467 0.1
468 0.12
469 0.12