Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7YYK6

Protein Details
Accession R7YYK6    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-39QKAVRATASKVQKKTKSKKRPVNSKTILKELHydrophilic
386-406EDDPNPTKRAKKNNVPFSRIPHydrophilic
433-460LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGVIDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-29AVRATASKVQKKTKSKKRP
307-320NPTKPKPAIKSPAA
439-451KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAPSKKSEQKAVRATASKVQKKTKSKKRPVNSKTILKELVDVIHECLVNSGRVEAAESFYQEASSAPGGAKIRSSFAKTLRLLEHEQEEEAVEKGSASKSKAESAASESDSDVDMVETPSTSSASSRESSVSKAASPAPSESAASESSQDSSSSGSSSSSSNSSSSNRSSKASSSKLKRKSPSPSSSDAEGSDSSSSSESSSSSDSDSESDSDVEESVEEPVRAPSPAPSASSAKSSSSSDSSSSYSSSSDSDSSDDEAANVPLPSSSDEDSRSSSSAESSSESDSGSDSDSASDSSSASEAPKTKNPTKPKPAIKSPAARKESPESATSSSATLAATSPVPRPTENNATTTTTTATTASNKRKRTTSPPAPAAYPSAPTTTTTSEDDPNPTKRAKKNNVPFSRIPADTKVDPRLASNAYVSYDYADRAHRDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGVIDTVPRGFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.64
3 0.66
4 0.65
5 0.64
6 0.67
7 0.69
8 0.75
9 0.82
10 0.85
11 0.86
12 0.89
13 0.92
14 0.93
15 0.94
16 0.91
17 0.92
18 0.9
19 0.88
20 0.83
21 0.79
22 0.72
23 0.61
24 0.56
25 0.46
26 0.4
27 0.32
28 0.28
29 0.22
30 0.22
31 0.22
32 0.19
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.16
37 0.14
38 0.11
39 0.11
40 0.13
41 0.12
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.09
54 0.14
55 0.15
56 0.16
57 0.19
58 0.17
59 0.2
60 0.22
61 0.27
62 0.27
63 0.3
64 0.39
65 0.37
66 0.42
67 0.41
68 0.43
69 0.41
70 0.4
71 0.4
72 0.32
73 0.31
74 0.26
75 0.23
76 0.19
77 0.16
78 0.13
79 0.09
80 0.07
81 0.09
82 0.11
83 0.13
84 0.14
85 0.19
86 0.2
87 0.24
88 0.26
89 0.25
90 0.24
91 0.26
92 0.29
93 0.25
94 0.24
95 0.2
96 0.19
97 0.18
98 0.17
99 0.12
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.15
115 0.16
116 0.18
117 0.2
118 0.2
119 0.17
120 0.18
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.19
125 0.18
126 0.18
127 0.18
128 0.16
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.13
150 0.15
151 0.18
152 0.22
153 0.25
154 0.26
155 0.26
156 0.27
157 0.29
158 0.34
159 0.38
160 0.42
161 0.47
162 0.54
163 0.62
164 0.68
165 0.68
166 0.68
167 0.7
168 0.72
169 0.7
170 0.66
171 0.63
172 0.58
173 0.55
174 0.49
175 0.4
176 0.32
177 0.25
178 0.2
179 0.15
180 0.12
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.18
220 0.18
221 0.15
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.14
231 0.14
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.14
258 0.16
259 0.17
260 0.16
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.1
288 0.12
289 0.16
290 0.21
291 0.28
292 0.35
293 0.43
294 0.52
295 0.59
296 0.65
297 0.71
298 0.75
299 0.76
300 0.78
301 0.78
302 0.75
303 0.75
304 0.74
305 0.75
306 0.7
307 0.63
308 0.58
309 0.56
310 0.54
311 0.47
312 0.4
313 0.33
314 0.31
315 0.31
316 0.28
317 0.22
318 0.18
319 0.16
320 0.14
321 0.11
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.1
326 0.12
327 0.15
328 0.17
329 0.17
330 0.2
331 0.26
332 0.34
333 0.34
334 0.34
335 0.34
336 0.36
337 0.36
338 0.34
339 0.29
340 0.2
341 0.19
342 0.17
343 0.16
344 0.18
345 0.26
346 0.35
347 0.42
348 0.46
349 0.49
350 0.54
351 0.58
352 0.62
353 0.64
354 0.64
355 0.67
356 0.69
357 0.67
358 0.63
359 0.59
360 0.54
361 0.44
362 0.36
363 0.27
364 0.22
365 0.2
366 0.21
367 0.23
368 0.21
369 0.23
370 0.23
371 0.24
372 0.25
373 0.27
374 0.31
375 0.33
376 0.35
377 0.36
378 0.38
379 0.44
380 0.48
381 0.57
382 0.61
383 0.66
384 0.72
385 0.79
386 0.83
387 0.83
388 0.77
389 0.74
390 0.71
391 0.62
392 0.55
393 0.49
394 0.45
395 0.43
396 0.46
397 0.43
398 0.4
399 0.38
400 0.36
401 0.37
402 0.33
403 0.3
404 0.26
405 0.23
406 0.22
407 0.22
408 0.21
409 0.18
410 0.17
411 0.16
412 0.17
413 0.19
414 0.2
415 0.21
416 0.22
417 0.21
418 0.23
419 0.25
420 0.3
421 0.36
422 0.34
423 0.34
424 0.39
425 0.4
426 0.45
427 0.47
428 0.49
429 0.51
430 0.61
431 0.69
432 0.75
433 0.82
434 0.84
435 0.9
436 0.91
437 0.9
438 0.9
439 0.88
440 0.86
441 0.85
442 0.79
443 0.69
444 0.6
445 0.56
446 0.48
447 0.42
448 0.35
449 0.26