Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CAX0

Protein Details
Accession S3CAX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1012-1038EELGQLLANRKKRKRRKGVGNVPRDCAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1021-1029RKKRKRRKG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001610  PAC  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013654  PAS_2  
IPR013655  PAS_fold_3  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF08446  PAS_2  
PF08447  PAS_3  
PF13426  PAS_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MDNFFGGQVPLSIDEQQQQQPHNNQGDRRHSVPHSQNSQLAQQGAFSGAGGQPLPHQQHRQHQSRLSMSSASLRSLGPDNQMQPLGYLNTGVDINSGVEDAFKNFSFSTADGSAFPGPMGMTSAEQQASIAANAAATTGFSPTSNMLTSGADSDPRSFNALSQSMLPQMSHDYPQGISQSLIDNIMSYPNMDLSQLSSAQAGTIDAATLAAFFASGPDASGIQSTVMADLEAHFTTSPSDNMPTPTYIAGRDLEMEGDSNSNTPSFSGSTHTQRPTQNQQSFGTLPLTSSPPSLTRSQLAVLQQQQQQQQQQQQQQQQQGLYPGGFKTARPSTLARRSTSSSAAATPNSILRTNSNSTSTALTPQISSISSMEGPIPAAATSGRLSASSKGGIVAGPAPPPPGPLTNKNIKNYYSSSGFDMIRALYYVSSRPNPEIAIGPVDLSCAFVVCDATLEDTPIIYISDNFQHLTGYSSHEIMGQNCRFLQSPTGRVEAGSLRDFTDNKAVLNIKEKLVAGREVQQSLINYRKGGTPFLNLLTMIPIPWDDHKGTYKYFIGLQIDLVESPDAVSDQTNDHTMTIDYKHRVNIPQYIWDPPNAGLWQNNNHSRTLGVDDISALLAQYGNRGLIGGMGVGNDIIGSATSDMYRQSWDKMLLENVDDVIHVLSLKGVFLYLSPSCKDVLEYDPADLLGNTLATICHPSDLVATTREMRDIQPGQSISLVYRVRRKQSGYTWFEGHGSLLVEQQGKGRKCIVLVGRKRPAFALQRCDVDINGGIGDSEIWTKMSTSGMILHSSANVRSLLDHQPDTLVGTSIQELMRKDSRPGFNRALEKARRGIISSCKHEVQHRRGQVLQASTILYPGDAERGEKPTFVLGQTRLLKSSSTSRGFPAAAVAAAAVAAQAQAAQAAAATGTLVAGAPGVGARSSAGFVFGPNVEADDVGRAGALGQLAEPDTLAGGGFLSSAGGSAAMPGSQDAILASDDNIFSELKTTRCTSWQYELRQMEKANRLLAEELGQLLANRKKRKRRKGVGNVPRDCANCHTRNTPEWRRGPSGQRDLCNSCGLRWAKQIGRVSPRNSSRGGGGTTIAGGTSVGGKGMSSAGGGAGGGVGAGAATSAGGSAGGSRSGRSGRSKTSASPGPKSGVPRGNYANDTSSSGAGFSSTGNSGGSGGGSGDDSSGGNSSGPGQGQGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.25
3 0.29
4 0.32
5 0.34
6 0.4
7 0.45
8 0.52
9 0.57
10 0.58
11 0.59
12 0.64
13 0.7
14 0.67
15 0.64
16 0.62
17 0.57
18 0.61
19 0.64
20 0.64
21 0.61
22 0.59
23 0.61
24 0.57
25 0.58
26 0.52
27 0.44
28 0.34
29 0.28
30 0.25
31 0.21
32 0.18
33 0.14
34 0.12
35 0.1
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.2
41 0.26
42 0.3
43 0.37
44 0.42
45 0.53
46 0.62
47 0.68
48 0.69
49 0.69
50 0.71
51 0.7
52 0.67
53 0.59
54 0.51
55 0.44
56 0.43
57 0.38
58 0.32
59 0.26
60 0.23
61 0.23
62 0.25
63 0.27
64 0.24
65 0.28
66 0.28
67 0.31
68 0.32
69 0.29
70 0.25
71 0.26
72 0.23
73 0.17
74 0.16
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.1
88 0.13
89 0.12
90 0.14
91 0.14
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.2
96 0.18
97 0.19
98 0.17
99 0.21
100 0.2
101 0.18
102 0.17
103 0.12
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.11
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.06
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.15
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.18
141 0.19
142 0.19
143 0.22
144 0.2
145 0.21
146 0.25
147 0.25
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.22
152 0.23
153 0.21
154 0.15
155 0.19
156 0.21
157 0.21
158 0.2
159 0.19
160 0.18
161 0.21
162 0.22
163 0.18
164 0.16
165 0.15
166 0.16
167 0.15
168 0.15
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.09
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.14
227 0.15
228 0.18
229 0.2
230 0.19
231 0.18
232 0.19
233 0.18
234 0.17
235 0.18
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.14
255 0.18
256 0.24
257 0.31
258 0.34
259 0.38
260 0.41
261 0.48
262 0.53
263 0.59
264 0.57
265 0.54
266 0.53
267 0.53
268 0.49
269 0.43
270 0.35
271 0.25
272 0.21
273 0.18
274 0.19
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.18
280 0.2
281 0.2
282 0.2
283 0.21
284 0.21
285 0.23
286 0.23
287 0.26
288 0.27
289 0.32
290 0.33
291 0.37
292 0.4
293 0.42
294 0.44
295 0.44
296 0.48
297 0.5
298 0.54
299 0.57
300 0.6
301 0.62
302 0.62
303 0.59
304 0.52
305 0.46
306 0.41
307 0.34
308 0.27
309 0.22
310 0.16
311 0.17
312 0.17
313 0.15
314 0.19
315 0.22
316 0.22
317 0.24
318 0.28
319 0.32
320 0.42
321 0.46
322 0.41
323 0.42
324 0.44
325 0.44
326 0.43
327 0.36
328 0.28
329 0.26
330 0.26
331 0.22
332 0.19
333 0.17
334 0.17
335 0.17
336 0.17
337 0.15
338 0.15
339 0.2
340 0.23
341 0.24
342 0.24
343 0.23
344 0.23
345 0.25
346 0.23
347 0.21
348 0.19
349 0.17
350 0.15
351 0.14
352 0.14
353 0.12
354 0.12
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.05
365 0.06
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.09
373 0.11
374 0.13
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.16
390 0.19
391 0.23
392 0.29
393 0.38
394 0.44
395 0.46
396 0.48
397 0.44
398 0.44
399 0.41
400 0.39
401 0.33
402 0.28
403 0.26
404 0.27
405 0.26
406 0.22
407 0.2
408 0.16
409 0.13
410 0.12
411 0.1
412 0.06
413 0.07
414 0.09
415 0.11
416 0.14
417 0.15
418 0.16
419 0.17
420 0.17
421 0.17
422 0.17
423 0.14
424 0.14
425 0.12
426 0.12
427 0.1
428 0.11
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.04
437 0.05
438 0.04
439 0.07
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.04
448 0.05
449 0.06
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.11
457 0.1
458 0.12
459 0.12
460 0.12
461 0.13
462 0.15
463 0.16
464 0.15
465 0.23
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.2
470 0.18
471 0.17
472 0.23
473 0.18
474 0.23
475 0.24
476 0.26
477 0.25
478 0.24
479 0.25
480 0.2
481 0.2
482 0.16
483 0.14
484 0.13
485 0.15
486 0.16
487 0.15
488 0.2
489 0.17
490 0.16
491 0.18
492 0.18
493 0.18
494 0.23
495 0.24
496 0.18
497 0.19
498 0.2
499 0.17
500 0.18
501 0.19
502 0.14
503 0.19
504 0.21
505 0.19
506 0.2
507 0.2
508 0.19
509 0.2
510 0.24
511 0.18
512 0.16
513 0.17
514 0.2
515 0.19
516 0.21
517 0.19
518 0.16
519 0.17
520 0.18
521 0.17
522 0.14
523 0.13
524 0.11
525 0.1
526 0.08
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.1
532 0.09
533 0.12
534 0.15
535 0.17
536 0.17
537 0.19
538 0.19
539 0.17
540 0.17
541 0.17
542 0.16
543 0.14
544 0.14
545 0.11
546 0.11
547 0.1
548 0.09
549 0.06
550 0.05
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.05
558 0.06
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.09
565 0.1
566 0.13
567 0.14
568 0.15
569 0.16
570 0.18
571 0.2
572 0.21
573 0.25
574 0.22
575 0.26
576 0.26
577 0.28
578 0.27
579 0.24
580 0.24
581 0.18
582 0.19
583 0.14
584 0.13
585 0.11
586 0.13
587 0.17
588 0.2
589 0.25
590 0.24
591 0.24
592 0.23
593 0.22
594 0.21
595 0.2
596 0.15
597 0.1
598 0.09
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.08
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.03
616 0.03
617 0.03
618 0.03
619 0.03
620 0.03
621 0.02
622 0.02
623 0.02
624 0.02
625 0.02
626 0.03
627 0.03
628 0.04
629 0.04
630 0.05
631 0.05
632 0.07
633 0.08
634 0.09
635 0.11
636 0.12
637 0.13
638 0.14
639 0.15
640 0.14
641 0.14
642 0.12
643 0.1
644 0.09
645 0.08
646 0.07
647 0.05
648 0.05
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.07
659 0.07
660 0.09
661 0.1
662 0.11
663 0.12
664 0.12
665 0.12
666 0.11
667 0.13
668 0.15
669 0.15
670 0.15
671 0.15
672 0.15
673 0.14
674 0.12
675 0.09
676 0.05
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.06
683 0.05
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.07
688 0.08
689 0.09
690 0.09
691 0.1
692 0.11
693 0.12
694 0.13
695 0.13
696 0.12
697 0.17
698 0.18
699 0.18
700 0.21
701 0.21
702 0.2
703 0.2
704 0.19
705 0.13
706 0.18
707 0.19
708 0.16
709 0.25
710 0.28
711 0.32
712 0.36
713 0.38
714 0.38
715 0.44
716 0.52
717 0.49
718 0.49
719 0.46
720 0.43
721 0.41
722 0.35
723 0.26
724 0.17
725 0.13
726 0.1
727 0.09
728 0.1
729 0.1
730 0.1
731 0.14
732 0.2
733 0.2
734 0.21
735 0.22
736 0.2
737 0.2
738 0.25
739 0.28
740 0.31
741 0.38
742 0.45
743 0.51
744 0.51
745 0.51
746 0.47
747 0.47
748 0.46
749 0.44
750 0.43
751 0.38
752 0.39
753 0.39
754 0.39
755 0.32
756 0.24
757 0.2
758 0.13
759 0.1
760 0.08
761 0.07
762 0.06
763 0.06
764 0.05
765 0.05
766 0.04
767 0.05
768 0.05
769 0.06
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.1
775 0.11
776 0.12
777 0.12
778 0.11
779 0.12
780 0.13
781 0.13
782 0.11
783 0.1
784 0.09
785 0.1
786 0.13
787 0.18
788 0.2
789 0.2
790 0.19
791 0.19
792 0.19
793 0.19
794 0.16
795 0.11
796 0.07
797 0.08
798 0.08
799 0.1
800 0.11
801 0.12
802 0.12
803 0.16
804 0.21
805 0.21
806 0.24
807 0.3
808 0.37
809 0.39
810 0.45
811 0.46
812 0.47
813 0.51
814 0.52
815 0.53
816 0.48
817 0.47
818 0.44
819 0.42
820 0.37
821 0.34
822 0.34
823 0.35
824 0.38
825 0.4
826 0.41
827 0.4
828 0.41
829 0.46
830 0.52
831 0.51
832 0.52
833 0.51
834 0.51
835 0.5
836 0.52
837 0.49
838 0.41
839 0.34
840 0.26
841 0.23
842 0.19
843 0.18
844 0.15
845 0.1
846 0.08
847 0.07
848 0.08
849 0.07
850 0.09
851 0.11
852 0.16
853 0.17
854 0.16
855 0.17
856 0.17
857 0.18
858 0.17
859 0.19
860 0.16
861 0.24
862 0.29
863 0.29
864 0.28
865 0.27
866 0.26
867 0.24
868 0.31
869 0.31
870 0.29
871 0.3
872 0.3
873 0.32
874 0.32
875 0.3
876 0.24
877 0.16
878 0.12
879 0.11
880 0.09
881 0.06
882 0.06
883 0.05
884 0.03
885 0.02
886 0.02
887 0.02
888 0.02
889 0.02
890 0.03
891 0.03
892 0.03
893 0.03
894 0.03
895 0.03
896 0.03
897 0.03
898 0.02
899 0.02
900 0.03
901 0.03
902 0.03
903 0.03
904 0.03
905 0.03
906 0.03
907 0.03
908 0.03
909 0.04
910 0.04
911 0.05
912 0.06
913 0.06
914 0.07
915 0.07
916 0.07
917 0.09
918 0.09
919 0.1
920 0.09
921 0.1
922 0.09
923 0.09
924 0.09
925 0.08
926 0.08
927 0.06
928 0.06
929 0.05
930 0.05
931 0.06
932 0.06
933 0.05
934 0.05
935 0.06
936 0.06
937 0.07
938 0.06
939 0.05
940 0.05
941 0.05
942 0.05
943 0.04
944 0.03
945 0.03
946 0.03
947 0.03
948 0.03
949 0.03
950 0.03
951 0.03
952 0.04
953 0.03
954 0.04
955 0.05
956 0.04
957 0.05
958 0.05
959 0.06
960 0.06
961 0.06
962 0.05
963 0.06
964 0.07
965 0.07
966 0.08
967 0.08
968 0.08
969 0.09
970 0.1
971 0.09
972 0.08
973 0.12
974 0.14
975 0.13
976 0.17
977 0.19
978 0.2
979 0.25
980 0.3
981 0.31
982 0.38
983 0.44
984 0.46
985 0.53
986 0.57
987 0.55
988 0.55
989 0.53
990 0.51
991 0.51
992 0.48
993 0.42
994 0.37
995 0.36
996 0.32
997 0.3
998 0.25
999 0.18
1000 0.15
1001 0.12
1002 0.12
1003 0.11
1004 0.16
1005 0.21
1006 0.27
1007 0.36
1008 0.45
1009 0.56
1010 0.66
1011 0.77
1012 0.82
1013 0.87
1014 0.91
1015 0.93
1016 0.95
1017 0.95
1018 0.94
1019 0.88
1020 0.8
1021 0.74
1022 0.64
1023 0.55
1024 0.5
1025 0.48
1026 0.42
1027 0.42
1028 0.45
1029 0.44
1030 0.51
1031 0.59
1032 0.62
1033 0.62
1034 0.64
1035 0.66
1036 0.67
1037 0.69
1038 0.71
1039 0.71
1040 0.72
1041 0.69
1042 0.66
1043 0.66
1044 0.63
1045 0.59
1046 0.57
1047 0.47
1048 0.37
1049 0.4
1050 0.38
1051 0.35
1052 0.37
1053 0.42
1054 0.38
1055 0.45
1056 0.51
1057 0.5
1058 0.58
1059 0.61
1060 0.59
1061 0.62
1062 0.64
1063 0.61
1064 0.56
1065 0.49
1066 0.43
1067 0.4
1068 0.38
1069 0.3
1070 0.24
1071 0.21
1072 0.19
1073 0.17
1074 0.14
1075 0.09
1076 0.07
1077 0.06
1078 0.07
1079 0.06
1080 0.06
1081 0.06
1082 0.06
1083 0.07
1084 0.08
1085 0.07
1086 0.06
1087 0.06
1088 0.05
1089 0.06
1090 0.06
1091 0.05
1092 0.04
1093 0.03
1094 0.03
1095 0.03
1096 0.02
1097 0.02
1098 0.02
1099 0.02
1100 0.02
1101 0.02
1102 0.02
1103 0.02
1104 0.02
1105 0.03
1106 0.03
1107 0.05
1108 0.06
1109 0.09
1110 0.1
1111 0.1
1112 0.14
1113 0.17
1114 0.23
1115 0.29
1116 0.34
1117 0.38
1118 0.44
1119 0.47
1120 0.47
1121 0.53
1122 0.56
1123 0.55
1124 0.55
1125 0.52
1126 0.49
1127 0.5
1128 0.52
1129 0.52
1130 0.51
1131 0.47
1132 0.47
1133 0.5
1134 0.52
1135 0.5
1136 0.48
1137 0.43
1138 0.37
1139 0.38
1140 0.33
1141 0.28
1142 0.22
1143 0.19
1144 0.16
1145 0.13
1146 0.11
1147 0.09
1148 0.1
1149 0.1
1150 0.11
1151 0.11
1152 0.11
1153 0.11
1154 0.11
1155 0.1
1156 0.08
1157 0.07
1158 0.07
1159 0.07
1160 0.07
1161 0.07
1162 0.07
1163 0.07
1164 0.08
1165 0.09
1166 0.09
1167 0.08
1168 0.09
1169 0.11
1170 0.13
1171 0.13