Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C1N0

Protein Details
Accession S3C1N0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-105HGTALYGRRKQRRQIRMDKKKKQAVIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-100RRKQRRQIRMDKKKK
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 12, nucl 8, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006224  PsdUridine_synth_RluA-like_CS  
IPR006225  PsdUridine_synth_RluC/D  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01129  PSI_RLU  
PS50889  S4  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MTQEADIPKVGDVQAAAQATETADVPEVAKVPEAEEISVVATSETTATEDPAETKPKAAKTETDDDAATKAHEQEPKLHGTALYGRRKQRRQIRMDKKKKQAVIEAAPHGSEAVAQRALTMGSNRTGEIVSSSHMPADWPKPYYLESGLRRVEPYYYTYNTWVKERWRGRTLIAVFECEFRDRPLAYYRNAMESGTVKVNDKVVGPDHVLLNGERVSHTLHRHEPPVTADPIHVIYEDDAMLVINKPAGVPVHPAGRYQYNSVVEILKHERGPEFTPYPCNRLDRLTSGIMFVAKDPATAKRLGLQIQARVVRKEYLARVVGRFPDGEVICDQPILQISPKLGLNRVRANGRSARTVFKRLAYYEGDSQDAKDENGNELDKTRRGHSIVRCLPVTGRTHQIRVHLQYLGHPIENDPIYANQKVWGFDLGEGDAEATRNTDEDIISRLSRMGKEDVAEAVAYYDEMVDEYHKRKAERMSGEVCDKCDTPLYTDPGEHELSLWLHSLRYEAAPEAKDVVASGGKGWSFKSPLPVWALPPEGASGPTEVGGLEDLVGAAAEAPGFEAEPETKAEVAEAEKAAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.13
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.12
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.11
16 0.13
17 0.12
18 0.13
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.14
38 0.18
39 0.23
40 0.22
41 0.25
42 0.3
43 0.34
44 0.38
45 0.38
46 0.4
47 0.42
48 0.49
49 0.47
50 0.44
51 0.4
52 0.35
53 0.33
54 0.28
55 0.22
56 0.16
57 0.17
58 0.19
59 0.23
60 0.24
61 0.31
62 0.34
63 0.38
64 0.37
65 0.35
66 0.3
67 0.29
68 0.36
69 0.38
70 0.44
71 0.45
72 0.53
73 0.62
74 0.69
75 0.75
76 0.76
77 0.78
78 0.78
79 0.83
80 0.86
81 0.87
82 0.92
83 0.92
84 0.92
85 0.9
86 0.85
87 0.79
88 0.76
89 0.73
90 0.7
91 0.67
92 0.61
93 0.53
94 0.48
95 0.42
96 0.33
97 0.24
98 0.18
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.1
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.14
124 0.19
125 0.22
126 0.21
127 0.22
128 0.23
129 0.25
130 0.27
131 0.27
132 0.3
133 0.29
134 0.35
135 0.36
136 0.35
137 0.35
138 0.33
139 0.3
140 0.23
141 0.24
142 0.23
143 0.23
144 0.24
145 0.28
146 0.31
147 0.31
148 0.32
149 0.32
150 0.3
151 0.38
152 0.42
153 0.45
154 0.46
155 0.46
156 0.45
157 0.49
158 0.46
159 0.45
160 0.39
161 0.34
162 0.3
163 0.31
164 0.3
165 0.24
166 0.23
167 0.16
168 0.19
169 0.16
170 0.18
171 0.24
172 0.26
173 0.26
174 0.31
175 0.3
176 0.31
177 0.31
178 0.28
179 0.21
180 0.19
181 0.21
182 0.18
183 0.18
184 0.15
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.15
190 0.13
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.12
204 0.15
205 0.17
206 0.2
207 0.25
208 0.27
209 0.3
210 0.31
211 0.29
212 0.29
213 0.31
214 0.27
215 0.22
216 0.19
217 0.18
218 0.18
219 0.17
220 0.13
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.08
238 0.1
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.21
244 0.21
245 0.2
246 0.23
247 0.19
248 0.2
249 0.2
250 0.2
251 0.15
252 0.18
253 0.19
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.15
258 0.16
259 0.19
260 0.2
261 0.19
262 0.18
263 0.26
264 0.26
265 0.29
266 0.29
267 0.29
268 0.26
269 0.26
270 0.27
271 0.21
272 0.24
273 0.22
274 0.2
275 0.18
276 0.17
277 0.15
278 0.13
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.16
290 0.17
291 0.21
292 0.2
293 0.2
294 0.24
295 0.29
296 0.26
297 0.25
298 0.25
299 0.21
300 0.2
301 0.22
302 0.19
303 0.19
304 0.21
305 0.22
306 0.21
307 0.22
308 0.22
309 0.2
310 0.18
311 0.13
312 0.16
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.14
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.12
328 0.12
329 0.15
330 0.2
331 0.24
332 0.28
333 0.31
334 0.32
335 0.31
336 0.35
337 0.37
338 0.33
339 0.35
340 0.32
341 0.35
342 0.35
343 0.39
344 0.36
345 0.34
346 0.35
347 0.3
348 0.32
349 0.28
350 0.28
351 0.28
352 0.27
353 0.25
354 0.22
355 0.22
356 0.2
357 0.18
358 0.16
359 0.13
360 0.13
361 0.12
362 0.15
363 0.16
364 0.13
365 0.15
366 0.18
367 0.19
368 0.2
369 0.21
370 0.22
371 0.24
372 0.31
373 0.34
374 0.42
375 0.44
376 0.46
377 0.44
378 0.41
379 0.39
380 0.38
381 0.36
382 0.28
383 0.3
384 0.28
385 0.31
386 0.33
387 0.37
388 0.38
389 0.38
390 0.38
391 0.32
392 0.3
393 0.3
394 0.34
395 0.31
396 0.25
397 0.21
398 0.19
399 0.21
400 0.22
401 0.18
402 0.13
403 0.15
404 0.18
405 0.18
406 0.18
407 0.17
408 0.19
409 0.19
410 0.19
411 0.18
412 0.15
413 0.16
414 0.17
415 0.14
416 0.12
417 0.11
418 0.1
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.11
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.15
434 0.17
435 0.18
436 0.2
437 0.2
438 0.19
439 0.2
440 0.2
441 0.19
442 0.17
443 0.16
444 0.12
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.06
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.07
454 0.12
455 0.14
456 0.2
457 0.23
458 0.24
459 0.29
460 0.36
461 0.42
462 0.44
463 0.48
464 0.48
465 0.49
466 0.56
467 0.53
468 0.47
469 0.41
470 0.35
471 0.3
472 0.3
473 0.27
474 0.25
475 0.3
476 0.32
477 0.31
478 0.31
479 0.32
480 0.31
481 0.31
482 0.25
483 0.19
484 0.18
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.13
489 0.12
490 0.12
491 0.13
492 0.12
493 0.12
494 0.13
495 0.13
496 0.18
497 0.19
498 0.2
499 0.21
500 0.19
501 0.18
502 0.17
503 0.17
504 0.13
505 0.13
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.14
510 0.15
511 0.18
512 0.2
513 0.22
514 0.29
515 0.27
516 0.31
517 0.38
518 0.39
519 0.37
520 0.38
521 0.39
522 0.31
523 0.3
524 0.27
525 0.21
526 0.2
527 0.18
528 0.14
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.08
536 0.06
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.03
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.08
551 0.09
552 0.1
553 0.13
554 0.14
555 0.14
556 0.14
557 0.14
558 0.14
559 0.15
560 0.18