Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DB26

Protein Details
Accession S3DB26    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-38VAGPSQHKQPSRKGRKAWRKNVDVSEVEHydrophilic
288-313EVTTAKRPKRKTPAQRNKINRRKEAEHydrophilic
411-444RSMVVRGKVEARKRRPFRKQPKVKITEKWAHKDFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-29QPSRKGRKAWR
293-326KRPKRKTPAQRNKINRRKEAEAKKRHDAIAEHKK
417-434GKVEARKRRPFRKQPKVK
Subcellular Location(s) mito 10.5, nucl 10, cyto_mito 9, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MPVIGAKSGSVAGPSQHKQPSRKGRKAWRKNVDVSEVEKGLEERNDQIIKGGLVKEQESDQLFQVEDTGDLEVAKKLSKKFTKGLKADEILAQRSAVPAVSARKRKGEGKTTDGVLETKRVRKDYISHKELVRLRQMADGHHESTVEVNDASFDPWAVTDTSVVLSNSERSFSFLPKPRAPKAPVTMAHAPISLAANGKPIPAVAKPKADMSYNPSFEAYEARLTEEGAKAVEAERKRLAGEEAERVRMEGVARSAAEADAAAERELLSEWEEDSAWEGFQSGLENEEVTTAKRPKRKTPAQRNKINRRKEAEAKKRHDAIAEHKKEQTKHLAKLLAEDKFKHEQALALAAAESSSGESDDEEGDDNVLRRRQLGKFHLPERDLELVLPDELQGSLRLLKPEGNLLQDRYRSMVVRGKVEARKRRPFRKQPKVKITEKWAHKDFQLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.3
3 0.37
4 0.44
5 0.48
6 0.58
7 0.66
8 0.69
9 0.76
10 0.79
11 0.82
12 0.87
13 0.92
14 0.93
15 0.92
16 0.89
17 0.88
18 0.85
19 0.81
20 0.74
21 0.67
22 0.62
23 0.52
24 0.43
25 0.35
26 0.29
27 0.26
28 0.24
29 0.22
30 0.19
31 0.25
32 0.26
33 0.25
34 0.26
35 0.24
36 0.22
37 0.24
38 0.23
39 0.18
40 0.19
41 0.2
42 0.2
43 0.19
44 0.23
45 0.21
46 0.22
47 0.21
48 0.2
49 0.2
50 0.18
51 0.18
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.12
62 0.16
63 0.19
64 0.28
65 0.35
66 0.4
67 0.46
68 0.55
69 0.62
70 0.63
71 0.67
72 0.64
73 0.59
74 0.55
75 0.53
76 0.47
77 0.38
78 0.34
79 0.27
80 0.2
81 0.19
82 0.17
83 0.12
84 0.09
85 0.1
86 0.17
87 0.25
88 0.32
89 0.35
90 0.4
91 0.44
92 0.5
93 0.55
94 0.57
95 0.55
96 0.54
97 0.56
98 0.51
99 0.49
100 0.43
101 0.36
102 0.27
103 0.28
104 0.26
105 0.28
106 0.31
107 0.32
108 0.32
109 0.34
110 0.41
111 0.45
112 0.51
113 0.5
114 0.5
115 0.49
116 0.55
117 0.56
118 0.53
119 0.49
120 0.4
121 0.37
122 0.37
123 0.37
124 0.31
125 0.33
126 0.32
127 0.26
128 0.25
129 0.24
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.12
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.16
160 0.24
161 0.28
162 0.35
163 0.4
164 0.46
165 0.47
166 0.53
167 0.53
168 0.52
169 0.48
170 0.49
171 0.45
172 0.46
173 0.45
174 0.4
175 0.37
176 0.31
177 0.26
178 0.2
179 0.19
180 0.13
181 0.1
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.16
191 0.16
192 0.19
193 0.19
194 0.21
195 0.23
196 0.22
197 0.21
198 0.22
199 0.27
200 0.25
201 0.25
202 0.23
203 0.22
204 0.21
205 0.22
206 0.16
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.12
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.13
228 0.15
229 0.2
230 0.2
231 0.22
232 0.21
233 0.21
234 0.2
235 0.18
236 0.16
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.14
278 0.19
279 0.25
280 0.31
281 0.35
282 0.43
283 0.53
284 0.63
285 0.68
286 0.74
287 0.8
288 0.84
289 0.89
290 0.91
291 0.92
292 0.9
293 0.88
294 0.84
295 0.79
296 0.77
297 0.77
298 0.77
299 0.77
300 0.78
301 0.76
302 0.76
303 0.73
304 0.67
305 0.6
306 0.53
307 0.52
308 0.53
309 0.52
310 0.47
311 0.48
312 0.52
313 0.49
314 0.51
315 0.52
316 0.48
317 0.46
318 0.49
319 0.49
320 0.44
321 0.5
322 0.51
323 0.45
324 0.4
325 0.37
326 0.37
327 0.38
328 0.38
329 0.32
330 0.27
331 0.23
332 0.22
333 0.24
334 0.18
335 0.13
336 0.13
337 0.11
338 0.11
339 0.09
340 0.08
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.12
354 0.15
355 0.17
356 0.17
357 0.19
358 0.25
359 0.28
360 0.36
361 0.43
362 0.49
363 0.54
364 0.6
365 0.64
366 0.59
367 0.57
368 0.54
369 0.49
370 0.39
371 0.31
372 0.27
373 0.21
374 0.2
375 0.18
376 0.12
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.08
381 0.09
382 0.12
383 0.15
384 0.17
385 0.17
386 0.2
387 0.21
388 0.27
389 0.28
390 0.3
391 0.31
392 0.34
393 0.39
394 0.39
395 0.39
396 0.35
397 0.35
398 0.3
399 0.32
400 0.35
401 0.33
402 0.35
403 0.38
404 0.43
405 0.48
406 0.56
407 0.62
408 0.64
409 0.72
410 0.77
411 0.84
412 0.87
413 0.91
414 0.92
415 0.93
416 0.94
417 0.94
418 0.96
419 0.94
420 0.9
421 0.88
422 0.87
423 0.85
424 0.83
425 0.81
426 0.75
427 0.69