Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CIH1

Protein Details
Accession S3CIH1    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
322-345YKTESEKNKYKQNKYKRQKDIEDIHydrophilic
802-823APTHPDKKRRLGAPYVKRKWTQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 25, mito_nucl 13.833, cyto_mito 13.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MFVCRACVKRWRGPAPQLLFAGRHAAVARVPTAPSTAVLTTSRRARTVTTFTAARANIPKDTGETPLSLDERLRSFSAQEPDALEGSVAGGAEGEEGVEEKWRKDVMSKDELSAEMSLKDDEYLDRLDMLESGQKNMKQMEARVRRRYKFLNDEYTIAETVTQMLDSERYDEALYLTRLASKDFEVPVSWNHLIKFLFRQGRTNSAVKLYHEMKKRGQTPNVRTYTTIFTGCAQTVDKSPEQALLVATKIYYGMLSDARLRPNTIHMNSVLSVCARAKDIQAVFNIAKTANTNTRMPDCTTYTTILSAMRAATESPYDTKGYKTESEKNKYKQNKYKRQKDIEDIGDPTLEKPFITIRRARATWEEVVLNWRRGFLLMDERLVCSMGRILLLGSVADNSSILALLHQTMGIPRLDKGVNGTPSAERTKLLAKPAAQVGESGSHPELASPQEQTGAPAKSAADEAAIEQISAGSDTVQIEPNLGRPAHTEDGADLLTAALQSQNSQADAGIEVFKKAELRPKQVAQFTAIDPYDDEHYYKAFVPKSSDVSLLQPKPSHNTLSLLLAAIGGSRKTTLALPYWKLMTSSDKYCIVPDIENCHQLLRTIKRGRSSTEAVEALLILPKFAYIGKTFKLAMEVCTYNTLNPNAFKSAGKIVDLMNQTAIMPDASTLRLYLKVALTSNQHFKEAKTPEEAAVKKEEFGKQIVRALQRLWDPVRILGNGIQAMEKAAASTTNIVHEDKHAPTPKSMQLEYIDLLKLMVSAADMVVSEKMADEATIKDMSISRNLLNRQVTRYYEGRSPLAPTHPDKKRRLGAPYVKRKWTQEEVDRSISRNWVPKTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.75
3 0.73
4 0.66
5 0.59
6 0.51
7 0.43
8 0.4
9 0.3
10 0.27
11 0.21
12 0.2
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.17
23 0.16
24 0.17
25 0.19
26 0.21
27 0.25
28 0.32
29 0.35
30 0.33
31 0.34
32 0.35
33 0.4
34 0.44
35 0.44
36 0.41
37 0.4
38 0.39
39 0.44
40 0.4
41 0.38
42 0.37
43 0.35
44 0.32
45 0.32
46 0.32
47 0.29
48 0.3
49 0.29
50 0.24
51 0.22
52 0.21
53 0.25
54 0.25
55 0.22
56 0.22
57 0.22
58 0.22
59 0.25
60 0.25
61 0.21
62 0.22
63 0.28
64 0.32
65 0.29
66 0.29
67 0.27
68 0.28
69 0.27
70 0.25
71 0.18
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.08
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.05
81 0.04
82 0.03
83 0.04
84 0.05
85 0.11
86 0.13
87 0.13
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.24
92 0.31
93 0.33
94 0.41
95 0.42
96 0.4
97 0.41
98 0.41
99 0.37
100 0.31
101 0.24
102 0.15
103 0.15
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.15
118 0.14
119 0.17
120 0.21
121 0.22
122 0.24
123 0.25
124 0.29
125 0.26
126 0.31
127 0.39
128 0.45
129 0.53
130 0.61
131 0.69
132 0.67
133 0.71
134 0.73
135 0.72
136 0.71
137 0.7
138 0.69
139 0.62
140 0.61
141 0.57
142 0.52
143 0.43
144 0.32
145 0.24
146 0.14
147 0.13
148 0.11
149 0.09
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.08
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.14
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.14
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.17
173 0.18
174 0.18
175 0.24
176 0.24
177 0.21
178 0.21
179 0.24
180 0.23
181 0.24
182 0.27
183 0.28
184 0.34
185 0.33
186 0.4
187 0.38
188 0.45
189 0.48
190 0.46
191 0.39
192 0.37
193 0.38
194 0.33
195 0.37
196 0.34
197 0.36
198 0.41
199 0.44
200 0.45
201 0.51
202 0.57
203 0.58
204 0.62
205 0.65
206 0.66
207 0.72
208 0.7
209 0.63
210 0.56
211 0.51
212 0.48
213 0.4
214 0.33
215 0.23
216 0.2
217 0.21
218 0.2
219 0.19
220 0.15
221 0.13
222 0.15
223 0.2
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.18
230 0.16
231 0.12
232 0.12
233 0.1
234 0.09
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.04
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.13
244 0.16
245 0.19
246 0.2
247 0.21
248 0.2
249 0.26
250 0.32
251 0.29
252 0.28
253 0.25
254 0.27
255 0.27
256 0.26
257 0.2
258 0.12
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.17
266 0.17
267 0.19
268 0.19
269 0.22
270 0.2
271 0.2
272 0.2
273 0.14
274 0.13
275 0.12
276 0.15
277 0.17
278 0.2
279 0.2
280 0.22
281 0.25
282 0.27
283 0.28
284 0.28
285 0.25
286 0.26
287 0.26
288 0.26
289 0.22
290 0.2
291 0.19
292 0.16
293 0.14
294 0.11
295 0.09
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.17
309 0.21
310 0.24
311 0.31
312 0.39
313 0.47
314 0.54
315 0.57
316 0.62
317 0.67
318 0.72
319 0.73
320 0.75
321 0.78
322 0.81
323 0.87
324 0.88
325 0.87
326 0.82
327 0.79
328 0.75
329 0.68
330 0.61
331 0.51
332 0.42
333 0.33
334 0.28
335 0.22
336 0.16
337 0.11
338 0.08
339 0.07
340 0.11
341 0.15
342 0.19
343 0.22
344 0.26
345 0.32
346 0.32
347 0.33
348 0.33
349 0.33
350 0.3
351 0.28
352 0.23
353 0.18
354 0.23
355 0.24
356 0.23
357 0.19
358 0.18
359 0.16
360 0.16
361 0.16
362 0.12
363 0.18
364 0.16
365 0.18
366 0.18
367 0.18
368 0.17
369 0.17
370 0.15
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.12
404 0.16
405 0.17
406 0.17
407 0.18
408 0.15
409 0.18
410 0.2
411 0.17
412 0.12
413 0.12
414 0.16
415 0.17
416 0.2
417 0.2
418 0.19
419 0.2
420 0.22
421 0.21
422 0.17
423 0.15
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.1
438 0.1
439 0.11
440 0.15
441 0.14
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.12
446 0.12
447 0.1
448 0.06
449 0.05
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.03
460 0.04
461 0.05
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.11
468 0.13
469 0.12
470 0.11
471 0.12
472 0.17
473 0.18
474 0.18
475 0.16
476 0.13
477 0.15
478 0.14
479 0.12
480 0.07
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.09
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.1
502 0.11
503 0.19
504 0.21
505 0.28
506 0.33
507 0.37
508 0.42
509 0.43
510 0.43
511 0.37
512 0.35
513 0.29
514 0.28
515 0.24
516 0.19
517 0.16
518 0.16
519 0.16
520 0.14
521 0.14
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.13
526 0.17
527 0.16
528 0.17
529 0.21
530 0.23
531 0.27
532 0.27
533 0.27
534 0.23
535 0.26
536 0.32
537 0.29
538 0.3
539 0.28
540 0.27
541 0.31
542 0.32
543 0.3
544 0.23
545 0.24
546 0.22
547 0.22
548 0.21
549 0.16
550 0.14
551 0.11
552 0.1
553 0.08
554 0.07
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.07
560 0.08
561 0.1
562 0.15
563 0.2
564 0.22
565 0.23
566 0.24
567 0.24
568 0.23
569 0.22
570 0.23
571 0.22
572 0.23
573 0.25
574 0.26
575 0.26
576 0.26
577 0.27
578 0.22
579 0.2
580 0.2
581 0.24
582 0.24
583 0.26
584 0.26
585 0.24
586 0.22
587 0.22
588 0.27
589 0.25
590 0.32
591 0.37
592 0.4
593 0.46
594 0.48
595 0.5
596 0.49
597 0.48
598 0.4
599 0.38
600 0.36
601 0.29
602 0.27
603 0.23
604 0.17
605 0.16
606 0.13
607 0.08
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.08
612 0.1
613 0.09
614 0.13
615 0.14
616 0.17
617 0.18
618 0.17
619 0.21
620 0.2
621 0.19
622 0.21
623 0.21
624 0.19
625 0.23
626 0.23
627 0.2
628 0.23
629 0.23
630 0.21
631 0.22
632 0.23
633 0.22
634 0.23
635 0.22
636 0.21
637 0.25
638 0.23
639 0.22
640 0.21
641 0.19
642 0.24
643 0.25
644 0.23
645 0.17
646 0.16
647 0.15
648 0.14
649 0.14
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.07
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.09
658 0.11
659 0.12
660 0.14
661 0.14
662 0.16
663 0.17
664 0.2
665 0.23
666 0.26
667 0.34
668 0.32
669 0.34
670 0.32
671 0.33
672 0.39
673 0.38
674 0.36
675 0.33
676 0.34
677 0.33
678 0.41
679 0.41
680 0.35
681 0.38
682 0.35
683 0.31
684 0.35
685 0.35
686 0.29
687 0.32
688 0.34
689 0.3
690 0.34
691 0.39
692 0.37
693 0.35
694 0.34
695 0.35
696 0.33
697 0.37
698 0.34
699 0.32
700 0.3
701 0.31
702 0.34
703 0.29
704 0.28
705 0.25
706 0.26
707 0.22
708 0.21
709 0.18
710 0.15
711 0.15
712 0.14
713 0.11
714 0.08
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.11
719 0.11
720 0.14
721 0.16
722 0.16
723 0.17
724 0.2
725 0.24
726 0.24
727 0.32
728 0.36
729 0.36
730 0.39
731 0.44
732 0.46
733 0.47
734 0.45
735 0.4
736 0.35
737 0.36
738 0.34
739 0.31
740 0.25
741 0.19
742 0.18
743 0.14
744 0.12
745 0.08
746 0.08
747 0.05
748 0.05
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.06
753 0.07
754 0.07
755 0.06
756 0.06
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.07
761 0.08
762 0.12
763 0.12
764 0.12
765 0.13
766 0.16
767 0.18
768 0.21
769 0.23
770 0.23
771 0.29
772 0.32
773 0.37
774 0.42
775 0.44
776 0.44
777 0.47
778 0.48
779 0.47
780 0.48
781 0.45
782 0.43
783 0.43
784 0.41
785 0.36
786 0.37
787 0.36
788 0.39
789 0.41
790 0.42
791 0.48
792 0.55
793 0.63
794 0.65
795 0.7
796 0.72
797 0.73
798 0.74
799 0.74
800 0.76
801 0.77
802 0.82
803 0.81
804 0.8
805 0.79
806 0.77
807 0.74
808 0.72
809 0.71
810 0.69
811 0.71
812 0.69
813 0.73
814 0.69
815 0.64
816 0.58
817 0.54
818 0.5
819 0.48